অংশ Ⅱ কিডনি রেনাল ক্লিয়ার সেল কার্সিনোমার টিউমার মাইক্রোএনভায়রনমেন্টে জেনেটিক ডিসরেগুলেশনের বিপাকীয় বোঝাপড়া

ফলাফল

1. KIRC-তে ভিন্নভাবে প্রকাশ করা বিপাকীয় জিনের সনাক্তকরণ।

KIRC-তে বিপাকীয় ডিসরেগুলেশন অন্বেষণ করতে, আমরা ক্লিনিকে বিপাক-লক্ষ্যযুক্ত থেরাপিউটিকসের গভীর অন্তর্দৃষ্টি পেতে উপলব্ধ TCGA ডেটা অন্বেষণ করেছি। এই উদ্দেশ্যে, আমরা 1916 বিপাকীয় জিনের একটি সেট নির্বাচন করেছি যা দুটি ভিন্ন ডেটাসেট থেকে ছেদ করা হয়েছিল [16, 17] এবং টিউমার বনাম স্বাভাবিক টিস্যুতে 1100 টি ভিন্নভাবে প্রকাশিত জিনগুলি স্ক্রীন করা হয়েছিল (পরিপূরক সারণী 2)। এই ভিন্নভাবে প্রকাশিত বিপাকীয় জিনগুলি আগ্নেয়গিরি এবং তাপ মানচিত্রগুলিতে প্লট করা হয়েছিল (চিত্র 1(a) এবং 1(b))। 1100টি ভিন্নভাবে প্রকাশ করা বিপাকীয় জিনের মধ্যে, 78টি জিন আপ-নিয়ন্ত্রিত এবং 163টি জিনকে নিয়ন্ত্রিত করা হয়েছিল। অধিকন্তু, 859 টি জিন অপরিবর্তিত ছিল। তাপ মানচিত্র টিউমার এবং স্বাভাবিক নমুনাগুলিতে সেই ডিফারেনশিয়াল বিপাকীয় জিনের স্বতন্ত্র অভিব্যক্তি সূচকের প্রতিনিধিত্ব করে (চিত্র 1(বি))। এরপরে, আমরা শীর্ষ 10টি ভিন্নভাবে প্রকাশিত বিপাকীয় জিন চিহ্নিত করেছি; তাদের মধ্যে, ENPP3, NNMT, CYP2J2, SCD, এবং HK2 আপ-নিয়ন্ত্রিত করা হয়েছিল এবং HSD11B2, HMGCS2, HPD, HS6ST2 এবং ALDOB-কে নিয়ন্ত্রণ করা হয়েছিল। এই DEmG-এর বক্স প্লটগুলি চিত্র 1(c) এ দেখানো হয়েছে। আপ-রেগুলেটেড জিনগুলির মধ্যে, ENPP3 হল ~7-গুণ টিউমারে প্রকাশ করা হয়। বিকল্পভাবে, ALDOB জিন ~5-বিশ্লেষিত টিউমার নমুনায় ভাঁজ নিয়ন্ত্রিত।

উপরন্তু, আমরা DEmGs-এর KEGG পাথওয়ে এবং GO বিশ্লেষণগুলি মূল্যায়ন করেছি। KEGG পাথওয়ে বিশ্লেষণে দেখা গেছে যে আপ-নিয়ন্ত্রিত জিনগুলি কার্বন বিপাক, HIF1 সিগন্যালিং এবং গ্লাইকোলাইসিস/গ্লুকোনোজেনেসিসে উল্লেখযোগ্যভাবে সমৃদ্ধ হয়েছে একটি উচ্চতর জিন অনুপাত (প্রতিটি পথে 8-9 সংখ্যক জিন) (চিত্র 1(d))। একইভাবে, নিয়ন্ত্রিত ডিইএমজিগুলির মধ্যে, আমরা দেখতে পেয়েছি যে কার্বন বিপাক এবং ভ্যালাইন, লিউসিন এবং আইসোলিউসিনের অবক্ষয় বিপাকীয়ভাবে সক্রিয় জিন দ্বারা প্রভাবিত শীর্ষ পথ ছিল (চিত্র 1(ই))। পেরক্সিসোম অর্গানেল সম্পর্কিত পথগুলিও জিন টিউমার নমুনার একটি নিম্ন-নিয়ন্ত্রিত গোষ্ঠীতে উল্লেখযোগ্যভাবে সমৃদ্ধ হয়েছিল। লক্ষণীয়, আপ-নিয়ন্ত্রিত জিনগুলির সাথে তুলনা করে, নিম্ননিয়ন্ত্রিত জিনের সাথে জড়িত পথগুলির উচ্চতর উল্লেখযোগ্য p মান রয়েছে। এটি উল্লেখ করার মতো যে ডাউনরেগুলেটেড জিন বিভাগে সমৃদ্ধ বেশিরভাগ কেইজিজি পথগুলি অ্যামিনো অ্যাসিড বিপাকের সাথে সম্পর্কিত ছিল। টিউমারিজেনেসিসে DEmG-এর সম্পৃক্ততাকে আরও বিচ্ছিন্ন করার জন্য, আপ-রেগুলেটেড এবং ডাউনরেগুলেটেড জিনের জিও কার্যকরী বিশ্লেষণ করা হয়েছিল। আমরা জিও অন্টোলজিকে তিনটি কার্যকরী সাবন্টোলজি গ্রুপে বিভক্ত করেছি, বিপি (জৈবিক প্রক্রিয়া), সিসি (সেলুলার উপাদান), এবং এমএফ (আণবিক ফাংশন) (চিত্র 1(এফ) এবং 1(জি))। এছাড়াও, GSEA বিশ্লেষণে বেনপোরাথ_MYC_টার্গেটস_ওয়াইথ_ইবক্সের সাথে সম্পর্কিত জিন সমৃদ্ধকরণে উল্লেখযোগ্য বৃদ্ধি পাওয়া গেছে, যখন ব্রাউন{11} } মাইলয়েড_কোষ_ডেভেলপমেন্ট_আপ, কেইজিজি{{15}আলফা_ লিনোলেনিক_এসিড_মেটাবোলিজম, এবং কেইজিজি{ {19}}ইথার_ লিপিড_মেটাবোলিজম নেতিবাচকভাবে সমৃদ্ধ হতে দেখা গেছে৷ পরবর্তী পর্যায়ে, আমরা একটি প্রোটিন-প্রোটিন মিথস্ক্রিয়া পিপিআই নেটওয়ার্ক তৈরি করেছি আপ এবং ডাউন রেগুলেটেড ডিইএমজি সহ। বেশ কয়েকটি জিন একে অপরের সাথে মিথস্ক্রিয়া দেখায়। এই জিনগুলির মিথস্ক্রিয়াগুলির মাধ্যমে, আমরা হাব জিনগুলিকে বিচ্ছিন্ন করেছি। প্রতিটি নোড ডিগ্রী মানের উপর ভিত্তি করে অন্য থেকে পৃথক; আরও, আমরা পিপিআই-এর জন্য শীর্ষ 7 হাব জিনকে বিচ্ছিন্ন করেছি। আমরা টিসিজিএ ডেটাসেটে এই হাব জিন এক্সপ্রেশন এবং KIRC-এর ক্লিনিকোপ্যাথলজিকাল বৈশিষ্ট্যগুলির মধ্যে পারস্পরিক সম্পর্কও অন্বেষণ করেছি।

জানতে এখানে ক্লিক করুনCistanche সুবিধা কি.

2. নেটওয়ার্ক বিশ্লেষণ বিভিন্ন টিউমার অনটোলজিতে মৌলিক বিপাকীয় পরিবর্তনগুলি প্রকাশ করে।

এরপরে, DEmGs-এর এক্সপ্রেশন ডেটা নির্বাচন করা হয়েছিল এবং WGCNA-এর জন্য ইনপুট ডেটা হিসাবে ব্যবহার করা হয়েছিল, যা প্রতিটি মডিউলের জন্য আলাদা সংখ্যক জিন ধারণকারী 6টি স্বতন্ত্র সহ-এক্সপ্রেশন মডিউল চিহ্নিত করেছে (চিত্র 2(a))। আমরা বাহ্যিক বৈশিষ্ট্যগুলির সাথে ডিফারেনশিয়াল জিনগুলিকে সংযুক্ত করেছি এবং ক্লিনিকাল বৈশিষ্ট্যগুলির সাথে উল্লেখযোগ্যভাবে যুক্ত মডিউলগুলি চিহ্নিত করেছি (চিত্র 2(বি))৷ পারস্পরিক সম্পর্ক সহগের উপর ভিত্তি করে, আমরা দেখতে পেয়েছি যে MEturquoise মডিউলগুলি বেঁচে থাকার অবস্থার সাথে নেতিবাচকভাবে সম্পর্কযুক্ত ছিল। GO এবং KEGG পাথওয়ে সমৃদ্ধকরণ বিশ্লেষণগুলি এই মডিউলগুলি থেকে জিন ব্যবহার করে সঞ্চালিত হয়েছিল (চিত্র 2(c) এবং 2(d))। সবচেয়ে সমৃদ্ধ KEGG পথগুলি হল ভ্যালাইন, লিউসিন এবং আইসোলিউসিনের অবক্ষয়; কার্বন বিপাক; propanoate বিপাক; ফ্যাটি অ্যাসিড বিপাক; ফ্যাটি অ্যাসিডের অবক্ষয়; peroxisome এবং butanoate বিপাক; glyoxylate এবং dicarboxylate বিপাক; এবং ট্রিপটোফান বিপাক (চিত্র 2(c))। বিপি পদের সাথে সম্পর্কিত জিনগুলি প্রধানত ছোট অণু, কার্বক্সিলিক অ্যাসিড এবং জৈব অ্যাসিড ক্যাটাবলিক প্রক্রিয়াগুলিতে সমৃদ্ধ হয়েছিল। সিসি পদের সাথে সম্পর্কিত জিনগুলি মূলত মাইটোকন্ড্রিয়াল ম্যাট্রিক্সে সমৃদ্ধ হয়েছিল। এমএফ সম্পর্কিত ভিন্নভাবে প্রকাশিত জিনগুলি মূলত কোএনজাইম বাইন্ডিংয়ে সমৃদ্ধ হয়েছিল (চিত্র 2(ডি))। এছাড়াও, আমরা বেঁচে থাকার মডিউলে 8 টি জিনের একটি বেঁচে থাকার বিশ্লেষণ করেছি। উচ্চতর ACADSB, PANK1, SLC25A4, PCCA, HADH, AUH, ACAT1 এবং ALDH6A1 এক্সপ্রেশনের রোগীদের এই জিনগুলির কম অভিব্যক্তি (p=0) (চিত্র 2(e)–2(এর তুলনায় বেশি বেঁচে থাকার হার ছিল) l))।

3. KIRC রোগীদের ক্লাস্টারিং।

আমরা ক্লাস্টার বিশ্লেষণের জন্য শীর্ষ DEmGs নির্বাচন করেছি; KIRC রোগীদের বিপাকীয় জিনের ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশনের উপর ভিত্তি করে তিনটি ক্লাস্টারে বিভক্ত করা হয়েছিল। চিত্র 3(a) KIRC রোগীদের DEmG-এর তাপ মানচিত্র দেখায়। রঙের স্কেল অভিব্যক্তি মান নির্দেশ করে (হালকা নীল একটি নিম্ন অভিব্যক্তি মান নির্দেশ করে; গাঢ় নীল উচ্চতর জিনের অভিব্যক্তি মান নির্দেশ করে)।

KM কার্ভগুলি KIRC রোগীদের জন্য তিনটি ক্লাস্টারের সামগ্রিক বেঁচে থাকার তুলনা করার জন্য পরিকল্পনা করা হয়েছিল। সামগ্রিকভাবে বেঁচে থাকার হার তিনটি ক্লাস্টার জুড়ে উল্লেখযোগ্যভাবে পৃথক (p < {{0}}:01 চিত্র 3(b))। ক্লাস্টার 1 ক্লাস্টার 2 এবং ক্লাস্টার 3 এর তুলনায় আরও খারাপ বেঁচে থাকার হার দেখিয়েছে। PFS বেঁচে থাকার হারও 3 টি ক্লাস্টারের মধ্যে উল্লেখযোগ্যভাবে পৃথক ছিল (p <0:001, চিত্র 3(c)), এবং ক্লাস্টার 1 তুলনামূলকভাবে খারাপ PFS বেঁচে থাকার হার প্রদর্শন করেছে। ক্লাস্টার 2 এবং ক্লাস্টার 3 সহ।

আমাদের মডেলের বিভিন্ন রঙ ক্লিনিকাল পরামিতি এবং অন্তর্নিহিত প্যাথলজিকাল পর্যায়গুলিকে প্রতিনিধিত্ব করে (চিত্র 3(ডি))। ক্লাস্টার 1 এবং 2-এর তুলনায় ক্লাস্টার 3-এর কম Mo অনুপাত এবং উচ্চ M1 মান রয়েছে ক্লাস্টার 1 এবং 2-এর তুলনায় ক্লাস্টার 3-এ উচ্চতর ক্যান্সার মেটাস্ট্যাসিস এবং টিউমারগুলির আরও উন্নত স্তরের পরামর্শ দেয়। একইভাবে, ক্লাস্টার 3-এ, ক্যান্সার লিম্ফ নোডগুলিতে আরও বেশি ছড়িয়ে পড়েছে (উচ্চ N1) ক্লাস্টার 1 এবং 2-এর তুলনায়। KIRC রোগীদের বেশিরভাগই III এবং IV (চিত্র 3(e) এবং 3(f)) পর্যায়ে নির্ণয় করা হয়েছিল, যা বৃহত্তর বা প্রসারিত টিউমারের পরামর্শ দেয়, সেইসাথে এর মধ্য দিয়ে যাওয়ার পরামর্শ দেয়। শরীরের একটি দূরবর্তী অঞ্চলে রক্ত ​​বা লিম্ফ্যাটিক সিস্টেম।

4. তিনটি ক্লাস্টারের ইমিউন স্ট্যাটাস।

আমরা তাদের বিপাকীয় ট্রান্সক্রিপশনাল প্রোফাইলের উপর ভিত্তি করে KIRC টিস্যুগুলির একটি সিরিজের স্ট্রোমাল এবং ইমিউন স্কোর অনুমান করতে ESTIMATE অ্যালগরিদম ব্যবহার করেছি (চিত্র 4(a))৷ পরে, এই স্কোরগুলি কেআইআরসি-তে প্রাগনোসিস স্তরবিন্যাসের জন্য স্ট্রোমাল-ইমিউন স্কোর-ভিত্তিক বিপাকীয় জিন স্বাক্ষর বিকাশের জন্য বিবেচনা করা হয়েছিল। চিত্র 4(a) তে দেখানো হয়েছে, তিনটি ক্লাস্টার গ্রুপ (C1, C2, এবং C3) তাদের স্ট্রোমাল-ইমিউন স্কোরের উপর ভিত্তি করে বক্স প্লটে স্তরিত করা হয়েছিল। তিনটি ক্লাস্টারের মধ্যে, সি 1 স্ট্রোমাল এবং ইমিউন উভয় শ্রেণিবিন্যাসে একটি উচ্চতর উল্লেখযোগ্য স্কোর দেখিয়েছে।

অধিকন্তু, তিনটি ক্লাস্টার CIBERSORT দ্বারা একটি p-মান < 0.1 (চিত্র 4(b)) সহ বিশ্লেষণ করা হয়েছিল। টিউমার বিশুদ্ধতা, ইমিউন স্কোর, এবং স্ট্রোমাল স্কোর সহ 3 টি ক্লাস্টারের প্যাথলজিকাল ধাপগুলি তাপ মানচিত্রের শীর্ষে দেখানো হয়েছে। এই বিশ্লেষণে, আমরা প্রধানত দেখতে পেয়েছি যে নিয়ন্ত্রক টি কোষগুলি (ট্রেগস) ক্লাস্টার সি 1-এ সমৃদ্ধ হয়েছিল এবং সি 1-এর রোগীরা মূলত প্যাথলজিকাল পর্যায়ে III এবং IV এ ছিল। অধিকন্তু, C1 ক্লাস্টারে সক্রিয় NK কোষ, CD8 প্লাস T কোষ, T ফলিকুলার সহায়ক কোষ এবং M0 ম্যাক্রোফেজ; C2 ক্লাস্টারে CD8 প্লাস টি কোষ এবং টি ফলিকুলার হেল্পার সেল; এবং C3 ক্লাস্টারে বিশ্রামের মাস্ট কোষ, M2 ম্যাক্রোফেজ, বিশ্রামের মেমরি CD4 T কোষ, মনোসাইট, নিষ্পাপ বি কোষ এবং M1 ম্যাক্রোফেজগুলিও সনাক্ত করা হয়েছিল (চিত্র 4(b))।

CIBERSORT ছাড়াও, আমরা অনাক্রম্য অনুপ্রবেশের অবস্থা পরীক্ষা করার জন্য অন্যান্য অ্যালগরিদমিক প্যাকেজ নিযুক্ত করেছি। MCP বিশ্লেষণের ক্রমিক তাপ মানচিত্র চিত্র 4(c) এ দেখানো হয়েছে। MCP বিশ্লেষণের মূল অনুসন্ধানগুলি ক্লাস্টার C3-তে নিউট্রোফিল অনুপ্রবেশ এবং এন্ডোথেলিয়াল কোষের অনুপ্রবেশ যা ক্লাস্টার C1-এ অনুপস্থিত ছিল। এই বিশ্লেষণটি এনকে সেল, মনোসাইটিক বংশ এবং ক্লাস্টার C3-তে মাইলয়েড ডেনড্রাইটিক কোষের অনুপ্রবেশও প্রকাশ করেছে। অন্যান্য ইমিউন সেল জনসংখ্যা তিনটি বিশ্লেষণ করা ক্লাস্টারে মিশ্রিত হয়েছিল (চিত্র 4(সি))।

CIBERSORT এবং MCP বিশ্লেষণের পরিপূরক করার জন্য, আমরা R প্যাকেজ GSVA-তে বাস্তবায়িত ইমিউন কোষের প্রকারের জন্য অনুপ্রবেশের মাত্রা পরিমাপ করতে ssGSEA প্রয়োগ করেছি। তিনটি ক্লাস্টারের ডেটা ssGSEA প্যাকেজে খাওয়ানো হয়েছিল এবং KIRC নমুনাগুলিতে 28 টি ইমিউন-সম্পর্কিত কোষ এবং প্রকারের সমৃদ্ধি অর্জন করেছিল। ফলাফলে জানা যায় যে C1 এবং C2 এর প্রতিরোধ ক্ষমতা বেশি ছিল; এনকে, নিউট্রোফিলস এবং ইওসিনোফিলস সহ কিছু সহজাত ইমিউন কোষ 3 টি ক্লাস্টারে মিশ্রিত হয়েছিল (চিত্র 4(ডি))।

5. DEmGs এর উপর ভিত্তি করে ভবিষ্যদ্বাণী মডেলের নির্মাণ এবং বৈধতা।

অবশেষে, আমরা বিপাকীয় জিনের ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশনের উপর ভিত্তি করে ভবিষ্যদ্বাণী মডেলটি তৈরি এবং বৈধ করেছি। আমরা সামগ্রিক বেঁচে থাকার উপর ভিত্তি করে DEmGs-এর ইমিউন-সম্পর্কিত ঝুঁকির স্কোর গণনা করেছি। এই উদ্দেশ্যে, আমরা ঝুঁকি স্কোরের পারস্পরিক সম্পর্ক মূল্যায়নের জন্য দুটি গ্রুপ তৈরি করেছি; একটি ট্রেনিং কোহর্টের জন্য এবং অন্যটি টেস্টিং কোহর্টের জন্য। আমরা দেখেছি যে সামগ্রিকভাবে বেঁচে থাকা কম এবং ঝুঁকির স্কোর জুড়ে ছড়িয়ে ছিটিয়ে ছিল (চিত্র 5(a) এবং 5(b))। এরপরে, মধ্যবর্তী ঝুঁকির স্কোরের উপর ভিত্তি করে, আমরা আরও মূল্যায়নের জন্য KIRC রোগীদের উচ্চ- এবং নিম্ন-ঝুঁকির গোষ্ঠীগুলিতে নিয়োগ করি। তারপরে আমরা প্রশিক্ষণ এবং পরীক্ষার সমষ্টিতে এই দুটি ঝুঁকি গোষ্ঠীর একটি বেঁচে থাকার বিশ্লেষণ করেছি। প্রত্যাশিত হিসাবে, কম-ঝুঁকির গোষ্ঠীগুলির তুলনায় উচ্চ-ঝুঁকির গোষ্ঠীগুলির একটি কম বেঁচে থাকার প্রমাণ পাওয়া গেছে (চিত্র 5(c) এবং 5(d))৷ তদ্ব্যতীত, ROC বক্ররেখা বিশ্লেষণ প্রশিক্ষণ এবং পরীক্ষার সমষ্টির জন্য সম্পাদিত হয়েছিল। আমরা 5 বছরে 5 বছরে 0.68 এর একটি ROC স্কোর পর্যবেক্ষণ করেছি, যা KIRC (চিত্র 5(e) এবং 5(f)) এর পূর্বাভাস দেওয়ার ক্ষেত্রে ভাল কার্যকারিতা নির্দেশ করে। ROC বক্ররেখা বিশ্লেষণের পাশাপাশি, আমরা আংশিক সম্ভাবনা বিচ্যুতি (পরিপূরক চিত্র 5(a)) এবং DEmGs (পরিপূরক চিত্র 5(b)) এর রিগ্রেশন সহগ দ্বারা নির্দেশিত আমাদের প্রগনোস্টিক মডেলকে বৈধ করার জন্য LASSO COX রিগ্রেশন মডেলটিও কার্যকর করেছি। অবশেষে, পাঁচটি জিন (ABCG1, CRYL1, FDX1, PANK1, এবং SLC44A) HR < 1 (পরিপূরক চিত্র 5(c)) এর সাথে সম্ভাব্য প্রগনোস্টিক কারণ হিসাবে ভবিষ্যদ্বাণী করা হয়েছিল।

6. KIRC অগ্রগতির অন্তর্নিহিত প্রক্রিয়া।

KIRC অগ্রগতির জন্য অন্তর্নিহিত প্রক্রিয়াটি আরও তদন্ত করার জন্য, আমরা সমস্ত ক্লাস্টারের মধ্যে ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণ পরিচালনা করেছি এবং ফলাফলগুলি কল্পনা করার জন্য একটি তাপ মানচিত্র প্লট ব্যবহার করেছি (চিত্র 6(ক))। ডিইএমজিগুলির সংকেত পথগুলি সনাক্ত করতে, আমরা তিনটি ক্লাস্টারে ডিইজিগুলির কেইজিজি এবং জিও সমৃদ্ধকরণ বিশ্লেষণ করেছি। সংক্ষেপে, এই ফলাফলগুলি প্রকাশ করেছে যে তিনটি ক্লাস্টারের ডিইজিগুলি মূলত ফোকাল আনুগত্য, ফক্সো সিগন্যালিং পাথওয়ে এবং ক্লাস্টার C3 এবং খনিজ শোষণের জন্য অ্যাপলিন সিগন্যালিং পথ, নিউট্রোফিল এক্সট্রা সেলুলার ফাঁদ গঠন, এবং স্টাফিলোকক্কাস অরিয়াস সংক্রমণে সমৃদ্ধ হয়েছিল (ক্লাস্টার C26 এর জন্য (খ))। এছাড়াও, ডিইজিগুলির GO কার্যকরী বিশ্লেষণ চিত্র 6(c) এ দেখানো MF-, CC-, এবং BP- সম্পর্কিত অনটোলজিগুলিকে উন্মোচিত করেছে। মজার বিষয় হল, ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণ তিনটি ক্লাস্টারে জিনের নিয়ন্ত্রণের অস্বাভাবিক আচরণ প্রকাশ করেছে। বেশিরভাগ ক্ষেত্রে, এনইউডিটি 1 সি 1-এ অত্যন্ত প্রকাশ করা হয়েছিল, যার বেঁচে থাকা সবচেয়ে খারাপ ছিল। আরও তদন্তে দেখা গেছে যে C1 থেকে C3 (চিত্র 6(d)) পর্যন্ত অগ্রগতির মাধ্যমে NUDT1 এক্সপ্রেশন উল্লেখযোগ্যভাবে হ্রাস পেয়েছে। অধিকন্তু, KIRC টিউমার নমুনাগুলিতে NUDT1 আপ-নিয়ন্ত্রিত পাওয়া গেছে (চিত্র 6(e))। এরপরে, আমরা প্রতিটি টিউমারের পর্যায়ে NUDT1 এক্সপ্রেশন হাইলাইট করেছি (চিত্র 6(f))। সামগ্রিকভাবে বেঁচে থাকার বিশ্লেষণও কাপলান-মেইয়ার প্লটার দ্বারা সম্পাদিত হয়েছিল, এবং আমরা দেখতে পেয়েছি যে NUDT1 এর উচ্চতর অভিব্যক্তি সহ রোগীদের সামগ্রিকভাবে বেঁচে থাকার অবস্থা আরও খারাপ ছিল (HR=1:82 (1.34–2.48), লগ-র্যাঙ্ক p {{27} }:00012) (চিত্র 6(ছ))।

অবশেষে, আমরা NUDT1 এর সাথে মিথস্ক্রিয়াকারী জিনের জন্য KEGG এবং GO কার্যকরী সমৃদ্ধকরণ বিশ্লেষণ করেছি। জিন দুটি গ্রুপে বিভক্ত ছিল - ইতিবাচকভাবে NUDT1 এর সাথে সম্পর্কযুক্ত এবং নেতিবাচকভাবে NUDT1 এর সাথে সম্পর্কযুক্ত। কেইজিজি পাথওয়ে বিশ্লেষণে দেখা গেছে যে ইতিবাচকভাবে সম্পর্কযুক্ত জিনগুলি মূলত রাইবোসোমাল পাথওয়ে, হান্টিংটন ডিজিজ, অ্যামিয়োট্রফিক ল্যাটারাল স্ক্লেরোসিস এবং আলঝাইমার রোগে সমৃদ্ধ হয়েছিল। অন্যদিকে, নেতিবাচকভাবে সম্পর্কযুক্ত জিনগুলি প্রধানত হেপাটাইটিস বি এবং ফক্সো সিগন্যালিং (চিত্র 6(এইচ)) এ সমৃদ্ধ হয়েছিল। তদুপরি, ইতিবাচক এবং নেতিবাচকভাবে সম্পর্কযুক্ত জিনের জন্য তিনটি ভিন্ন গ্রুপ এমএফ, সিসি এবং বিপির জিও অন্টোলজি চিত্র 6(i) এ দেখানো হয়েছিল। উপরন্তু, আমরা দেখতে পেয়েছি যে NUDT1 এর অভিব্যক্তিটি ইমিউন কোষের অনুপ্রবেশের সাথে অত্যন্ত সম্পর্কযুক্ত ছিল (পরিপূরক চিত্র 6) এবং KIRC রোগীদের বিভিন্ন ক্লিনিকাল বৈশিষ্ট্য (সারণী 1)।

Cistanche সম্পূরক

7. NUDT1 এর ক্ষতি রেনাল ক্যান্সার কোষের বিস্তার এবং স্থানান্তরকে বাধা দেয়।

এরপরে, আমরা KIRC টিস্যুতে NUDTI-এর এক্সপ্রেশন লেভেল এবং তাদের সম্পর্কিত স্বাভাবিক টিস্যুতে তুলনা করেছি, যা প্রকাশ করেছে যে NUDT1 কেআইআরসি টিস্যুতে (চিত্র 7(a)) অত্যন্ত প্রকাশ করা হয়েছে। তদ্ব্যতীত, আমরা siRNA- মধ্যস্থতা বাধা ব্যবহার করে রেনাল ক্যান্সার সেল লাইনে NUDT1 ক্ষতির প্রভাবগুলি নির্ধারণ করেছি। NUDT1 দুটি সেল লাইনে siRNA নকডাউনের জন্য লক্ষ্য করা হয়েছিল 786-O এবং ACHN এবং NUDT1 mRNA স্তরগুলি সফলভাবে বাধা দেওয়া হয়েছিল যেমন qPCR বিশ্লেষণ দ্বারা প্রমাণিত হয়েছে (চিত্র 7(b))৷ NUDT1-এর siRNA-মধ্যস্থিত নকডাউনের পরে, কোষের কার্যকারিতা পরীক্ষা উভয় সেল লাইনে (চিত্র 7(c) এবং 7(d)) ​​কোষের কার্যক্ষমতা হ্রাস করেছে। পরবর্তীতে, NUDT1 এর নকডাউনে সেল মাইগ্রেশন অ্যাসে NUDT1-ক্ষয়প্রাপ্ত 786-O এবং ACHN কোষে (চিত্র 7(e) এবং 7(f)) উল্লেখযোগ্যভাবে কমে যাওয়া সেল মাইগ্রেশন দেখায়। 786- O কোষের স্থানান্তর ক্ষমতা প্রায় 50 শতাংশে হ্রাস পেয়েছে, এবং NUDT1 নকডাউন (চিত্র 7(f)) এ ACHN কোষগুলিতে 70 শতাংশ হ্রাস লক্ষ্য করা গেছে। NUDT1 জিনটি ছিটকে গেলে (চিত্র 7(g) এবং 7(h)) উভয় কোষ লাইনেই কোষের আক্রমণকে বাধা দেওয়া হয়েছিল। মাইগ্রেশনের পরিপূরক করার জন্য, আমরা একটি ক্ষত নিরাময় পরীক্ষাও করেছি যখন NUDT1 786-O এবং ACHN সেল লাইন থেকে ক্ষয়প্রাপ্ত হয়েছিল এবং আমরা NUDT1 অনুপস্থিত উভয় সেল লাইনে ক্ষত নিরাময়ের ক্ষমতা হ্রাসের অনুরূপ ফলাফল লক্ষ্য করেছি (চিত্র 7(l)- 7(n))। এই ফলাফলগুলির উপর ভিত্তি করে, আমরা অনুমান করেছি যে NUDT1 এর ক্ষতি রেনাল ক্যান্সার কোষগুলিতে অ্যাপোপটোসিস হতে পারে। অতএব, আমরা NUDT1 নীরব করার পরে অ্যাপোপটোটিক কোষের শতাংশ পরিমাপ করেছি। মজার বিষয় হল, আমরা আবিষ্কার করেছি যে NUDT1-ক্ষয় হওয়া কোষগুলিতে (চিত্র 7(i)–7(k)) অ্যাপোপটোটিক কোষের শতাংশ উল্লেখযোগ্যভাবে বৃদ্ধি পেয়েছে।

আলোচনা

কিডনি রেনাল ক্লিয়ার সেল কার্সিনোমা (KIRC) হল বিশ্বব্যাপী সাধারণভাবে ঘটতে থাকা ক্যান্সারগুলির মধ্যে একটি, সাধারণত টিউমার যথেষ্ট বড় না হওয়া পর্যন্ত কোন প্রাথমিক লক্ষণ দেখায় না; অতএব, মৃত্যুর হার তুলনামূলকভাবে বেশি [18-20]। এইভাবে, KIRC-এর কার্সিনোজেনেসিস তদন্ত করা এবং এর প্রাথমিক নির্ণয়ের জন্য দরকারী বায়োমার্কার সনাক্ত করা প্রয়োজন। যাইহোক, KIRC-এর প্যাথোজেনেসিস এবং কার্সিনোজেনেসিস সম্পর্কে এখনও পর্যন্ত সীমিত জ্ঞান প্রতিষ্ঠিত। উপরন্তু, ক্লিনিকাল অনুশীলনের জন্য অনেক আণবিক মার্কার বৈধ করা হয়নি। উন্নত উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিং এবং বায়োইনফরমেটিক্স প্রযুক্তি কার্যকর বায়োমার্কার নির্বাচন করা সম্ভব করে তোলে [২১]। RNA সিকোয়েন্সিং ডেটা এবং পাঁচ শতাধিক KIRC কেসের ক্লিনিকাল টীকা টিসিজিএ ডাটাবেসে বিনামূল্যে পাওয়া যায়। টিসিজিএ থেকে এই অবাধে উপলব্ধ ডেটার সুবিধা গ্রহণ করে, আমরা টিউমার বনাম সাধারণ টিস্যু নমুনাগুলিতে পৃথকভাবে প্রকাশিত বিপাকীয় জিনের জন্য আরএনএ সিকোয়েন্স ডেটা বিশ্লেষণ করেছি। আপ-রেগুলেটেড এবং ডাউনরেগুলেটেড জিনগুলির মধ্যে, আমরা শীর্ষ 10 টি ভিন্নভাবে প্রকাশিত বিপাকীয় জিন (DEmGs) চিহ্নিত করেছি। আমরা বিশ্বাস করি যে KIRC-তে বিপাকীয় জিনের বিভিন্ন কাজ রয়েছে; তারপরও, বৈচিত্র্যপূর্ণ ফাংশন সহ জিনের পুল থেকে উপযুক্ত ডায়াগনস্টিক এবং থেরাপিউটিক মার্কার খুঁজে পাওয়া একটি চ্যালেঞ্জ হতে পারে।

পূর্বে, গবেষণায় বেশ কয়েকটি ক্যান্সারের টিউমার মাইক্রোএনভায়রনমেন্টে ইমিউন কোষের অনুপ্রবেশ অনুমান করা হয়েছে। টিসিজিএ থেকে প্রাপ্ত KIRC নমুনাগুলির ডেটাতে টিউমার ইমিউন কোষ এবং এনজিওজেনেসিসের মধ্যে একটি সম্পর্ক অধ্যয়ন করা হয়েছিল, এবং RFX2, SOX13, এবং THRA কে KIRC রোগীদের অ্যাঞ্জিওজেনেসিস স্বাক্ষর নিয়ন্ত্রণে শীর্ষ তিনটি এমটিএফ হিসাবে চিহ্নিত করা হয়েছিল [4]। অধিকন্তু, দুটি স্বাধীন m6A পরিবর্তনের নিদর্শন জৈবিক ফাংশন, ইমিউনোলজিকাল বৈশিষ্ট্য এবং KIRC [22] এর পূর্বাভাস নিয়ন্ত্রণ করে। অটোফ্যাজি-সম্পর্কিত প্রোটিন 5 (ATG5) কেআইআরসি [২৩] সহ বেশ কয়েকটি ক্যান্সারের অগ্রগতির সাথে যুক্ত করা হয়েছে। বর্তমান বিশ্লেষণে, PBRM1, SET2, VHL, এবং BAP1 সহ কিছু ভিন্নভাবে প্রকাশিত জিন KIRC ডেটাতে বিপাকীয় পথের সাথে উল্লেখযোগ্য সম্পর্ক দেখিয়েছে। আরও গভীর তদন্তের জন্য, আমরা DEmGs-এর উপর ভিত্তি করে রোগীদের ক্লাস্টার করেছি; ক্লাস্টার 1 অন্যান্য ক্লাস্টারের তুলনায় একটি খারাপ সামগ্রিক বেঁচে থাকার হার দেখিয়েছে; যাইহোক, ক্লাস্টার 3-এর KIRC রোগীদের টিউমার পর্যায়ে উন্নত এবং ক্লাস্টার 1 এবং 2-এর তুলনায় উচ্চ লিম্ফ নোড (উচ্চ N1) আছে, যা ক্যানসার মেটাস্ট্যাসিস এবং ক্লাস্টার 3-এ টিউমারের প্রসারণ দেখায়। এটি বিপাকীয় জিনের সংখ্যা কম দেখায়। ক্যান্সার মেটাস্টেসিসের সাথে যুক্ত ক্লাস্টারে।

এছাড়াও, বিভিন্ন ক্লাস্টারে ইমিউন অনুপ্রবেশের স্কোরগুলি স্ট্রোমাল এবং ইমিউন শ্রেণীবিভাগে উচ্চ স্কোর সহ C1 দেখায়। লক্ষণীয়, প্যাথলজিকাল পর্যায়ে III এবং IV-এ C1 রোগীদের CD8 প্লাস T কোষ, T ফলিকুলার হেল্পার সেল এবং ম্যাক্রোফেজের সাথে T কোষের উচ্চ অনুপ্রবেশ থাকে। প্রচুর Tregs থাকার সময়. ইমিউন সহনশীলতা এবং হোমিওস্ট্যাসিসে ট্রেগগুলির একটি গুরুত্বপূর্ণ ভূমিকা রয়েছে [24]। কোলন ক্যান্সার, স্তন ক্যান্সার এবং অগ্ন্যাশয়ের ক্যান্সারের মতো অনেক ক্যান্সারে, ট্রেগসের বর্ধিত শতাংশ ক্যান্সারের দুর্বল পূর্বাভাসের সাথে যুক্ত [25, 26]। M0 ম্যাক্রোফেজ কোষের আক্রমণ এবং বিস্তারকে প্ররোচিত করে [27], এবং ম্যাক্রোফেজের উচ্চ স্তর RCC [২৮]-এর দুর্বল পূর্বাভাসের সাথে যুক্ত। একইভাবে, সিডি 8 প্লাস টি কোষগুলি মূল অ্যান্টিটিউমার কোষ হিসাবে পরিচিত এবং ক্যান্সারের জন্য লক্ষ্যযুক্ত ইমিউন সেল থেরাপির জন্য শীর্ষ পছন্দ [২৯]। যদিও C1-এ অন্যান্য ক্লাস্টারের তুলনায় CD8 প্লাস টি কোষের অনুপ্রবেশ সবচেয়ে বেশি, তবে সামগ্রিকভাবে বেঁচে থাকা সবচেয়ে খারাপ ছিল।

হারবা সিস্তানচে

আমরা KIRC টিউমার মাইক্রোএনভায়রনমেন্টে ইমিউন কোষের অনুপ্রবেশ অধ্যয়ন করতে CIBERSORT, MCP এবং ssGSEA তিনটি পদ্ধতি ব্যবহার করেছি। টিউমার ইমিউন অনুপ্রবেশ পরিমাপ করার ঐতিহ্যগত পদ্ধতি টিস্যু বিভাগ এবং ইমিউন উপসেটগুলির উপর হিস্টোলজির মাধ্যমে পৃথক চিহ্নিতকারীর ইমিউনোহিস্টোকেমিস্ট্রি দ্বারা অনুমান করা হয়। যাইহোক, কিছু সীমাবদ্ধতা রয়েছে যেখানে ইমিউনোহিস্টোকেমিস্ট্রি অনেক ইমিউন জনসংখ্যাকে সনাক্ত করতে পারে না এবং কার্যকরী ফিনোটাইপ (যেমন, সক্রিয় বনাম বিশ্রামের লিম্ফোসাইট) ক্যাপচারে খারাপভাবে কাজ করে। অতএব, আমরা CIBERSORT ব্যবহার করেছি, [30] দ্বারা তৈরি একটি গণনামূলক পদ্ধতি যা ইমিউনোহিস্টোকেমিস্ট্রির মুখোমুখি হওয়া চ্যালেঞ্জগুলিকে মোকাবেলা করে। CIBERSORT ছাড়াও, আমরা অনাক্রম্য অনুপ্রবেশের অবস্থা পরীক্ষা করার জন্য অন্যান্য অ্যালগরিদমিক প্যাকেজ নিযুক্ত করেছি। এর কারণ হল CIBERSORT শুধুমাত্র ইমিউন কোষের জনসংখ্যার আন্তঃ নমুনা অনুপাত পরিমাপ করে যা MCP-কাউন্টারের মতো অন্য প্যাকেজ দ্বারা সমাধান করা যেতে পারে যা কোষের জনসংখ্যা প্রচুর পরিমাণে অনুমান করতে পারে যা টিউমার মাইক্রোএনভায়রনমেন্টে অনুপ্রবেশকারী কোষগুলির আন্তঃ নমুনা তুলনা করতে সক্ষম করে [31]। CIBERSORT এবং MCP বিশ্লেষণের পরিপূরক করার জন্য, আমরা R প্যাকেজ GSVA [32, 33]-এ বাস্তবায়িত ইমিউন কোষের প্রকারের জন্য অনুপ্রবেশের মাত্রা পরিমাপ করতে ssGSEA প্রয়োগ করেছি। জিএসএ হল একটি র্যাঙ্ক-ভিত্তিক পদ্ধতি যা জিনোমের অন্যান্য সমস্ত জিনের সাথে সম্পর্কিত একটি জিনের আগ্রহের তালিকার জন্য একটি অতিরিক্ত এক্সপ্রেশন গণনা করে। CIBERSORT অন্যান্য দুটি পদ্ধতির তুলনায় ভাল ফলাফল দেখিয়েছে; এইভাবে, CIBERSORT থেকে প্রাপ্ত ডেটা থেকে আরও বিশ্লেষণ করা হয়েছিল।

তদুপরি, আমরা RNA-seq ডেটার উপর ভিত্তি করে ডিফারেনশিয়াল এক্সপ্রেশন বিশ্লেষণের মাধ্যমে KIRC অগ্রগতির অন্তর্নিহিত প্রক্রিয়ার উপর দৃষ্টি নিবদ্ধ করেছি। সামগ্রিকভাবে, আমরা তিনটি ক্লাস্টারের মধ্যে সাধারণ জিনের অস্বাভাবিক ডিফারেনশিয়াল অভিব্যক্তিকে লক্ষ্য করেছি। C1-তে NUDT1 ছাড়া বেশিরভাগ জিনই নিয়ন্ত্রিত ছিল; যাইহোক, C1 থেকে C3 পর্যন্ত অগ্রগতির মাধ্যমে এর অভিব্যক্তি উল্লেখযোগ্যভাবে হ্রাস পেয়েছে। এইভাবে, KIRC অগ্রগতিতে ভূমিকার জন্য NUDT1 আরও বৈধ করা হয়েছিল। দুটি KIRC সেল লাইনে (786-O এবং ACHN) NUDTI জিনের প্রকাশের siRNA-মধ্যস্থতা কোষের কার্যক্ষমতা এবং কোষের স্থানান্তর হ্রাস করেছে এবং অ্যাপোপটোসিস বৃদ্ধি করেছে, যা টিউমারের অগ্রগতিতে এর ভূমিকা নিশ্চিত করে। পূর্বে, এটি রিপোর্ট করা হয়েছে যে NUDT1 এক্সপ্রেশনের মাত্রা টিউমার গ্রেড, পর্যায়, আকার, পার্থক্য, ভাস্কুলার আক্রমণের ডিগ্রি, সামগ্রিকভাবে বেঁচে থাকা (ওএস), এবং এইচসিসি রোগীদের রোগ-মুক্ত বেঁচে থাকা (ডিএফএস) এর সাথে সম্পর্কিত, এছাড়াও ভবিষ্যদ্বাণী করা হয়েছিল এইচসিসি রোগীদের থেরাপিউটিক সম্ভাবনা সহ একটি প্রগনোস্টিক মার্কার [৩৪]। পালমোনারি আর্টারিয়াল হাইপারটেনশনে NUDT1 ওভার এক্সপ্রেস করা অক্সিডেটিভ স্ট্রেস এবং ডিএনএ ক্ষতি হ্রাস করে, তাই কোষের বিস্তারকে প্রচার করে এবং অ্যাপোপটোসিস হ্রাস করে [35]। এটি দেখানো হয়েছে যে ওরাল স্কোয়ামাস সেল কার্সিনোমা (ওএসসিসি) রোগীদের এনইউডিটি 1 এর উচ্চ প্রকাশ রয়েছে তাদের বেঁচে থাকার হার দুর্বল [৩৬] দেখিয়েছে। ক্যান্সারে NUDTI-এর ভূমিকা সম্পর্কে পর্যাপ্ত সাহিত্য পাওয়া যায় না এবং এখনও পর্যন্ত কোন গবেষণায় KIRC-তে এর ভূমিকার কথা বলা হয়নি, তাই আমরা প্রথমবারের মতো KIRC-এর অগ্রগতিতে NUDTI-এর ভূমিকা সম্পর্কে রিপোর্ট করছি। বর্তমান গবেষণার কিছু সীমাবদ্ধতা ছিল; যদিও আমাদের গবেষণায় দেখা গেছে যে স্বাক্ষরটি KIRC-এর ইমিউনোথেরাপির সাথে যুক্ত হতে পারে, তথ্যের অভাব, সম্ভাব্য অন্তর্নিহিত প্রক্রিয়া এবং KIRC এবং ক্লিনিকাল অনুশীলনে NUDT1 এর কার্যকরী ভূমিকার কারণে স্বাক্ষরের কার্যকারিতা যাচাই করা যায়নি এবং ক্লিনিকাল অনুশীলনের আরও অন্বেষণের প্রয়োজন।

Cistanche tubulosa

উপসংহার

আমরা স্বাভাবিক এবং টিউমার টিস্যুগুলির মধ্যে অনিয়ন্ত্রিত বিপাকীয় জিনগুলি স্ক্রীন করেছি এবং তাদের কার্যকারিতা অন্বেষণ করেছি। WGCNA বিশ্লেষণ KIRC-এর বেঁচে থাকার অবস্থার সাথে সম্পর্কিত জিনের একটি গ্রুপ চিহ্নিত করেছে। বেঁচে থাকা-সম্পর্কিত জিনের উপর ভিত্তি করে ঐক্যমত্য ক্লাস্টারিং বিভিন্ন বেঁচে থাকার হার এবং ইমিউন অনুপ্রবেশের ধরণ সহ তিনটি ক্লাস্টার প্রদর্শন করেছে। NUDT1 নেতিবাচকভাবে বেঁচে থাকার সাথে সম্পর্কযুক্ত, এবং আরও বিশ্লেষণ থেকে জানা যায় যে NUDT1 এর নকডাউন টিউমার কোষের বিস্তার এবং স্থানান্তরকে বাধা দেয়। উল্লেখ্য, বেঁচে থাকা-সম্পর্কিত জিনের উপর ভিত্তি করে একটি ভবিষ্যদ্বাণী মডেল তৈরি করা হয়েছিল, যা KIRC-এর বেঁচে থাকার পূর্বাভাস দেওয়ার ক্ষেত্রে উচ্চ দক্ষতা দেখিয়েছিল। উপসংহারে, আমরা KIRC-তে বিপাকীয় জিনগুলির একটি সম্পূর্ণ বিশ্লেষণ করেছি এবং NUDT1 কে একটি অনকোজিন হিসাবে চিহ্নিত করেছি যা একটি থেরাপিউটিক এবং প্রগনোস্টিক লক্ষ্য হিসাবে ব্যবহার করা যেতে পারে।

কিডনি স্বচ্ছতার উপর Cistanche নির্যাস প্রভাব

কিডনির স্বচ্ছতার উপর Cistanche এর প্রভাব সম্পর্কে সীমিত বৈজ্ঞানিক প্রমাণ রয়েছে। যাইহোক, কিছু গবেষণায় পরামর্শ দেওয়া হয়েছে যে Cistanche নির্যাস কিডনি স্বাস্থ্যের উপর ইতিবাচক প্রভাব ফেলতে পারে।

কিডনি শরীর থেকে বর্জ্য এবং বিষাক্ত পদার্থগুলিকে ফিল্টার করার জন্য দায়ী, এবং তাদের স্বাস্থ্য সামগ্রিক সুস্থতার জন্য অপরিহার্য। গবেষণায় দেখা গেছে যে সিস্টানচে নির্যাসের শক্তিশালী অ্যান্টিঅক্সিডেন্ট এবং অ্যান্টি-ইনফ্লেমেটরি বৈশিষ্ট্য রয়েছে, যা কিডনিতে অক্সিডেটিভ স্ট্রেস এবং প্রদাহ থেকে রক্ষা করতে সাহায্য করতে পারে।

ঐতিহ্যগত চীনা ওষুধে, কিডনিকে টোনিফাই করতে এবং তাদের কার্যকারিতা উন্নত করতেও সিস্তানচে ব্যবহার করা হয়। কিছু অনুশীলনকারীরা বিশ্বাস করেন যে সিস্টানচে নির্যাস নিয়মিত সেবন কিডনির স্বচ্ছতা উন্নত করতে সাহায্য করতে পারে, যদিও এই দাবিটি শক্তিশালী ক্লিনিকাল গবেষণা দ্বারা ব্যাক আপ হয় না।

অতএব, কিডনির স্বচ্ছতার উপর Cistanche নির্যাসের সম্ভাব্য সুবিধাগুলি সম্পূর্ণরূপে বোঝার জন্য আরও কঠোর গবেষণা প্রয়োজন। যাইহোক, যেকোনো খাদ্যতালিকাগত সম্পূরক বা বিকল্প থেরাপির মতো, আপনার ডায়েটে নতুন সংযোজন অন্তর্ভুক্ত করার আগে একজন স্বাস্থ্যসেবা পেশাদারের সাথে পরামর্শ করা গুরুত্বপূর্ণ, বিশেষ করে যদি আপনার পূর্ব-বিদ্যমান চিকিৎসা শর্ত থাকে।

তথ্যসূত্র

[১৮] আরএল সিগেল, কেডি মিলার এবং এ. জেমাল, "ক্যান্সার পরিসংখ্যান, 2019," CA: A Cancer Journal for Clinicians, vol. 69, না। 1, পৃ. 7-34, 2019।

[১৯] আরএল সিগেল, কেডি মিলার, এইচই ফুচস, এবং এ. জেমাল, "ক্যান্সার পরিসংখ্যান, 2021," CA: A Cancer Journal for Clinicians, vol. 71, না। 1, পৃ. 7-33, 2021।

[২০] JC Angulo এবং O. Shapiro, "মেটাস্ট্যাটিক রেনাল ক্যান্সারের পরিবর্তনশীল থেরাপিউটিক ল্যান্ডস্কেপ," ক্যান্সার, ভলিউম। 11, না। 9, পৃ. 1227, 2019।

[২১] এ কে শর্মা, "বায়োমার্কার আবিষ্কারের উদীয়মান প্রবণতা: ক্যান্সারের পূর্বাভাস এবং পূর্বাভাসের সহজতা," ক্যান্সার জীববিজ্ঞানে সেমিনার, ভলিউম। 52, পার্ট 1, pp. iii–iv, 2018।

[২২] H. Li, J. Hu, A. Yu et al., "N6- মিথিলাডেনোসিনের RNA পরিবর্তন কিডনি রেনাল ক্লিয়ার সেল কার্সিনোমাতে ইমিউন ফেনোটাইপস এবং থেরাপিউটিক সুযোগের পূর্বাভাস দেয়," ফ্রন্টিয়ার্স ইন অনকোলজি, ভলিউম। 11, নিবন্ধ 642159, 2021।

[২৩] C. Xu, Y. Zang, Y. Zhao, et al., "বিস্তৃত প্যান-ক্যান্সার বিশ্লেষণ নিশ্চিত করেছে যে ATG5 টিউমার বিপাক রক্ষণাবেক্ষণ এবং টিউমার ইমিউন পালানোর ঘটনাকে উন্নীত করেছে," ফ্রন্টিয়ার্স ইন অনকোলজি, ভলিউম। 11, নিবন্ধ 652211, 2021।

[২৪] ওয়াই. তাকুচি এবং এইচ. নিশিকাওয়া, "ক্যান্সার রোগ প্রতিরোধে নিয়ন্ত্রক টি কোষের ভূমিকা," আন্তর্জাতিক ইমিউনোলজি, ভলিউম। 28, না। 8, পৃ. 401–409, 2016।

[২৫] সি. ঝুও, ওয়াই জু, এম. ইং, এট আল।, "FOXP3 প্লাস ট্রেগস: কোলোরেক্টাল ক্যান্সারে আক্রান্ত রোগীদের বেঁচে থাকার ফলাফলের উপর ভিন্ন ভিন্ন ফিনোটাইপস এবং বিরোধপূর্ণ প্রভাব," ইমিউনোলজিক রিসার্চ, ভলিউম। 61, না। 3, পৃ. 338–347, 2015।

[২৬] এইচ. ওয়াং, এফ. ফ্রাঙ্কো, এবং পিসি হো, "ক্যান্সারে ট্রেগসের বিপাকীয় নিয়ন্ত্রণ: ইমিউনোথেরাপির সুযোগ," ট্রেন্ডস ক্যান্সার, ভলিউম। 3, না। 8, পৃ. 583–592, 2017।

[২৭] বিজেড কিয়ান এবং জেডব্লিউ পোলার্ড, "ম্যাক্রোফেজ বৈচিত্র্য টিউমারের অগ্রগতি এবং মেটাস্ট্যাসিস বাড়ায়," সেল, ভলিউম। 141, না। 1, পৃ. 39-51, 2010।

[২৮] A. Hajiran, N. Chakiryan, AM Aydin, et al., "মেটাস্ট্যাটিক রেনাল সেল কার্সিনোমাতে টিউমার ইমিউন মাইক্রোএনভায়রনমেন্ট স্থানিক ভিন্নতা এবং ইমিউনোথেরাপি প্রতিক্রিয়ার সাথে পারস্পরিক সম্পর্ক," ক্লিনিক্যাল এবং এক্সপেরিমেন্টাল ইমিউনোলজি, ভলিউম। 204, না। 1, পৃ. 96-106, 2021।

[২৯] বি. ফারহুড, এম. নাজাফি, এবং কে. মর্তেজাই, "ক্যান্সার ইমিউনোথেরাপিতে CD8( প্লাস) সাইটোটক্সিক টি লিম্ফোসাইট: একটি পর্যালোচনা," সেলুলার ফিজিওলজি জার্নাল, ভলিউম। 234, না। 6, পৃ. 8509–8521, 2019।

[৩০] এএম নিউম্যান, সিএল লিউ, এমআর গ্রীন, এট আল।, "টিস্যু এক্সপ্রেশন প্রোফাইল থেকে কোষের উপসেটের জোরালো গণনা," প্রকৃতি পদ্ধতি, ভলিউম। 12, না। 5, পৃ. 453–457, 2015।

[৩১] ই. বেখ্ট, এনএ গিরাল্ডো, এল. ল্যাক্রোইক্স, এট আল।, "জিন এক্সপ্রেশন ব্যবহার করে টিস্যু-অনুপ্রবেশকারী ইমিউন এবং স্ট্রোমাল কোষের জনসংখ্যার প্রাচুর্যের অনুমান করা," জিনোম বায়োলজি, ভলিউম। 17, না। 1, পৃ. 218, 2016।

[৩২] ডিএ বার্বি, পি. তামায়ো, জেএস বোহেম, এট আল 462, না। 7269, পৃ. 108-112, 2009।

[৩৩] S. Hanzelmann, R. Castelo, এবং J. Guinney, "GSVA: মাইক্রোয়ারে এবং RNA-seq ডেটার জন্য জিন সেট বৈচিত্র্য বিশ্লেষণ," BMC বায়োইনফরমেটিক্স, ভলিউম। 14, না। 1, 2013।

[৩৪] Q. Ou, N. Ma, Z. Yu et al., "Nudix hydrolase 1 is a prognostic biomarker in hepatocellular carcinoma," Aging, vol. 12, না। 8, পৃ. 7363–7379, 2020।

[৩৫] G. Vitry, R. Paulin, Y. Grobs, et al., "NUDT1 দ্বারা অক্সিডাইজড ডিএনএ প্রিকারসার ক্লিনআপ পালমোনারি আর্টারিয়াল হাইপারটেনশনে ভাস্কুলার রিমডেলিংয়ে অবদান রাখে," আমেরিকান জার্নাল অফ রেসপিরেটরি অ্যান্ড ক্রিটিকাল কেয়ার মেডিসিন, ভলিউম। 203, না। 5, পৃ. 614-627, 2021।

[৩৬] Y. Shen, L. Zhang, S. Piao, et al., "NUDT1: ওরাল স্কোয়ামাস সেল কার্সিনোমা রোগীদের রোগ নির্ণয়ের জন্য একটি সম্ভাব্য স্বাধীন ভবিষ্যদ্বাণী," ওরাল প্যাথলজি অ্যান্ড মেডিসিনের জার্নাল, ভলিউম। 49, না। 3, পৃ. 210-218, 2020।

জুনওয়েই জি,1,2,3,4,5 লিঙ্গাং কুই, 6 শাওকাং প্যান, 1,2,3,4,5 ডংওয়েই লিউ, 1,2,3,4,5 ফেংক্সুন লিউ, 1,2,3,4 5 এবং ঝাংসুও লিউ 1,2,3,4,5

1 নেফ্রোলজি বিভাগ, ঝেংঝো বিশ্ববিদ্যালয়ের প্রথম অনুমোদিত হাসপাতাল, ঝেংঝু 450052, চীন

2 রিসার্চ ইনস্টিটিউট অফ নেফ্রোলজি, ঝেংঝু ইউনিভার্সিটি, ঝেংঝু 450052, চীন

কিডনি রোগের জন্য 3 গবেষণা কেন্দ্র, ঝেংঝো, 450052 হেনান, চীন

হেনান প্রদেশ, ঝেংঝু 450052, চীনে দীর্ঘস্থায়ী কিডনি রোগের নির্ভুলতা নির্ণয় এবং চিকিত্সার 4 মূল পরীক্ষাগার

ন্যাশনাল ক্লিনিক্যাল মেডিকেল রিসার্চ সেন্টার অফ কিডনি ডিজিজের 5 কোর ইউনিট, ঝেংঝু 450052, চীন

6 ইউরোলজি বিভাগ, ঝেংঝো বিশ্ববিদ্যালয়ের প্রথম অনুমোদিত হাসপাতাল, ঝেংঝু 450052, চীন