কিডনি রোগে আক্রান্ত শিশু রোগীদের ডায়াগনস্টিক ওয়ার্কফোতে জেনেটিক টেস্টিংয়ের ভূমিকা: একটি একক প্রতিষ্ঠানের অভিজ্ঞতা

বিমূর্তউদ্দেশ্যউত্তরাধিকারসূত্রে প্রাপ্ত কিডনি রোগগুলি শিশুদের কিডনি ব্যর্থতার প্রধান কারণগুলির মধ্যে রয়েছে, যার ফলে মৃত্যুহার বৃদ্ধি, উচ্চ স্বাস্থ্যসেবা খরচ এবং অঙ্গ প্রতিস্থাপনের প্রয়োজন। পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং প্রযুক্তি বিরল মনোজেনিক অবস্থার নির্ণয়ে সাহায্য করতে পারে, যা অপ্টিমাইজড চিকিৎসা ব্যবস্থাপনা এবং থেরাপিউটিক পছন্দের জন্য অনুমতি দেয়।

পদ্ধতিগুলি ক্লিনিকাল এক্সোম সিকোয়েন্সিং (সিইএস) একটি একক প্রতিষ্ঠান থেকে 191 জন শিশু রোগীর একটি দলে সঞ্চালিত হয়েছিল, তারপরে চিহ্নিত রূপগুলি নিশ্চিত করতে এবং পারিবারিক পৃথকীকরণ অধ্যয়নের জন্য স্যাঞ্জার সিকোয়েন্সিং করা হয়েছিল। ফলাফল সকল রোগীর কিডনি রোগের ক্লিনিকাল নির্ণয় ছিল: প্রধান রোগের বিভাগগুলি হল গ্লোমেরুলার রোগ (32.5%), সিলিওপ্যাথিস (20.4%), CAKUT (17.8%), নেফ্রোলিথিয়াসিস (11.5%) এবং টিউবুলার রোগ (10.5%)। 7.3% রোগী অন্যান্য অবস্থার সাথে উপস্থাপিত। একটি চূড়ান্ত জেনেটিক পরীক্ষা, সিইএস এবং সেঞ্জার বৈধতার উপর ভিত্তি করে, 37.1% রোগীর মধ্যে প্রাপ্ত হয়েছিল। সিলিওপ্যাথি (74.4%), নেফ্রোলিথিয়াসিস (45.5%) এবং টিউবুলার রোগ (45%) এর জন্য সর্বাধিক সনাক্তকরণের হার পাওয়া গেছে, যখন বেশিরভাগ গ্লোমেরুলার রোগ এবং CAKUT নির্ণয় করা হয়নি। উপসংহারের ফলাফলগুলি ইঙ্গিত দেয় যে দীর্ঘস্থায়ী কিডনি রোগে আক্রান্ত শিশুদের ডায়াগনস্টিক কর্মপ্রবাহে ধারাবাহিকভাবে ব্যবহৃত জেনেটিক পরীক্ষা (i) ক্লিনিকাল রোগ নির্ণয় নিশ্চিত করতে পারে, (ii) উত্তরাধিকারসূত্রে প্রাপ্ত অবস্থার ক্ষেত্রে প্রাথমিক রোগ নির্ণয় প্রদান করতে পারে, (iii) এবং পূর্বে অচেনা জেনেটিক কারণ। রোগ এবং (iv) দর্জি প্রতিস্থাপন প্রোগ্রাম।

কীওয়ার্ড ক্লিনিকাল এক্সোম সিকোয়েন্সিং, নেক্সট জেনারেশন সিকোয়েন্সিং,কিডনি রোগ, জেনেটিক টেস্টিং, পেডিয়াট্রিক কোহর্ট

CISTANCHE এর জন্য এখানে ক্লিক করুনশেষ পর্যায়ে রেনাল ডিজিজ

ভূমিকা

পেডিয়াট্রিক নেফ্রোপ্যাথিগুলি ক্লিনিকাল উপস্থাপনা, বিবর্তন এবং থেরাপিউটিক বিকল্পগুলির পরিপ্রেক্ষিতে ব্যাপকভাবে বিভিন্ন রোগের সত্তা নিয়ে গঠিত [1-4]। দীর্ঘস্থায়ী কিডনি রোগে (CKD) প্রায় 30% শিশু একটি মনোজেনিক অবস্থায় ভোগে, শেষ পর্যায়ের রেনাল ডিজিজ (ESRD) [5, 6] শিশুদের বিবেচনা করার সময় একটি শতাংশ বৃদ্ধি পায়। এই শিশুদের মধ্যে অনেকগুলি প্রতিস্থাপনের সময় নির্ণয় করা হয়নি [4, 6, 7]। এই রোগীদের জন্য একটি রোগ নির্ণয় পৌঁছানো শুধুমাত্র একটি ডায়গনিস্টিক অডিসির সমাপ্তি বোঝায় না, তবে পূর্বাভাস, ব্যবস্থাপনা এবং চিকিত্সার জন্য বিভিন্ন সুবিধা উপস্থাপন করে।

অগ্রগামী অধ্যয়নগুলি ধারাবাহিকভাবে দেখিয়েছে যে পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং (এনজিএস) কৌশলগুলির বাস্তবায়ন উত্তরাধিকারসূত্রে প্রাপ্ত কিডনি রোগ (আইকেডি) [8] রোগীদের ডায়গনিস্টিক ফলনকে উল্লেখযোগ্যভাবে উন্নত করেছে। অতি সম্প্রতি, এনজিএস-এর ব্যাপক ব্যবহার যুক্তিসঙ্গত সময়ে এবং সাশ্রয়ী মূল্যে জেনেটিক ডায়াগনোসিসকে উপলব্ধ করেছে, এটি রুটিন ডায়াগনস্টিক ওয়ার্কফ্লোতে কখন এবং কখন একীভূত করা উচিত এই প্রশ্ন উত্থাপন করে।

শিশুদের মধ্যে জেনেটিক রোগ নির্ণয় বিভিন্ন দিকের জন্য অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ। প্রথমটি হল যে এটি রোগের ক্লিনিকাল পদ্ধতিতে প্রাসঙ্গিক হতে পারে, সাধারণ উদাহরণ হল নেফ্রোটিক সিন্ড্রোম যেখানে পডোসাইট-সম্পর্কিত জিনের কাঠামোগত বৈকল্পিক সনাক্তকরণ ইমিউনোসপ্রেসিভ থেরাপির বিরুদ্ধে যুক্তি দেয় যা অন্যথায় নিয়মিতভাবে বেশ কিছু সময়ের জন্য ব্যবহার করা হবে। মাস [9]. দ্বিতীয়টি হল যে এটি শিশুর পরিবারের জন্য এবং অন্যান্য সদস্যদের সনাক্তকরণের জন্য অত্যন্ত প্রাসঙ্গিক হতে পারে যারা ভবিষ্যত প্রজন্মের কাছে সম্ভবত সংক্রমণযোগ্য বৈকল্পিক বহন করছে। একবার প্রোব্যান্ডে প্যাথোজেনিক বৈকল্পিক সনাক্ত করা হলে, পরিবারের সদস্যদের ক্যাসকেড পরীক্ষা এবং বৈকল্পিক বাহকগুলিতে জেনেটিক কাউন্সেলিং ক্লিনিকাল জেনেটিক্সে স্ট্যান্ডার্ড অনুশীলনের প্রতিনিধিত্ব করে [5]। তৃতীয়টি হল প্যাথোজেনিক বৈকল্পিকটি জানা প্রতিস্থাপনের প্রেক্ষাপটে অপরিহার্য যেখানে দাতা একজন আত্মীয় হতে পারে। প্রকৃতপক্ষে, অঙ্গ দাতার মধ্যে একই বৈকল্পিক(গুলি) উপস্থিতি বাতিল করা গুরুত্বপূর্ণ, সেইসাথে পরিবারের সকল সদস্যকে সম্ভাব্যভাবে ট্রান্সপ্ল্যান্টের প্রয়োজন শনাক্ত করাও গুরুত্বপূর্ণ। চতুর্থটি হল যে কিছু রোগ অঙ্গ প্রতিস্থাপনের পরে পুনরায় সংক্রমণের উচ্চ ঝুঁকি উপস্থাপন করে, যেমন ফোকাল সেগমেন্টাল গ্লোমেরুলোস্ক্লেরোসিস [১০] অথবা তাদের ফলাফলগুলি ট্রান্সপ্লান্টের আরও উপযুক্ত পছন্দ দ্বারা উন্নত করা যেতে পারে, যেমন প্রাথমিক ক্ষেত্রে হাইপার অক্সালুরিয়া যেখানে একটি সম্মিলিত কিডনি-লিভার প্রতিস্থাপনের ফলে একটি ভাল ফলাফল হতে পারে [১১]। অবশেষে, একটি পরিষ্কার রোগ নির্ণয় করা রোগীর জন্য ক্লিনিকাল ট্রায়ালগুলিতে অংশ নিতে এবং অভিনব চিকিত্সার বিকল্পগুলি থেকে উপকৃত হতে পারে [12, 13]।

2018 সালের শেষের দিকে, পেডিয়াট্রিক নেফ্রোলজিস্ট এবং জিনতত্ত্ববিদদের মধ্যে সহযোগিতায়, আমরা মনোজেনিক অবস্থার জন্য জেনেটিক পরীক্ষা করা শুরু করেছিলাম যা সম্ভাব্যভাবে ESRD এর দিকে পরিচালিত করে এবং তাই প্রতিস্থাপন। আমাদের হাসপাতাল উত্তর-পশ্চিম ইতালির সবচেয়ে বড়, প্রায় 5 মিলিয়ন লোকের এলাকা থেকে নিষ্কাশন। আমরা ক্লিনিকাল এক্সোমের সিকোয়েন্সিং সহ "একটি মাপ সব ফিট" ধরণের বিশ্লেষণ নির্বাচন করেছি, অর্থাৎ, মোনোজেনিক অবস্থার সাথে যুক্ত প্রায় 6700টি জিন, ক্লিনিকাল সন্দেহের সাথে মানানসই জিন প্যানেলগুলির উপর ফোকাস বিশ্লেষণ এবং তাই ঘটনাগত ফলাফলগুলিকে সীমাবদ্ধ করে। ক্রম বিশ্লেষণের জন্য সময় হ্রাস করা।

সামগ্রিকভাবে, এই পাইপলাইনটি প্রয়োগ করে, আমরা প্রত্যাশিত হিসাবে বিভিন্ন ক্লিনিকাল সন্দেহের মধ্যে কিছু ভিন্নতা সহ প্রকাশিত ডেটার সাথে সামঞ্জস্য রেখে একটি ডায়াগনস্টিক ফল পেয়েছি। প্রাপ্ত ফলাফলগুলি নেফ্রোপ্যাথিতে আক্রান্ত শিশু রোগীদের ডায়গনিস্টিক ওয়ার্কফ্লোতে রুটিন জেনেটিক টেস্টিং এবং কাউন্সেলিং অন্তর্ভুক্ত করার প্রাসঙ্গিকতা নিশ্চিত করে। প্রকৃতপক্ষে, কার্যকারক বৈকল্পিক সনাক্তকরণ তাদের ক্লিনিকাল ব্যবস্থাপনার জন্য এবং সম্ভাব্য সর্বোত্তম জীবিত-দাতা নির্বাচনের জন্য গুরুত্বপূর্ণ।

উপকরণ এবং পদ্ধতিসমূহ

রোগী নিয়োগ

গবেষণাটি রেজিনা মার্ঘেরিটা চিলড্রেন হাসপাতালের পেডিয়াট্রিক নেফ্রোলজি, ডায়ালাইসিস এবং ট্রান্সপ্লান্টেশন ইউনিট দ্বারা নিয়োগকৃত এবং ইমিউনোজেনেটিক্স এবং ট্রান্সপ্লান্ট বায়োলজি পরিষেবার জন্য রেফার করা 191 টানা পেডিয়াট্রিক রোগীর (নিয়োগ করার সময় <18 বছর বয়সী) একটি ডায়াগনস্টিক কোহর্টের উপর ভিত্তি করে করা হয়েছিল। জেনেটিক বিশ্লেষণ। গবেষণায় অন্তর্ভুক্ত সমস্ত রোগী যখনই সম্ভব, উভয় পিতামাতার স্বাক্ষরিত একটি লিখিত অবহিত সম্মতি প্রদান করেন।

নমুনা প্রস্তুতি, সিকোয়েন্সিং এবং বায়োইনফরমেটিক্স বিশ্লেষণ

পেরিফেরাল রক্ত ​​থেকে নিউক্লিক অ্যাসিড নিষ্কাশন, ডিএনএ মানের বিশ্লেষণ, লাইব্রেরি প্রস্তুতি এবং সিকোয়েন্সিং পূর্বে রিপোর্ট করা [১৪] হিসাবে সম্পাদিত হয়েছিল। সিকোয়েন্সিং থেকে প্রাপ্ত কাঁচা ডেটা FASTQ ফাইলে রূপান্তরিত করা হয়েছিল এবং তারপর এনরিচমেন্ট 3.1 এর সাথে সারিবদ্ধ করা হয়েছিল। একক নিউক্লিওটাইড ভেরিয়েন্ট, কপি নম্বর ভেরিয়েন্ট (CNV) এবং ফাইলের স্ট্রাকচারাল ভেরিয়েন্ট পাওয়ার জন্য একটি রেফারেন্স। কপি নম্বর শনাক্তকরণের জন্য, 5টি ভিন্ন রোগীর সিকোয়েন্সিং ডেটা দিয়ে তৈরি একটি বেসলাইন, সিএনভির জন্য সমস্ত নেতিবাচক (অ্যারের তুলনামূলক জিনোমিক হাইব্রিডাইজেশন ডেটা অনুসারে) ব্যবহার করা হয়েছিল। এই পদ্ধতিটি যৌন ক্রোমোজোমেও সিএনভি সনাক্ত করতে দেয় যেহেতু রেফারেন্স গ্রুপটি মহিলা এবং পুরুষ উভয়ের মধ্যেই তৈরি করা হয়েছিল এবং সারিবদ্ধকরণ পর্যায়ে সর্বদা বিশ্লেষণ করা বিষয়ের লিঙ্গ নির্দিষ্ট করা হয়েছিল। সংজ্ঞায়িত মানদণ্ড অনুসরণ করে বৈকল্পিক কলিং এবং অগ্রাধিকার দেওয়া হয়েছিল। আগ্রহের জিনের সারিবদ্ধকরণ এবং এক্সন কভারেজটি ইন্টিগ্রেটিভ জিনোমিক্স ভিউয়ার IGV দ্বারা পরীক্ষা করা হয়েছে এবং প্রদর্শিত হয়েছে, UC সান দিয়েগো-ইউনিভার্সিটি অফ ক্যালিফোর্নিয়া এবং ব্রড ইনস্টিটিউট অফ এমআইটি এবং হার্ভার্ড ইউনিভার্সিটি-বোস্টন (https://software.broadinstitute) থেকে বিনামূল্যে পাওয়া যায়। org/ software/igv/)। চূড়ান্ত জেনেটিক রিপোর্টে অন্তর্ভুক্ত করা বৈকল্পিকগুলি আমেরিকান কলেজ অফ মেডিকেল জেনেটিক্স অ্যান্ড জিনোমিক্স (ACMG) মানদণ্ড অনুসারে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়েছিল।

সিলিকো জিন-রোগের তালিকায় প্রজন্ম

বৈকল্পিক শনাক্তকরণ এবং অগ্রাধিকারের জন্য বিবেচনা করা জিনগুলি ক্লিনিকাল সন্দেহের ভিত্তিতে সংজ্ঞায়িত করা হয়েছিল। সিলিকোতে জিন তালিকাগুলি বিভিন্ন ডাটাবেস থেকে মিলিত (i) ডেটা তৈরি করা হয়েছিল, জিনোটাইপের সাথে ফিনোটাইপের সাথে সম্পর্কযুক্ত (ওএমআইএম, প্যানেলঅ্যাপ ইংল্যান্ড, ক্লিনজেন, মালাকার্ডস) এবং (ii) সাহিত্য থেকে ডেটা। উপলব্ধ জিন তালিকাগুলি বছরে একবার জিন-রোগ সমিতির অভিনব প্রমাণের ভিত্তিতে আপডেট করা হয়।

স্যাঞ্জার সিকোয়েন্সিং এবং মাল্টিপ্লেক্স লাইগেশন-নির্ভর প্রোব এমপ্লিফিকেশন (MLPA)

স্যাঞ্জার সিকোয়েন্সিং এবং/অথবা এমএলপিএ বিশ্লেষণগুলি এনজিএস দ্বারা চিহ্নিত বৈকল্পিক এবং পারিবারিক পৃথকীকরণ অধ্যয়নের জন্য যাচাই করার জন্য সঞ্চালিত হয়েছিল। সংক্ষেপে, প্রোব্যান্ড পেরিফেরাল রক্তের দ্বিতীয় স্বাধীন অ্যালিকোট এবং পিতামাতার কাছ থেকে ডিএনএ বের করা হয়েছিল। সুদের ডিএনএ অঞ্চলগুলি নির্দিষ্ট পরীক্ষামূলক অবস্থা ব্যবহার করে পিসিআর দ্বারা প্রশস্ত করা হয়েছিল। পরিবর্ধিত অঞ্চলগুলির বিশুদ্ধতা এবং নির্দিষ্টতা 0.8 বা 1.5% অ্যাগারোজ জেল দ্বারা পরীক্ষা করা হয়েছিল৷ পরিবর্ধিত পিসিআর পণ্যগুলি তখন একই প্রাইমার ব্যবহার করে স্যাঞ্জার সিকোয়েন্স করা হয়েছিল। PKD1 ভেরিয়েন্টের জন্য, সিউডোজিনগুলি থেকে কোনও অনুমান এড়াতে একটি দীর্ঘ-পরিসরের পিসিআর এবং একটি নেস্টেড পিসিআর ব্যবহার করে বৈধতা সম্পাদিত হয়েছিল।

ফলাফল

জেনেটিক বিশ্লেষণের ফলাফল ফেরত দেওয়ার জন্য মানদণ্ডের সংজ্ঞা

We previously reported on the design and set-up of a "kidney" gene panel that comprises>400টি জিন সবই বিভিন্ন ধরনের কিডনি রোগের সাথে জড়িত [14]। এই অধ্যয়নের জন্য, আমরা সন্দেহের নির্দিষ্ট ক্লিনিকাল বিভাগের (যেমন, CAKUT, গ্লোমেরুলোপ্যাথি, টিউবুলোপ্যাথি, ইত্যাদি) উপর দৃষ্টি নিবদ্ধ করে সাবপ্যানেলগুলির সাথে বিশ্লেষণ প্রয়োগ করেছি এবং বিশ্লেষণের জন্য জিনের একটি নির্দিষ্ট গ্রুপকে পূর্বে ইটাইজ করেছি। এই পদ্ধতিটি বিশ্লেষণ করা জিনের সংখ্যা সীমিত করে, বিশ্লেষণকে সরলীকরণ করে এবং আনুষঙ্গিক ফলাফলের সংখ্যা হ্রাস করে। শুধুমাত্র যখন, প্রাসঙ্গিক প্যানেল(গুলি) সহ বিশ্লেষণাত্মক ক্ষেত্রের শেষে, জেনেটিক ফলাফল নেতিবাচক ছিল এবং (i) ক্লিনিকাল ফেনোটাইপ স্পষ্টভাবে নির্দেশিত হয়নি বা (ii) বিভিন্ন রোগের বিভাগকে ওভারল্যাপ করে, জেনেটিক বিশ্লেষণ তথাকথিত পর্যন্ত প্রসারিত হয়েছিল "কিডনি পূর্ণ-তালিকা বা কিডনিওম", একটি সুপার প্যানেল যা সাবপ্যানেলে অন্তর্ভুক্ত সমস্ত জিন সমন্বিত।

প্রথম ধাপ হিসেবে, আমরা NGS ফলাফলের ব্যাখ্যার জন্য মানদণ্ডের একটি সেট সংজ্ঞায়িত করেছি। ক্লিনিকাল এক্সোম সিকোয়েন্সিং (সিইএস) এবং ডেটা অ্যালাইনমেন্ট করার পরে, বিশ্লেষণের একটি পাইপলাইন প্রাসঙ্গিক রূপগুলিতে ফিল্টার করার জন্য নির্ধারিত হয়েছিল। বিশেষত, ক্লিনিকাল সন্দেহের উপর ভিত্তি করে, চিহ্নিত বৈকল্পিকগুলি সিলিকো জিন তালিকার উপর ভিত্তি করে ফিল্টার করা হয়েছিল, বিভিন্ন রোগের ম্যাক্রো-শ্রেণির জন্য নির্দিষ্ট। সমার্থক ভেরিয়েন্ট যা স্প্লিসিং মেকানিজমকে প্রভাবিত করে না বা স্প্লিসিং অঞ্চলের মধ্যে ম্যাপিং না করা ইন্ট্রোনিক ভেরিয়েন্টগুলিকে বাদ দেওয়া হয়েছিল, শুধুমাত্র সমার্থক, ননসেন্স, ফ্রেমশিফ্ট, এবং স্প্লিসিং-এফেক্টিং ভেরিয়েন্টগুলিকে বিবেচনা করে। দশ, শুধুমাত্র বিরল বৈকল্পিক (জনসংখ্যার মধ্যে 1% এর কম ফ্রিকোয়েন্সি) এবং কমপক্ষে 0.2 রোগীর অ্যালিল ফ্রিকোয়েন্সি সহ রূপ এবং কমপক্ষে 20 টি পাঠের কভারেজ অন্তর্ভুক্ত ছিল। অবশিষ্ট রূপগুলি (i) উত্তরাধিকারের মোড, (ii) নিউক্লিওটাইড সংরক্ষণ, (iii) প্রোটিনের প্রভাব, স্কোর পরীক্ষা করার জন্য বিভিন্ন ডেটাবেস ব্যবহার করে এবং (iv) সাহিত্য, যদি থাকে তার উপর ভিত্তি করে টীকা এবং আরও কিউরেট করা হয়েছিল। এই মুহুর্তে, ফিল্টার-ইন ভেরিয়েন্টগুলি তথাকথিত "প্রযুক্তিগত প্রতিবেদনে" তালিকাভুক্ত করা হয়েছিল। প্রযুক্তিগত প্রতিবেদনটি একজন মেডিকেল জেনেটিস্ট দ্বারা ব্যাখ্যা করা হয়েছিল যাতে রোগী এবং তার পরিবারের জন্য চূড়ান্ত জেনেটিক রিপোর্ট তৈরি করা হয়। জেনেটিক পরামর্শের সময়, পারিবারিক পৃথকীকরণ অধ্যয়নের প্রস্তাব করা হয়েছিল (i) প্রোব্যান্ডের বৈকল্পিকগুলি নিশ্চিত করার জন্য, এবং (ii) পরিবারে তাদের পৃথকীকরণের উপর ভিত্তি করে অ-কারক বৈকল্পিকগুলি অন্তর্ভুক্ত/বাদ দেওয়ার জন্য (চিত্র 1)।

এই মানদণ্ডগুলি গ্রহণ করে, আমরা জেনেটিক রিপোর্টের তিনটি ভিন্ন বিভাগ সংজ্ঞায়িত করতে সক্ষম হয়েছি। প্রথমত, একটি "নির্ধারিত প্রতিবেদন" যাতে প্যাথোজেনিক (C5) এবং সম্ভাব্য প্যাথোজেনিক (C4) রূপগুলি অন্তর্ভুক্ত ছিল। অজানা তাত্পর্যের (C3) রূপের প্রতিবেদনগুলি শুধুমাত্র ক্লিনিকাল ছবির সাথে পুরোপুরি সামঞ্জস্যপূর্ণ হলে এবং যদি পারিবারিক পৃথকীকরণ অধ্যয়নগুলি তাদের সম্ভাব্য ভূমিকা নিশ্চিত করে তবেই চূড়ান্ত বলে বিবেচিত হত। দ্বিতীয়ত, একটি "অনিশ্চিত প্রতিবেদন" যা CES দ্বারা চিহ্নিত C3 রূপগুলিকে অন্তর্ভুক্ত করে যেগুলি এখনও পারিবারিক পৃথকীকরণ অধ্যয়ন বা C4/C5 রূপের পরিপ্রেক্ষিতে যাচাই করা যায়নি যা সম্পূর্ণরূপে ক্লিনিকাল ফেনোটাইপের সাথে সঙ্গতিপূর্ণ ছিল না। তৃতীয়ত, একটি "অনির্ণয়মূলক প্রতিবেদন" যাতে অন্তর্ভুক্ত ছিল (i) একটি নেতিবাচক CES বিশ্লেষণ, যার অর্থ হল NGS দ্বারা কোনো রূপ শনাক্ত করা হয়নি; (ii) রিসেসিভ জিনের একক রূপ; এবং (iii) C3 রূপগুলি ক্লিনিকাল ফেনোটাইপের সাথে সঙ্গতিপূর্ণ নয়, যখন বিশ্লেষণটি সকলের কাছে প্রসারিত হয়েছিল তখন সনাক্ত করা হয়েছিলকিডনি রোগ-সম্পর্কিত জিন(আকার 1).

নিয়োগকৃত দলটির প্রধান বৈশিষ্ট্য

এই সমীক্ষায় 191 জন শিশু রোগীর (0–18 বছর বয়সী) একটি দলকে বর্ণনা করা হয়েছে যাদেরকে পেডিয়াট্রিক নেফ্রোলজি ইউনিটের দ্বারা ধারাবাহিকভাবে জেনেটিক বিশ্লেষণের জন্য নভেম্বর 2018 থেকে মে 2022 পর্যন্ত রেফার করা হয়েছিল, প্রতি বছর গড়ে 50 জন নতুন রোগী নথিভুক্ত হন। . জেনেটিক পরীক্ষার মানদণ্ড ছিল (i) কিডনি রোগের একটি ইতিবাচক পারিবারিক ইতিহাসের সাথে সম্পর্কিত নেফ্রোপ্যাথি বা (ii) একটি মনোজেনিক অবস্থার ক্লিনিকাল সন্দেহ বা (iii) একটি মনোজেনিক অবস্থাকে বাতিল করতে হবে (যেমন নেফ্রোটিক সিন্ড্রোমের ক্ষেত্রে, যেখানে পার্থক্য করা হয়) মনোজেনিক বনাম নন-মনোজেনিক রোগ রোগ নির্ণয় এবং চিকিত্সার জন্য চিকিত্সাগতভাবে অর্থবহ)।

ক্লিনিকাল সন্দেহের ভিত্তিতে দলটিকে 6টি ভিন্ন রোগের ম্যাক্রো-শ্রেণি বিবেচনা করে বিভক্ত করা হয়েছিল: কিডনি এবং মূত্রনালীর জন্মগত অস্বাভাবিকতা (CAKUT; n=34), সিলিওপ্যাথি (n=39), গ্লোমেরুলোপ্যাথি (n=62), নেফ্রোলিথিয়াসিস (n=22), টাওওপ্যাথিস (n=20) এবং অন্যান্য রোগ যাতে সিন্ড্রোমিক ফেনোটাইপ (n=14) অন্তর্ভুক্ত থাকে। CAKUT এবং টিউবুলোপ্যাথিগুলি ব্যতীত যেগুলি মহিলা এবং পুরুষদের মধ্যে সমান বন্টন দেখায়, অন্যান্য সমস্ত বিভাগে পুরুষ বিষয়ের প্রাদুর্ভাব ছিল (চিত্র 2a)। নিয়োগের বয়সের দিকে তাকালে, "অন্যান্য রোগ" এবং গ্লোমেরুলোপ্যাথিতে যথাক্রমে 6.7 থেকে 10 বছর বয়সী গড় বয়স সহ বিভিন্ন গোষ্ঠীর মধ্যে উল্লেখযোগ্যভাবে আলাদা কোনো বন্টন হাইলাইট করা হয়নি। যাইহোক, গড় বয়সের দিকে তাকালে, জন্মগত ফেনোটাইপের সাথে মিল রেখে CAKUT ডিস ইজিস সর্বনিম্ন মান (4.6 বছর বয়সী) দেখিয়েছে। জাতিগত দৃষ্টিকোণ থেকে, রোগের ম্যাক্রো-শ্রেণি থেকে মুক্ত, বেশিরভাগ রোগী ইউরোপীয়, তার পরে আফ্রিকান, মাত্র কয়েকজন রোগী এশিয়ান, ল্যাটিন-আমেরিকান বা ক্রসব্রেড (চিত্র 2বি)। দলগুলির মধ্যে, মাত্র 8 জন রোগীর অভিভাবক ছিলেন।

চিত্র 1 জেনেটিক ডেটা বিশ্লেষণ পাইপলাইন এবং বৈকল্পিক অন্তর্ভুক্তির জন্য মানদণ্ড। সমস্ত ফিল্টারিং-ইন এবং ফিল্টারিং-আউট মানদণ্ড সহ বৈকল্পিক সনাক্তকরণ এবং অগ্রাধিকারের জন্য গৃহীত বিশ্লেষণাত্মক পাইপলাইনের পরিকল্পিত উপস্থাপনা। ফলাফলের রূপগুলি চূড়ান্ত জেনেটিক রিপোর্টে অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছিল। যখনই সম্ভব, বৈকল্পিক(গুলি) বৈধতা এবং পারিবারিক পৃথকীকরণ অধ্যয়ন করা হয়েছিল। জেনেটিক রিপোর্টগুলি নির্দেশিত মানদণ্ডের উপর ভিত্তি করে চূড়ান্ত, অনিশ্চিত বা অনিশ্চিত হিসাবে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়েছিল। এই শ্রেণীবিভাগের উপর ভিত্তি করে আমাদের পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং (এনজিএস) কর্মপ্রবাহের ডায়াগনস্টিক হার গণনা করা হয়েছিল। 1 কেজি: 1000 জিনোম ডাটাবেস; Alt fr: পরিবর্তিত ফ্রিকোয়েন্সি; C3: অজানা তাত্পর্যের বৈকল্পিক; C4: সম্ভাব্য প্যাথোজেনিক বৈকল্পিক; C5: প্যাথোজেনিক বৈকল্পিক; AR: অটোসোমাল রিসেসিভ

অবশেষে, পুরুষ এবং মহিলা বিষয়গুলিকে আলাদাভাবে বিবেচনা করে কিডনি রোগের জন্য পারিবারিক ইতিহাস বিবেচনা করার সময়, বিভিন্ন রোগের বিভাগ বিবেচনা করে ইতিবাচক এবং নেতিবাচক ক্ষেত্রে বণ্টনে ভিন্নতা স্পষ্ট ছিল। সামগ্রিকভাবে, বেশিরভাগ নিয়োগকৃত দল এবং লিঙ্গ থেকে স্বাধীনভাবে একটি ইতিবাচক পারিবারিক ইতিহাস দ্বারা চিহ্নিত করা হয়নি, যেমন CAKUT, গ্লোমেরুলোপ্যাথি, টাওওপ্যাথি এবং অন্যান্য কিডনি রোগের জন্য দেখানো হয়েছে। যাইহোক, সিলিওপ্যাথিস এবং নেফ্রোলিথিয়াসিসে, একটি ইতিবাচক পরিবারের সাথে তার ঘটনাগুলির একটি উল্লেখযোগ্য অনুপাত নারী এবং পুরুষদের মধ্যে আলাদা বন্টনের সাথে উপস্থাপন করা হয়েছে (সিলিওপ্যাথির জন্য 22টির মধ্যে 13টি এবং নেফ্রোলিথিয়াসিসের জন্য 12টির মধ্যে 5টি; চিত্র 2c)।

ক্লিনিকাল দৃষ্টিকোণ থেকে, দলটি বিভিন্ন প্রাথমিক রোগের সাথে বেশ ভিন্নধর্মী ছিল (চিত্র 2d)। তাদের মধ্যে, সবচেয়ে পুনরাবৃত্ত ক্লিনিকাল sus picions ছিল পলিসিস্টিক কিডনি রোগ (n=27), CAKUT (n=25), নেফ্রোটিক সিনড্রোম (n=19), ফোকাল সেগমেন্টাল গ্লোমেরুলোস্ক্লেরোসিস (FSGS; n) =14) এবং আলপোর্ট সিন্ড্রোম (n=13; চিত্র 2d)।

সাপোর্টিভ সার্ভিস অফ ওয়েসিস্তানচে- চীনের বৃহত্তম সিস্টানচে রপ্তানিকারক:

ইমেল:wallence.suen@wecistanche.com

Whatsapp/টেল:+86 15292862950

আরও স্পেসিফিকেশন বিশদ বিবরণের জন্য কেনাকাটা করুন:

https://www.xjcistanche.com/cistanche-shop

কিডনির সংক্রমণের জন্য 25% ইচিনাকোসাইড এবং 9% অ্যাকটিওসাইড সহ প্রাকৃতিক জৈব সিস্টানচে নির্যাস পেতে এখানে ক্লিক করুন