অংশ Ⅰ তিনটি ইউরোলজিক ক্যান্সারের জন্য একটি ইমিউন-সম্পর্কিত জিন জোড়া স্বাক্ষরের সনাক্তকরণ এবং বৈধতা

বিমূর্ত

পুনরাবৃত্তির জন্য উচ্চ ঝুঁকিতে ইউরোলজিক ক্যান্সার রোগীদের চিনতে নির্ভরযোগ্য বায়োমার্কার প্রয়োজন। এই গবেষণায়, আমরা একই সাথে তিনটি ইউরোলজিক ক্যান্সারের পুনরাবৃত্তির পূর্বাভাস দেওয়ার জন্য একটি অভিনব ইমিউন-সম্পর্কিত জিন জোড়া স্বাক্ষর তৈরি করেছি। আমরা মূত্রাশয়, প্রোস্টেট এবং কিডনি ক্যান্সার সহ 14টি সর্বজনীনভাবে উপলব্ধ জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইল সংগ্রহ করেছি। মোট 2,700টি নমুনা প্রশিক্ষণ সেট (n=1,622) এবং বৈধতা সেটে (n=1,078) শ্রেণিবদ্ধ করা হয়েছিল। 41টি অনন্য জিন সমন্বিত 25টি ইমিউন-সম্পর্কিত জিন জোড়া স্বাক্ষর সর্বনিম্ন পরম সংকোচন এবং নির্বাচন অপারেটর রিগ্রেশন বিশ্লেষণ এবং কক্স রিগ্রেশন মডেল দ্বারা তৈরি করা হয়েছিল। স্বাক্ষরটি মেটা-প্রশিক্ষণ সেট এবং এর উপ-জনসংখ্যাতে উল্লেখযোগ্যভাবে ভিন্ন রিল্যাপস-মুক্ত বেঁচে থাকার সাথে উচ্চ- এবং কম-ঝুঁকির গোষ্ঠীতে রোগীদের স্তরিত করে এবং এটি ইউরোলজিক ক্যান্সারের একটি স্বাধীন প্রগনোস্টিক ফ্যাক্টর ছিল। এই স্বাক্ষরটি মেটা-বৈধকরণ এবং একাধিক স্বতন্ত্র বৈধকরণ দলগুলির একটি শক্তিশালী ক্ষমতা দেখিয়েছে। ইমিউন এবং প্রদাহজনক প্রতিক্রিয়া, কেমোট্যাক্সিস এবং সাইটোকাইন কার্যকলাপ স্বাক্ষরের সাথে প্রাসঙ্গিক জিন দিয়ে সমৃদ্ধ করা হয়েছিল। M1 ম্যাক্রোফেজগুলির একটি উল্লেখযোগ্যভাবে উচ্চতর অনুপ্রবেশের স্তর উচ্চ-ঝুঁকিপূর্ণ গোষ্ঠী বনাম কম-ঝুঁকিপূর্ণ গোষ্ঠীতে পাওয়া গেছে। উপসংহারে, ইউরোলজিক ক্যান্সারে আক্রান্ত রোগীদের রিল্যাপস-মুক্ত বেঁচে থাকার ভবিষ্যদ্বাণী করার জন্য আমাদের স্বাক্ষর একটি প্রতিশ্রুতিবদ্ধ প্রগনোস্টিক বায়োমার্কার।

কীওয়ার্ড

ইউরোলজিক ক্যান্সার; বায়োমার্কার; ইমিউন-সম্পর্কিত জিন জোড়া; পুনরাবৃত্তি-মুক্ত বেঁচে থাকা; প্রগনোস্টিক বায়োমার্কার;Cistanche এর সুবিধা.

সম্পর্কে আরো তথ্য পেতে এখানে ক্লিক করুনCistanche এর প্রভাব কি?

ভূমিকা

মূত্রাশয় ক্যান্সার, প্রোস্টেট ক্যান্সার এবং কিডনি ক্যান্সার হল মূত্রতন্ত্রের প্রধান টিউমার এবং প্রতি বছর প্রায় 2.4 মিলিয়ন নতুন কেস নির্ণয় করা হয় [1]। লক্ষ্যযুক্ত থেরাপি এবং নিওঅ্যাডজুভেন্ট থেরাপির অগ্রগতি রোগীদের বেঁচে থাকাকে দীর্ঘায়িত করেছে [2-4]। যাইহোক, অনেক রোগী সম্পূর্ণ অস্ত্রোপচারের পরেও পুনরায় সংক্রমণের শিকার হন [5-7], এবং তাদের পূর্বাভাস এখনও আশাবাদী নয়। একটি নির্ভরযোগ্য প্রগনোস্টিক বায়োমার্কার যা পুনরাবর্তনের জন্য উচ্চ ঝুঁকিযুক্ত রোগীদের সনাক্ত করতে পারে এবং থেরাপির প্রতিক্রিয়া আছে এমন রোগীদের বেছে নিতে পারে যা ইউরোলজিক ক্যান্সার পরিচালনার জন্য মূল্যবান হবে।

মূত্রাশয় ক্যান্সার [8, 9], প্রোস্টেট ক্যান্সার [10, 11], এবং কিডনি ক্যান্সার [12, 13] এর বেঁচে থাকার স্তরবিন্যাসের জন্য জিন-অভিব্যক্তি স্বাক্ষর চিহ্নিত করা হয়েছে। যাইহোক, প্রশিক্ষণ ডেটাসেটের অতিরিক্ত ফিটিং বা পর্যাপ্ত বৈধতার অভাবের কারণে বেশিরভাগ বায়োমার্কারকে ক্লিনিকাল অনুশীলনে অনুবাদ করা হয়নি [14]। পর্যাপ্ত বড় আকারের পাবলিক জিন এক্সপ্রেশন ডেটাসেট [15, 16] দ্বারা আরও নির্ভরযোগ্য প্রগনোস্টিক বায়োমার্কার বিকাশের একটি সুযোগ আনা হয়েছে। যাইহোক, বিভিন্ন প্ল্যাটফর্ম থেকে প্রাপ্ত ডেটা একত্রিত করা একটি চ্যালেঞ্জ। প্রথাগত পদ্ধতিটি একাধিক প্ল্যাটফর্মের প্রযুক্তিগত পক্ষপাত এবং জৈবিক বৈচিত্র্যের কারণে বিভিন্ন ডেটাসেটকে স্বাভাবিক করা কঠিন করে তুলেছে [17, 18]। জিন এক্সপ্রেশন স্তরের আপেক্ষিক র‌্যাঙ্কিংয়ের উপর ভিত্তি করে নতুন পদ্ধতিগুলি ডেটা প্রিপ্রসেসিংয়ের প্রয়োজনীয়তা দূর করতে ব্যবহার করা হয়েছে এবং অনেক অ্যাপ্লিকেশনে শক্তিশালী ফলাফল অর্জন করেছে [19-21]।

ক্রমবর্ধমান প্রমাণগুলি ইঙ্গিত করেছে যে টিউমার ইমিউন মাইক্রোএনভায়রনমেন্ট তিনটি প্রধান ইউরোলজিক টিউমারের [22-24] গঠন এবং অগ্রগতির সাথে সম্পর্কযুক্ত। ইমিউন চেকপয়েন্ট অণু, যেমন প্রোগ্রামড সেল ডেথ 1 (PD-1), PD-1 ligand 1 (PD-L1), এবং সাইটোটক্সিক টি-লিম্ফোসাইট যুক্ত অ্যান্টিজেন 4 (CTLA-4) , মূত্রাশয় ক্যান্সার [25, 26], প্রোস্টেট ক্যান্সার [27, 28] এবং কিডনি ক্যান্সার [29, 30] এ একটি উল্লেখযোগ্য, টেকসই প্রতিক্রিয়া প্রদর্শন করেছে। টিউমার ইমিউন মাইক্রোএনভায়রনমেন্ট সম্পর্কিত বায়োমার্কারগুলি এইভাবে ইউরোলজিক ক্যান্সারের প্রাগনোস্টিক মার্কার হিসাবে সম্ভাবনা থাকতে পারে।

যেমনটি সুপরিচিত, মূত্রাশয় ক্যান্সার, প্রোস্টেট ক্যান্সার এবং কিডনি ক্যান্সার শারীরবৃত্তীয়ভাবে ঘনিষ্ঠভাবে সম্পর্কিত এবং অনুরূপ অপমানের ফলে যা টিউমার গঠনকে উৎসাহিত করে [31-33]। অতএব, আমরা এই গবেষণায় ইমিউন-সম্পর্কিত জিন জোড়ার (IRGPs) উপর ভিত্তি করে একটি স্বাক্ষর তৈরি করেছি যা একই সাথে মূত্রাশয় ক্যান্সার, প্রোস্টেট ক্যান্সার এবং কিডনি ক্যান্সারের পুনরাবৃত্তির পূর্বাভাস দিতে পারে।

Cistanche tubulosa

উপকরণ এবং পদ্ধতিসমূহ

1. অধ্যয়ন নকশা এবং ডেটাসেট

আমরা মূত্রাশয়, প্রোস্টেট এবং কিডনি ক্যান্সারের তিনটি ইউরোলজিক টিউমারে 14 টি জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইল ব্যাপকভাবে বিশ্লেষণ করেছি, যার মধ্যে সাতটি মাইক্রোয়ারে ডেটাসেট এবং সাতটি আরএনএ-সেক ডেটাসেট রয়েছে (পরিপূরক চিত্র 1)। এই জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইলগুলির অ্যাক্সেস নম্বর, প্ল্যাটফর্ম এবং নমুনার আকারগুলি পরিপূরক সারণী 1 এ দেখানো হয়েছে। RNA-Seq ডেটা UCSC Xena এবং ইন্টারন্যাশনাল ক্যান্সার জিনোম কনসোর্টিয়াম (ICGC) থেকে ডাউনলোড করা হয়েছে। মাইক্রোয়ারে ডেটা জিন এক্সপ্রেশন অমনিবাস (জিইও) থেকে ডাউনলোড করা হয়েছিল। দ্য ক্যান্সার জিনোম অ্যাটলাস (টিসিজিএ) এর কোহর্টগুলি প্রশিক্ষণ সেট হিসাবে ব্যবহার করা হয়েছিল এবং অন্যান্য ডেটাসেটগুলিকে বৈধতা সেট হিসাবে ব্যবহার করা হয়েছিল। শুধুমাত্র সম্পূর্ণ বেঁচে থাকার তথ্য সহ রোগীদের অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছিল। আমরা সেই সমস্ত রোগীদেরও বাদ দিয়েছি যারা রেডিয়েশন থেরাপি, নিওঅ্যাডজুভেন্ট থেরাপি, এবং সমস্ত স্বাধীন প্রশিক্ষণ দলে লক্ষ্যযুক্ত আণবিক থেরাপি পেয়েছিলেন। মোট, 2,700 টি কেস আমাদের গবেষণায় অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছিল। আমাদের প্রকল্প চংকিং মেডিকেল বিশ্ববিদ্যালয়ের নৈতিক পর্যালোচনা কমিটি দ্বারা অনুমোদিত হয়েছে।

2. জিন এক্সপ্রেশন ডেটা প্রসেসিং

GEO থেকে সর্বজনীনভাবে উপলব্ধ ডেটাসেটগুলিকে প্রথমে 'limma' প্যাকেজে প্রয়োগ করা normalizeBetweenArrays ফাংশন ব্যবহার করে স্বাভাবিক করা হয়েছিল এবং তারপরে আরও লগ-রূপান্তরিত করা হয়েছিল। টিসিজিএ এবং আইসিজিসি কোহর্টগুলিতে স্বাভাবিককরণ পদ্ধতি ব্যবহার করা হয়নি।

3. পূর্বাভাসের পূর্বাভাসের জন্য নির্দিষ্ট আইআরজিপিগুলির সনাক্তকরণ

আমরা ৩/৩/২0২১ তারিখে অ্যাক্সেস করা ImmPort ডাটাবেস থেকে ইমিউন-সম্পর্কিত জিন (IRGs) ডাউনলোড করেছি। 2,483টি অনন্য IRG, সাইটোকাইনস, সাইটোকাইন রিসেপ্টর, অ্যান্টিজেন প্রসেসিং, প্রেজেন্টেশন পাথওয়ে, ইন্টারলিউকিনস, ন্যাচারাল কিলার সেল সাইটোটক্সিসিটি, TGFb, এবং TNF পরিবারের সদস্য সহ 17টি বিভাগ গঠন করে। সমস্ত স্বাধীন ট্রেনিং সেটে শুধুমাত্র IRG গুলিই সমস্ত প্ল্যাটফর্ম দ্বারা পরিমাপ করা হয়েছে যার মধ্যম পরম বিচ্যুতি > 0.5 বেছে নেওয়া হয়েছে৷ প্রতিটি IRGP-এর স্কোর প্রোফাইলের একটি নির্দিষ্ট নমুনায় জিন এক্সপ্রেশন স্তরের যুগলভাবে তুলনা করে তৈরি করা হয়েছিল। IRGs স্কোর 1 হিসাবে সংজ্ঞায়িত করা হয়েছিল যদি IRG 1 এর এক্সপ্রেশন লেভেল IRG 2 থেকে বড় হয়; অন্যথায়, IRGPs স্কোর 0 হিসাবে সেট করা হয়েছিল [34]। যেকোনো পৃথক ডেটাসেটে ধ্রুবক মান সহ IRGPs অপসারণের পরে, অবশিষ্ট IRGPগুলিকে আরও বিশ্লেষণ করা হয়েছিল।

4. পূর্বাভাসের পূর্বাভাসের জন্য ইমিউন-সম্পর্কিত জিন জোড়া সূচক (IRGPI) নির্মাণ

নিম্নলিখিত পদক্ষেপের উপর ভিত্তি করে প্রাগনোস্টিক আইআরজিপি নির্বাচন করা হয়েছিল। প্রথমত, রোগীদের রিল্যাপস-ফ্রি সারভাইভাল (RFS) ভবিষ্যদ্বাণী করার জন্য প্রতিটি IRGP-এর ভবিষ্যদ্বাণীমূলক ক্ষমতা মেটা-ট্রেনিং ডেটাসেটে কক্স রিগ্রেশন মডেল ব্যবহার করে মূল্যায়ন করা হয়েছিল, এবং একটি পি-মান সহ IRGPs < 0.05 প্রাথমিক প্রার্থী চিহ্নিতকারী হিসাবে নির্বাচিত হয়েছিল। দ্বিতীয়ত, ন্যূনতম পরম সংকোচন এবং নির্বাচন অপারেটর (LASSO) বিশ্লেষণ আরও কিছু কম তথ্যপূর্ণ IRGPs ফিল্টার করার জন্য ব্যবহার করা হয়েছিল। টিউনিং প্যারামিটারটি নির্ধারণ করা হয়েছিল প্রত্যাশিত সাধারণীকরণ ত্রুটি দ্বারা অনুমান করা হয়েছে 10-ফোল্ড ক্রস-ভ্যালিডেশন থেকে। দৃঢ়তা উন্নত করার জন্য, আমরা এলোমেলোভাবে সম্পূর্ণ মেটা-ট্রেনিং ডেটাসেটকে 2:1 অনুপাত সহ নতুন প্রশিক্ষণ এবং টেস্টিং ডেটাসেটে বিভক্ত করেছি এবং IRGPs নির্বাচন পদ্ধতিকে স্থিতিশীল করতে র্যান্ডম স্প্লিট স্কিমটি 30 বার পুনরাবৃত্তি করেছি। LASSO মডেলটি তখন 30টি প্রশিক্ষণ সেটে প্রয়োগ করা হয়েছিল, এবং 15 ফ্রিকোয়েন্সি সহ সেই আইআরজিপিগুলি নির্বাচন করা হয়েছিল। অবশেষে, মাল্টিভেরিয়েট কক্স রিগ্রেশন মডেলটি আইআরজিপি-ভিত্তিক ভবিষ্যদ্বাণী মডেল তৈরি করতে এবং সমস্ত নমুনার জন্য আইআরজিপিআই তৈরি করতে ব্যবহৃত হয়েছিল। মধ্যমা আইআরজিপিআই মান ব্যবহার করে রোগীদের নিম্ন এবং উচ্চ-প্রতিরোধী ঝুঁকি গ্রুপে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়েছিল।

Cistanche নির্যাস

5. IRGPI এর মূল্যায়ন এবং বৈধতা

The prognostic value of the IRGPI was evaluated in the meta-training and independent training sets and was further verified in the meta-validation and multiple independent validation sets. The log-rank test and time-dependent receiver operating characteristic (ROC) curves were adopted to assess the prognostic accuracy of the IRGPI. We combined IRGPI with clinical factors of age, gender, and tumor stage in multivariate Cox analyses. Age (>60) 1-এ রূপান্তরিত হয়েছিল এবং বয়স (<60) was transformed into 0. Stages III and IV were transformed into 1, and stage I and II were transformed into 0.

6. অনুপ্রবেশকারী ইমিউন কোষের প্রোফাইলিং

CIBERSORT বাল্ক-টিউমার জিন এক্সপ্রেশন প্রোফাইল ব্যবহার করে ইমিউন কোষের গঠনকে চিহ্নিত করে [35]। এটি রেফারেন্স জিন এক্সপ্রেশন মান (LM22) [35] এর উপর ভিত্তি করে 22 ধরনের অনুপ্রবেশকারী ইমিউন কোষের আপেক্ষিক অনুপাত অনুমান করেছে। এই গবেষণায়, R প্যাকেজ 'CIBERSORT' ব্যবহার করে 22টি অনুপ্রবেশকারী ইমিউন কোষের অনুপাত নির্ধারণ করা হয়েছিল। পারমটি 1,000 এ সেট করা হয়েছিল, এবং আরও বিশ্লেষণের জন্য CIBERSORT আউটপুট p-মান < 0.05 সহ কেস নির্বাচন করা হয়েছিল৷ উইলকক্সন র্যাঙ্ক সমষ্টি পরীক্ষাটি উচ্চ এবং নিম্ন IRGPI গ্রুপের মধ্যে ইমিউন সেল সাব-টাইপের পার্থক্য তুলনা করার জন্য ব্যবহার করা হয়েছিল।

7. জিন অন্টোলজি (GO) বিশ্লেষণ

আর প্যাকেজ 'ক্লাস্টারপ্রোফাইলার' মেটা-ট্রেনিং কোহর্টে আইআরজিপিআই সম্পর্কিত জিনের জিও সমৃদ্ধকরণ বিশ্লেষণ পরিচালনা করতে ব্যবহার করা হয়েছিল। বেঞ্জামিনিহোচবার্গ-অ্যাডজাস্টেড p-মান < 0.05 (মিথ্যা আবিষ্কারের হার, এফডিআর) তাৎপর্য নির্ধারণের জন্য থ্রেশহোল্ড হিসাবে ব্যবহার করা হয়েছিল।

8. নমোগ্রাম নির্মাণ এবং মূল্যায়ন

IRGPI এবং ক্লিনিকাল ফ্যাক্টরগুলির উপর ভিত্তি করে মেটা-ট্রেনিং কোহর্টে RFS ভবিষ্যদ্বাণীর জন্য একটি পরিমাণগত পদ্ধতির প্রতিষ্ঠার জন্য একটি নমোগ্রাম তৈরি করা হয়েছিল, যা মেটা-বৈধকরণ দলগুলিতে আরও যাচাই করা হয়েছিল। প্রতিটি ফ্যাক্টরের জন্য একটি পয়েন্ট গণনা করা হয়েছিল, এবং 1, 3, 5 এবং 10 বছরে RFS হারের অনুমানের জন্য সমস্ত কারণের মোট পয়েন্ট প্রাপ্ত করা হয়েছিল। ক্রমাঙ্কন প্লটগুলি তখন নমোগ্রামের নির্ভরযোগ্যতা মূল্যায়নের জন্য আঁকা হয়েছিল।

প্রমিত Cistanche

9. পরিসংখ্যানগত বিশ্লেষণ

কক্স রিগ্রেশন মডেল, ল্যাসো মডেল, কাপলান-মেয়ার বক্ররেখা, সময় নির্মাণের জন্য R প্যাকেজ 'সারভাইভাল', 'জিএলএমনেট', 'শিওর মাইনার', 'টাইমআরওসি', 'আরএমএস', 'সিআইবারসোর্ট' এবং 'ক্লাস্টারপ্রোফাইলার' ব্যবহার করা হয়েছিল -নির্ভর ROC বক্ররেখা, নোমোগ্রাম, ইমিউন সেল কম্পোজিশন গণনা এবং জিও বিশ্লেষণ। RFS-এর সাথে IRGPI স্কোরের অ্যাসোসিয়েশন লগ-র‍্যাঙ্ক পরীক্ষার দ্বারা বিশ্লেষণ করা হয়েছিল। কক্স রিগ্রেশন মডেলটি RFS-এর সাথে IRGPI-এর অ্যাসোসিয়েশনের বহুমুখী বিশ্লেষণ করার জন্য গৃহীত হয়েছিল। একটি দ্বি-পার্শ্বযুক্ত p-মান < 0৷{8}}5 সমস্ত পরীক্ষার জন্য পরিসংখ্যানগতভাবে তাৎপর্যপূর্ণ বলে বিবেচিত হয়েছিল৷ সমস্ত পরিসংখ্যান বিশ্লেষণ R (সংস্করণ 4.0.2) ব্যবহার করে পরিচালিত হয়েছিল।

তথ্যসূত্র

1. Sung H, Ferlay J, Siegel RL, Laversanne M, Soerjomataram I, Jemal A, Bray F. গ্লোবাল ক্যান্সার পরিসংখ্যান 2020: GLOBOCAN 185টি দেশে 36 টি ক্যান্সারের জন্য বিশ্বব্যাপী ঘটনা এবং মৃত্যুর অনুমান। সিএ ক্যান্সার জে ক্লিন। 2021; 71:209-49।

2. Seiler R, Oo HZ, Tortora D, Clausen TM, Wang CK, Kumar G, Pereira MA, Ørum-Madsen MS, Agerbæk MØ, Gustavsson T, Nordmaj MA, Rich JR, Lallous N, et al. একটি অনকোফেটাল গ্লাইকোসামিনোগ্লাইকান পরিবর্তন সিসপ্ল্যাটিন-প্রতিরোধী মূত্রাশয় ক্যান্সারের থেরাপিউটিক অ্যাক্সেস প্রদান করে। ইউর উরোল। 2017; 72:142-50।

3. Maroto P, Solsona E, Gallardo E, Mellado B, Morote J, Arranz JÁ, Gómez-Veiga F, Unda M, Clement MÁ, Alcaraz A. ক্যাস্ট্রেশন-প্রতিরোধী প্রোস্টেট ক্যান্সারের চিকিৎসায় প্রথম সারির থেরাপির বিষয়ে বিশেষজ্ঞের মতামত . Crit Rev Oncol Hematol. 2016; 100:127-36।

4. Fu Q, Xu L, Wang Y, Jiang Q, Liu Z, Zhang J, Zhou Q, Zeng H, Tong S, Wang T, Qi Y, Hu B, Fu H, et al. টিউমার-সম্পর্কিত ম্যাক্রোফেজ থেকে প্রাপ্ত ইন্টারলিউকিন-23 ইমিউন ইভেশনের সাথে কিডনি ক্যান্সার গ্লুটামিন আসক্তিকে ইন্টারলিঙ্ক করে। ইউর উরোল। 2019; 75:752-63।

5. ঝাও জেড, ওয়াং ওয়াই, ঝাং জেজে, হুয়াং এক্সওয়াই। ফ্যাসিন ইনহিবিটরগুলি কোষের স্থানান্তর এবং আনুগত্য হ্রাস করে যখন ইঁদুর বহনকারী মূত্রাশয় ক্যান্সারের সামগ্রিক বেঁচে থাকা বাড়ায়। ক্যান্সার (ব্যাসেল)। 2021; 13:2698।

6. পেলটোমা এআই, রাইটিনেন পি, তালালা কে, তারি কে, তামেলা টিএল, আউভিনেন এ, মুরটোলা টিজে। স্ট্যাটিন ব্যবহারকারীদের মধ্যে অ্যান্ড্রোজেন বঞ্চনা থেরাপি শুরু করার পরে প্রোস্টেট ক্যান্সারের পূর্বাভাস। একটি জনসংখ্যা-ভিত্তিক সমগোত্রীয় গবেষণা। প্রোস্টেট ক্যান্সার প্রোস্ট্যাটিক ডিস। 2021; 24:917-24।

7. তিয়ান এম, ওয়াং টি, ওয়াং পি. কিডনি ক্যান্সারে একাধিক মেশিন লার্নিং অ্যালগরিদমের উপর ভিত্তি করে সাত-জিন প্রগনোস্টিক স্বাক্ষরের বিকাশ এবং ক্লিনিকাল বৈধতা। সেল ট্রান্সপ্লান্ট। 2021; 30:963689720969176।

8. Zhang C, Gou X, He W, Yang H, Yin H. একটি গ্লাইকোলাইসিস-ভিত্তিক 4-mRNA স্বাক্ষর মূত্রাশয় ক্যান্সারে আক্রান্ত রোগীদের পূর্বাভাস এবং কোষ চক্র প্রক্রিয়ার সাথে সম্পর্কযুক্ত। ক্যান্সার সেল int. 2020; 20:177।

9. চেন এস, ঝাং এন, শাও জে, ওয়াং টি, ওয়াং এক্স। একটি অভিনব জিন স্বাক্ষর সংমিশ্রণ মূত্রাশয় ক্যান্সারে সামগ্রিকভাবে বেঁচে থাকার পূর্বাভাস উন্নত করে। জে ক্যান্সার। 2019; 10:5744-53।

10. Xu Z, Xu L, Liu L, Li H, Jin J, Peng M, Huang Y, Xiao H, Li Y, Guan H. একটি গ্লাইকোলাইসিস-সম্পর্কিত পাঁচ-জিনের স্বাক্ষর প্রোস্টেট রোগীদের জৈব রাসায়নিক পুনরাবৃত্তি-মুক্ত বেঁচে থাকার পূর্বাভাস দেয় অ্যাডেনোকার্সিনোমা। ফ্রন্ট অনকল। 2021; 11:625452।

11. Nguyen HT, Xue H, Firlej V, Ponty Y, Gallopin M, Gauthier D. প্রস্টেট ক্যান্সারের পূর্বাভাসের জন্য রেফারেন্স-মুক্ত ট্রান্সক্রিপ্টোম স্বাক্ষর। বিএমসি ক্যান্সার। 2021; 21:394।

12. লু জে, কিয়ান সি, জি ওয়াই, বাও কিউ, লু বি. ব্রোমোডোমেন জিনের সাথে যুক্ত জিনের স্বাক্ষর কিডনি রেনাল ক্লিয়ার সেল কার্সিনোমার পূর্বাভাস দেয়। সামনের জিনেট। 2021; 12:643935।

13. উ ওয়াই, ওয়েই এক্স, ফেং এইচ, হু বি, লিউ বি, লুয়ান ওয়াই, রুয়ান ওয়াই, লিউ এক্স, লিউ জেড, লিউ জে, ওয়াং টি। ক্লিয়ার সেল রেনাল সেলের জন্য একটি রেডক্স-সম্পর্কিত প্রগনোস্টিক স্বাক্ষর সনাক্ত করতে সমন্বিত বিশ্লেষণ কার্সিনোমা। অক্সিড মেড সেল Longev. 2021; 2021:6648093।

14. Shi R, Bao X, Unger K, Sun J, Lu S, Manapov F, Wang X, Belka C, Li M. ক্লিনিকাল ফলাফল এবং স্টেজ I ফুসফুসের অ্যাডেনোকার্সিনোমা রোগীদের থেরাপিউটিক প্রতিক্রিয়া ভবিষ্যদ্বাণী করতে হাইপোক্সিয়া প্রাপ্ত জিনের স্বাক্ষর সনাক্তকরণ এবং বৈধতা . থেরানোস্টিকস। 2021; 11:5061-76।

15. ব্রেন্ডেল এম, বার্থেল এইচ, ভ্যান ইমারেন টি, মারেক কে, বেয়ার এল, গান এম, প্যালেইস সি, গেহমেয়ার এম, ফিয়েটজেক ইউ, রেসপন্ডেক জি, সাউয়ারবেক জে, নিটসম্যান এ, জাচ সি, এট আল। প্রগতিশীল সুপারনিউক্লিয়ার পালসিতে বায়োমার্কার হিসাবে 18F-PI-2620-এর মূল্যায়ন। জামা নিউরোল। 2020; 77:1408-19।

16. Lee ES, Jung SY, Kim JY, Kim JJ, Yoo TK, Kim YG, Lee KS, Lee ES, Kim EK, Min JW, Han W, Noh DY, Moon HG৷ দূরবর্তী মেটাস্ট্যাসিস সহ স্তন ক্যান্সারের রোগীদের মধ্যে সম্ভাব্য দীর্ঘমেয়াদী বেঁচে থাকা ব্যক্তিদের সনাক্ত করা। অ্যান অনকল। 2016; 27:828-33।

17. ফ্রাঙ্কস জেএম, কাই জি, হুইটফিল্ড এমএল। বৈশিষ্ট্য-নির্দিষ্ট কোয়ান্টাইল স্বাভাবিককরণ জিন এক্সপ্রেশন ডেটা ব্যবহার করে আণবিক উপপ্রকারের ক্রস-প্ল্যাটফর্ম শ্রেণীবিভাগকে সক্ষম করে। বায়োইনফরমেটিক্স। 2018; 34:1868-74।

18. Shen Y, Rahman M, Piccolo SR, Gusenleitner D, ElChaar NN, Cheng L, Monti S, Bild AH, Johnson WE। একাধিক ভিন্ন ভিন্ন জৈবিক পথের প্রসঙ্গ-নির্দিষ্ট জিনোমিক প্রোফাইলিং বরাদ্দ করুন। বায়োইনফরমেটিক্স। 2015; 31:1745-53।

19. Wu J, Zhao Y, Zhang J, Wu Q, Wang W. কোলোরেক্টাল ক্যান্সারে একটি ইমিউন-সম্পর্কিত জিন জোড়া স্বাক্ষরের বিকাশ এবং বৈধতা। অনকোইমিউনোলজি। 2019; ৮:১৫৯৬৭১৫।

20. Xu F, Zhan X, Zheng X, Xu H, Li Y, Huang X, Lin L, Chen Y. ইমিউন-সম্পর্কিত জিন জোড়ার একটি স্বাক্ষর ফুসফুসের অ্যাডেনোকার্সিনোমাতে অনকোলজিক ফলাফল এবং ইমিউনোথেরাপির প্রতিক্রিয়ার পূর্বাভাস দেয়। জিনোমিক্স। 2020; 112:4675–83।

21. ওয়াং এস, জু এক্স। গ্লিওব্লাস্টোমায় বেঁচে থাকার পূর্বাভাসের জন্য একটি ইমিউন-সম্পর্কিত জিন জোড়া স্বাক্ষর। ফ্রন্ট অনকল। 2021; 11:564960।

22. Pfannstiel C, Strissel PL, Chiappinelli KB, Sikic D, Wach S, Wirtz RM, Wullweber A, Taubert H, Breyer J, Otto W, Worst T, Burger M, Wullich B, et al, এবং BRIDGE কনসোর্টিয়াম, জার্মানি। টিউমার ইমিউন মাইক্রোএনভায়রনমেন্ট একটি প্রাগনোস্টিক প্রাসঙ্গিকতা চালায় যা মূত্রাশয় ক্যান্সারের উপপ্রকারের সাথে সম্পর্কযুক্ত। ক্যান্সার ইমিউনল রেস 2019; 7:923-38।

23. লং এক্স, হাউ এইচ, ওয়াং এক্স, লিউ এস, দিয়াও টি, লাই এস, হু এম, ঝাং এস, লিউ এম, ঝাং এইচ। প্রোস্টেট ক্যান্সারে এডিটি-প্ররোচিত ইমিউন মাইক্রোএনভায়রনমেন্ট রিমডেলিং দ্বারা চালিত ইমিউন স্বাক্ষর পুনরাবৃত্তির সাথে সম্পর্কিত- বিনামূল্যে বেঁচে থাকা এবং অনাক্রম্য অনুপ্রবেশ। সেল ডেথ ডিস। 2020; 11:779।

24. Vuong L, Kotecha RR, Voss MH, Hakimi AA। ক্লিয়ার-সেল রেনাল সেল কার্সিনোমাতে টিউমার মাইক্রোএনভায়রনমেন্ট ডাইনামিক্স। ক্যান্সার ডিসকভ। 2019; 9:1349-57।

25. Maio M, Blank C, Necchi A, Di Giacomo AM, Ibrahim R, Lahn M, Fox BA, Bell RB, Tortora G, Eggermont AM। নিওঅ্যাডজুভেন্ট ইমিউনোথেরাপি একাধিক টিউমারের ধরন জুড়ে ক্যান্সার ব্যবস্থাপনাকে নতুন আকার দিচ্ছে: ভবিষ্যত এখন! ইউর জে ক্যান্সার। 2021; 152:155-64।

26. Kates M, Nirschl TR, Baras AS, Sopko NA, Hahn NM, Su X, Zhang J, Kochel CM, Choi W, McConkey DJ, Drake CG, Bivalacqua TJ। একটি AntiPD-L1 আংশিক প্রতিক্রিয়াশীল সময়ের জন্য সম্মিলিত পরবর্তী প্রজন্মের সিকোয়েন্সিং এবং ফ্লো সাইটোমেট্রি বিশ্লেষণ: মূত্রাশয় ক্যান্সারে PD-L1 কার্যকলাপ এবং প্রতিরোধের প্রক্রিয়াগুলির অনুসন্ধান। ইউর ইউরোল অনকল। 2021; 4:117-20।

27. শর্মা পি, পাচিনস্কি আরকে, নারায়ণ ভি, ফ্লেচন এ, গ্র্যাভিস জি, গালস্কি এমডি, মোহাম্মদ এইচ, পট্টনায়ক এ, সুবুধি এসকে, সিপ্রোটি এম, সিমসেক বি, সাকি এ, হু ওয়াই, এট আল। মেটাস্ট্যাটিক ক্যাস্ট্রেশন-প্রতিরোধী প্রোস্টেট ক্যান্সারের জন্য নিভোলুমাব প্লাস ইপিলিমুমাব: চেকমেট 650 ট্রায়ালে রোগীদের প্রাথমিক বিশ্লেষণ। ক্যান্সার কোষ। 2020; 38:489–99.e3.

28. Ruiz de Porras V, Pardo JC, Notario L, Etxaniz O, Font A. ইমিউন চেকপয়েন্ট ইনহিবিটরস: মেটাস্ট্যাটিক ক্যাস্ট্রেশন-প্রতিরোধী প্রোস্টেট ক্যান্সারের জন্য একটি প্রতিশ্রুতিশীল চিকিত্সা বিকল্প? Int J Mol Sci. 2021; 22:4712।

29. কামাই টি, কিজিমা টি, সুজুকি টি, নুকুই এ, আবে এইচ, আরাই কে, ইয়োশিদা কেআই। মেটাস্ট্যাটিক রেনাল সেল কার্সিনোমাতে অ্যাডেনোসিন 2A রিসেপ্টরগুলির বর্ধিত প্রকাশ অ্যান্টি-ভাস্কুলার এন্ডোথেলিয়াল গ্রোথ ফ্যাক্টর এজেন্ট এবং অ্যান্টি-পিডি-1/AntiCTLA4 অ্যান্টিবডিগুলির প্রতি দুর্বল প্রতিক্রিয়া এবং সংক্ষিপ্ত বেঁচে থাকার সাথে সম্পর্কিত। ক্যান্সার ইমিউনল ইমিউনোথার। 2021; 70:2009-21।

30. চু জি, জু টি, ঝু জি, লিউ এস, নিউ এইচ, ঝাং এম। রেনাল ক্লিয়ার সেল কার্সিনোমাতে পূর্বাভাস পূর্বাভাস উন্নত করার জন্য একটি উপন্যাস প্রোটিন-ভিত্তিক স্বাক্ষরের সনাক্তকরণ। ফ্রন্ট মোল বায়োসি। 2021; 8:623120।

31. Gorin MA, Verdone JE, van der Toom E, Bivalacqua TJ, Allaf ME, Pienta KJ. প্রোস্টেট, মূত্রাশয় এবং কিডনি ক্যান্সারের বায়োমার্কার হিসাবে টিউমার কোষ সঞ্চালন। ন্যাট রেভ উরোল। 2017; 14:90-7।

32. Tölle A, Suhail S, Jung M, Jung K, Stephan C. প্রোস্টেট, মূত্রাশয়, এবং কিডনি ক্যান্সার সেল লাইনে ফ্যাটি অ্যাসিড বাইন্ডিং প্রোটিন (FABPs) এবং রেনাল সেল কার্সিনোমা রোগীদের বেঁচে থাকার পূর্বাভাস হিসাবে IL-FABP-এর ব্যবহার . বিএমসি ক্যান্সার। 2011; 11:302।

33. জাংউইর্থ এন, হেবারলে এল, শ্রোট কেএম, উলিচ বি, ক্রাউস এফএস। সেরোটোনিন ইউরোলজিক্যাল টিউমারের প্রাগনোস্টিক মার্কার হিসেবে ব্যবহৃত হয়। বিশ্ব জে উরোল। 2008; 26:499-504।

34. Li B, Cui Y, Diehn M, Li R. প্রারম্ভিক-পর্যায়ে ননসকোয়ামাস নন-স্মল সেল ফুসফুসের ক্যান্সারে একটি স্বতন্ত্র ইমিউন প্রগনোস্টিক স্বাক্ষরের বিকাশ এবং বৈধতা। জামা অনকল। 2017; 3:1529-37।

35. Newman AM, Liu CL, Green MR, Gentles AJ, Feng W, Xu Y, Hoang CD, Diehn M, Alizadeh AA। টিস্যু এক্সপ্রেশন প্রোফাইল থেকে সেল উপসেটগুলির শক্তিশালী গণনা। ন্যাট পদ্ধতি। 2015; 12:453-7।

বিয়াও জি 1, কাংজি লি 1, হং ঝাং 1, গুইচুয়ান লাই 1, দাপেং লি 2, জিয়াওনি ঝং 1।

1. জৈব পরিসংখ্যান বিভাগ, স্কুল অফ পাবলিক হেলথ অ্যান্ড ম্যানেজমেন্ট, চংকিং মেডিকেল বিশ্ববিদ্যালয়, চংকিং, চীন

2. হেপাটোলজি ইনস্টিটিউট, সংক্রামক রোগের জন্য জাতীয় ক্লিনিক্যাল রিসার্চ সেন্টার, শেনজেন থার্ড পিপলস হাসপাতাল, শেনজেন, চীন