পার্ট 2 মাটির মাইক্রোবায়োম বিশ্লেষণের উপর ভিত্তি করে তিনটি ইকোটাইপে সিস্তানচে ডেজার্টিকোলার গুণমান পরিবর্তন এবং পরিবেশের মধ্যে নিয়ন্ত্রক সম্পর্ক

পার্ট 1 এর জন্য এখানে ক্লিক করুন

আরো তথ্যের জন্য যোগাযোগ করুন:Joanna.jia@wecistanche.com

মূল মাইক্রোবায়াল সম্প্রদায়ের প্রাচুর্য, PhGs বিষয়বস্তু এবং পরিবেশগত কারণগুলির মধ্যে পারস্পরিক সম্পর্ক।মূলের অপ্রয়োজনীয় বিশ্লেষণ, বায়োমার্কার মাইক্রোবায়োম প্রাচুর্য, পিএইচজি সামগ্রী এবং পরিবেশগত কারণগুলি অর্ডার স্তরে সঞ্চালিত হয়েছিল এবং প্রভাবগুলির ভিত্তিতে পুনঃবিশ্লেষণ করা হয়েছিল। পরিবর্তনের সামঞ্জস্যপূর্ণ ব্যাখ্যা ছিল 82.70 শতাংশ (টেবিল S7)। স্ফিঙ্গোমোনাডেলস পিএইচজি সামগ্রীর 45.7 শতাংশ ব্যাখ্যা করেছে (p=0.002)। Pseudonocardiales 22.4 শতাংশ PhGs বিষয়বস্তু ব্যাখ্যা করেছে (p=0.01)। 2′-অ্যাসিটিল্যাকটিওসিড উল্লেখযোগ্যভাবে ইতিবাচকভাবে সিউডোনোকার্ডিয়ালস এবং ওশেনোস্পিরিলালেসের সাথে সম্পর্কযুক্ত ছিল এবং নেতিবাচকভাবে স্ফিঙ্গোমোনাডালেসের সাথে সম্পর্কযুক্ত ছিল (চিত্র 5a)। ইচিনাকোসাইড স্ফিঙ্গোমোনাডালেসের সাথে উল্লেখযোগ্যভাবে ইতিবাচক ছিল।

সিস্তানচেনির্যাস প্রতিরোধ করতে পারেআলঝেইমাররোগ

বায়োমার্কার প্রাচুর্যের জন্য পারস্পরিক সম্পর্ক বিশ্লেষণ পরিচালিত হয়েছিল,পিএইচজিবিষয়বস্তু (চিত্র S3 এবং টেবিল S5), এবং পরিবেশগত কারণ (সারণী S6)। পারস্পরিক সম্পর্ক নেটওয়ার্কের ফলাফল (চিত্র 5বি) প্রকাশ করেছে যে 2′-অ্যাসিটিল্যাক্টোসিড উল্লেখযোগ্যভাবে ইতিবাচকভাবে ওশেনোস্পিরিলেলস, রাইজোবিয়েলস এবং থিওট্রিকেলসের সাথে সম্পর্কযুক্ত ছিল, যেখানে সমস্ত মাটির নমুনায় সিউডোনোকার্ডিয়ালস এবং নাইট্রোসোমোনাডালেসের সাথে নেতিবাচকভাবে সম্পর্কযুক্ত। হিটম্যাপ (চিত্র 5c–e) প্রকাশ করেছে যে টেবিলসাইড আওয়াস লবণাক্ত-ক্ষারতে গড় বার্ষিক জলীয় বাষ্প চাপের সাথে নেতিবাচকভাবে সম্পর্কযুক্তমূল মাইক্রোবায়াল সম্প্রদায়ের প্রাচুর্য, PhGs বিষয়বস্তু এবং পরিবেশগত কারণগুলির মধ্যে পারস্পরিক সম্পর্ক।মূলের অপ্রয়োজনীয় বিশ্লেষণ, বায়োমার্কার মাইক্রোবায়োম প্রাচুর্য,পিএইচজিবিষয়বস্তু, এবং পরিবেশগত কারণগুলি অর্ডার স্তরে সঞ্চালিত হয়েছিল এবং প্রভাবগুলির ভিত্তিতে পুনর্বিশ্লেষণ করা হয়েছিল। পরিবর্তনের সামঞ্জস্যপূর্ণ ব্যাখ্যা ছিল 82.70 শতাংশ (টেবিল S7)। স্ফিঙ্গোমোনাডেলস পিএইচজি সামগ্রীর 45.7 শতাংশ ব্যাখ্যা করেছে (p=0.002)। Pseudonocardiales 22.4 শতাংশ PhGs বিষয়বস্তু ব্যাখ্যা করেছে (p=0.01)। 2′-অ্যাসিটিল্যাকটিওসিড উল্লেখযোগ্যভাবে ইতিবাচকভাবে সিউডোনোকার্ডিয়ালস এবং ওশেনোস্পিরিলালেসের সাথে সম্পর্কযুক্ত ছিল এবং নেতিবাচকভাবে স্ফিঙ্গোমোনাডালেসের সাথে সম্পর্কযুক্ত ছিল (চিত্র 5a)। ইচিনাকোসাইড স্ফিঙ্গোমোনাডালেসের সাথে উল্লেখযোগ্যভাবে ইতিবাচক ছিল।

বায়োমার্কার আবুন আই ল্যান্ডের জন্য পারস্পরিক সম্পর্ক বিশ্লেষণ করা হয়েছিল। ইতিমধ্যে, সিস্টানোসাইড আওয়াস উল্লেখযোগ্যভাবে ইতিবাচকভাবে মাইক্রোকোকালের সাথে সম্পর্কযুক্ত এবং নেতিবাচকভাবে লবণাক্ত-ক্ষারযুক্ত জমিতে রাইজোবিয়েলসের সাথে সম্পর্কযুক্ত (চিত্র 5c)। তৃণভূমিতে, 2′-অ্যাসিটিল্যাক্টোসিড বার্ষিক গড় তাপমাত্রার সাথে নেতিবাচকভাবে সম্পর্কযুক্ত ছিল (চিত্র 5d)। বালুকাময় জমিতে, টিউবুলসাইড A নেতিবাচকভাবে নাইট্রোসোমোনাডেলসের সাথে সম্পর্কযুক্ত ছিল (চিত্র 5e)।

C. deserticola এর তিনটি ইকোটাইপে ব্যাকটেরিয়া মাইক্রোবায়োমের ভবিষ্যদ্বাণীমূলক ফাংশন।ব্যাকটেরিয়া মাইক্রোবায়োমের কার্যকরী প্রোফাইলগুলি কেইজিজি অর্থোলগ গ্রুপ (কেও) অনুসারে ট্যাক্স 4 ফান ব্যবহার করে ডিসিফার্ড ব্যাকটেরিয়া ট্যাক্সার 16S rRNA জিন কপি নম্বরের উপর ভিত্তি করে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল। কার্যকরী ভবিষ্যদ্বাণীর ফলাফল (চিত্র 6) প্রমাণ করে যে C. deserticola এর তিনটি ইকোটাইপে মাটির মাইক্রোবায়োমের কার্যকরী বিপাক অভিন্ন। বিপাকের মধ্যে কার্বোহাইড্রেট, অ্যামিনো অ্যাসিড, কো-ফ্যাক্টর এবং ভিটামিন এবং শক্তি বিপাক প্রচুর পরিমাণে ছিল। পরিবেশগত তথ্য প্রক্রিয়াকরণে ঝিল্লি পরিবহন এবং সংকেত স্থানান্তরও প্রচুর ছিল।

সিস্তানচেনির্যাস আছেপ্রদাহ বিরোধীবৈশিষ্ট্য

আলোচনা

আমাদের পূর্ববর্তী কাজটি দেখিয়েছে যে psbA-টার্ন সিকোয়েন্স এবং 2′-অ্যাসিটিল্যাক্টোসিডকে আলাদা করার জন্য আণবিক এবং রাসায়নিক চিহ্নিতকারী হিসাবে ব্যবহার করা যেতে পারেC. মরুভূমিজিনজিয়াং এবং অভ্যন্তরীণ মঙ্গোলিয়া27 থেকে। ক্ষেত্রের তদন্তের সাথে, আমরা দেখতে পেয়েছি যে সি. মরুভূমি প্রধানত তিন ধরণের আবাসস্থলে বাস করে, যার মধ্যে রয়েছে এবিনুরলেকের লবণাক্ত-ক্ষারীয় জমি, আলেক্সা লিগের চারপাশে বালুকাময় জমি এবং মধ্যবর্তী মরুভূমি তৃণভূমি। তিনটি ইকোটাইপ C. desertica-এর বিপাকীয় প্রোফাইলগুলিও দেখায় যে 2′-acetylacteosid একটি রাসায়নিক চিহ্নিতকারী হিসাবে ব্যবহার করা যেতে পারে তিনটি ইকোটাইপ 1 কে আলাদা করতে। আমরা C. deserticola মানের তারতম্য এবং বংশগতি, বিপাক এবং জলবায়ু কারণের মাত্রা থেকে এর গঠন প্রক্রিয়া নিয়ে আলোচনা করেছি। অতএব, একটি মাইক্রো দৃষ্টিকোণ থেকে, পারস্পরিক সম্পর্ক নেটওয়ার্ক বিশ্লেষণ

মাইক্রোবায়োমের প্রাচুর্য,পিএইচজিবিষয়বস্তু, এবং পরিবেশগত কারণগুলি তিনটি ইকোটাইপের মাটির জীবাণু সম্প্রদায়ের বৈশিষ্ট্য ব্যাখ্যা করার জন্য পরিচালিত হয়েছিলC. মরুভূমিএবং মানের তারতম্যের সাথে তাদের সম্পর্ক।

জল অধিকন্তু, ব্যাসিলালেস্ক্যান বিভিন্ন ধরনের জৈব অ্যাসিড, এনজাইম, শারীরবৃত্তীয় ক্রিয়াকলাপ এবং অন্যান্য পদার্থ সংশ্লেষিত করার জন্য সমৃদ্ধ বিপাকীয় পণ্য তৈরি করে, সেইসাথে অন্যান্য বিভিন্ন পুষ্টি উপাদান যা সহজেই ব্যবহার করা যেতে পারে33। তিনটি ইকোটাইপের সাধারণ পরিবেশগত বৈশিষ্ট্য C. মরুভূমিখরা এবং মাটি মরুকরণ হয়. এবিনুর লেকের আশেপাশের মাটিতেও লবণাক্ত-ক্ষারীয় চাপ রয়েছে। এই কারণেই হতে পারে যে তিনটি ইকোটাইপের মূল মাটির অণুজীব সম্প্রদায়ের খরা, লবণ সহনশীলতা, ক্ষার প্রতিরোধের এবং চাপ প্রতিরোধের নির্দিষ্ট বৈশিষ্ট্য রয়েছে।

সিস্তানচেনির্যাস প্রতিরোধ করতে পারেনবিকিরণ

C. deserticola এর তিনটি ইকোটাইপে PhG-এর ভিন্নতাকে প্রভাবিত করে মাইক্রোবিয়াল ফ্যাক্টর।Fig. S3 C. deserticola-এর তিনটি ইকোটাইপের PhG বিষয়বস্তুর একটি বক্স ডায়াগ্রাম দেখায়। চিত্রটি প্রকাশ করে যে তৃণভূমি এবং বালুকাময় জমির তুলনায় লবণাক্ত-ক্ষারযুক্ত জমিতে 2′-অ্যাসিটিল্যাক্টোসিডের পরিমাণ বেশি, যা পূর্ববর্তী ফলাফলের সাথে সামঞ্জস্যপূর্ণ। অপ্রয়োজনীয় বিশ্লেষণ এবং অ্যাসোসিয়েশন নেটওয়ার্ক ফলাফলগুলি দেখায় যে ওশানোস্পিরিলেলস উল্লেখযোগ্যভাবে 2′-অ্যাসিটিল্যাক্টোসিডের সাথে ইতিবাচকভাবে সম্পর্কযুক্ত। Oceanospirillales, লবণাক্ত-ক্ষারযুক্ত জমিতে LDA স্কোরের ক্ষেত্রে সর্বোচ্চ বায়োমার্কার, বিশেষভাবে সমৃদ্ধ। এই ব্যাকটেরিয়াগুলি বিপাকীয় এবং রূপগতভাবে বৈচিত্র্যময়, যার মধ্যে কিছু অক্সিজেনের উপস্থিতিতে বাড়তে পারে যখন অন্যদের জন্য অ্যানেরোবিক পরিবেশের প্রয়োজন হয়34। Oceanospirillales হল দুটি পরিবার নিয়ে গঠিত প্রোটিওব্যাকটেরিয়ার একটি ক্রম। সামুদ্রিক স্পিরিলাম প্রায়শই হাড় খাওয়া কৃমির একটি এন্ডোসিম্বিওন্ট (ওসেডাক্স)35। বেশীরভাগ ওশেনোস্পিরিলেলস বাড়তে পছন্দ করে বা উচ্চ লবণের ঘনত্ব প্রয়োজন। বিভিন্ন কুলুঙ্গিতে তাদের বৃদ্ধি সত্ত্বেও, ওশেনোস্পিরিলেলস বিভিন্ন জৈব পণ্যের ভাঙ্গন থেকে শক্তি আহরণ করে। অতএব, উচ্চ লবণাক্ততা এবং ক্ষারত্বই লবণাক্ত-ক্ষারযুক্ত জমির মাটিতে Oceanospirillales সমৃদ্ধ হওয়ার প্রধান কারণ। এই ফলাফল দৃঢ়ভাবে পরামর্শ দেয় যে লবণাক্ত-ক্ষার মধ্যে 2′-অ্যাসিটিল্যাক্টোসিডের সর্বোচ্চ উপাদান ওশেনোস্পিরিলেলের সমৃদ্ধির সাথে সম্পর্কিত। যাইহোক, Oceanospirillales এবং 2′-acetylacteosid-এর মধ্যে নিয়ন্ত্রক সম্পর্ক এখনও ফাঁকা, এবং আরও গবেষণা প্রয়োজন।

সাতটি পিএইচজির সামগ্রিক বিষয়বস্তু তৃণভূমিতে সর্বাধিক, যার মধ্যে ইচিনাকোসাইড প্রভাবশালী পিএইচজি। ইচিনাকোসাইড উল্লেখযোগ্যভাবে স্ফিংগোমোনাডালেসের সাথে ইতিবাচকভাবে সম্পর্কযুক্ত, যা আলফা-প্রোটিয়াসের মধ্যে একটি ক্রম এবং এরিথ্রোব্যাক্টেরেসি এবং স্ফিঙ্গোমোনাডাসি পরিবার গঠন করে। উভয় পরিবারই প্রকৃতিতে সাধারণ, বিশেষ করে মৃত্তিকা, মহাসাগর এবং মিঠা পানিতে। স্ফিঙ্গোমোনাডালেসের সুগন্ধযুক্ত যৌগের জন্য বিপাকীয় ক্ষমতার বিস্তৃত পরিসর রয়েছে এবং কিছু স্ট্রেন মূল্যবান বহির্কোষী বায়োপলিমারকে সংশ্লেষিত করতে পারে। স্ফিঙ্গোমোনাস শ্রেণীর পূর্বে পরিচিত সকল সদস্যই বায়বীয় এবং রাসায়নিকভাবে জৈব। একমাত্র ব্যতিক্রম ফ্যাকাল্টেটিভ অ্যানেরোবিক ইথানল ফার্মেন্টার, যা গাঁজনযুক্ত পানীয় সজ্জা তৈরি করতে ব্যবহৃত হয়। রোডোব্যাক্টর, পোরফাইরিন এবং স্ট্যাফিলোকক্কাস অরিয়াস প্রজাতির কিছু প্রজাতির পাশাপাশি স্ফিঙ্গোমোনাস গণের কিছু প্রজাতির ক্লোরোফিল এ আছে এবং তাই ঐচ্ছিক ফটো-অরগানোট্রফ (সালোকসংশ্লেষণের মাধ্যমে উৎপন্ন শক্তি) ৩৮। তৃণভূমিতে C. deserticola-এর সর্বোত্তম গুণমান সমৃদ্ধ জীবাণু সম্প্রদায়ের বৈচিত্র্য এবং বায়োমার্কার (Sphingomonadales) এর বিপাকীয়-সম্পর্কিত ফাংশনের কারণে হতে পারে। এই অনুসন্ধানটি বিভিন্ন ইকোটাইপগুলিতে সি. ডেজার্টিকোলার মানের বৈচিত্রের উপর গবেষণায় নতুন অন্তর্দৃষ্টি প্রদান করে।

তিনটি ইকোটাইপের মাটির মাইক্রোবায়োমের মেটাবলিক ফাংশন প্রোফাইলের পূর্বাভাস।এই গবেষণায় প্রথমবারের মতো তিনটি ইকোটাইপের মধ্যে C. deserticola-এর মাটির মাইক্রোবায়োমের বিপাকীয় ফাংশন প্রোফাইল (চিত্র 6 এবং ফাইল S1) প্রদর্শিত হয়েছিল। বিপাকের পরিপ্রেক্ষিতে, কার্বোহাইড্রেট বিপাক (স্টার্চ এবং সুক্রোজ বিপাক, ko00500; অ্যামিনো চিনি এবং নিউক্লিওটাইড চিনি বিপাক, ko00520) এবং অ্যামিনো অ্যাসিড বিপাক (আর্জিনাইন এবং প্রোলিন বিপাক, ko00330; গ্লাইসিন, সেরিন, 000500) উচ্চ মাত্রায় রয়েছে। মাইক্রোবায়োম কার্বোহাইড্রেট বিপাক শরীরে কার্বোহাইড্রেটের গঠন, ভাঙ্গন এবং রূপান্তরের জন্য দায়ী। কার্বোহাইড্রেট অনেক গুরুত্বপূর্ণ বিপাকীয় পথের ভিত্তি। কার্বোহাইড্রেট যেমন গ্লুকোজ প্রজাতি জুড়ে একাধিক বিপাকীয় পথের অংশ। কার্বোহাইড্রেটগুলি সালোকসংশ্লেষণের মাধ্যমে বায়ুমণ্ডল থেকে উদ্ভিদ দ্বারা সংশ্লেষিত হয় এবং সেলুলার শ্বাস-প্রশ্বাসের জন্য সাবস্ট্রেট হিসাবে ব্যবহার করা যেতে পারে40। গাছপালা এবং অণুজীবগুলি প্রোটিন এবং নাইট্রোজেনযুক্ত পদার্থ সংশ্লেষ করতে পরিবেশ থেকে অ্যামোনিয়া, অ্যামোনিয়াম লবণ, নাইট্রাইট, নাইট্রেট এবং অন্যান্য অজৈব নাইট্রোজেন শোষণ করে। কিছু জীবাণু অ্যামিনো অ্যাসিড সংশ্লেষণ করতে বায়ু থেকে N2 কে অ্যামোনিয়া নাইট্রোজেনে রূপান্তর করতে পারে। মাটির মাইক্রোবায়োমের বিপাকীয় ফাংশন প্রাথমিক বিপাকের মধ্যে সমৃদ্ধ হয়েছিল। এই সমৃদ্ধিটি পরামর্শ দেয় যে মাইক্রোবায়োমগুলি উদ্ভিদকে পুষ্টি সরবরাহ করতে পারে এবং খরা এবং অন্যান্য চাপের মধ্যে তাদের বৃদ্ধিকে উন্নীত করতে পারে।

বিপাকীয় ফাংশন প্রোফাইলগুলি আরও দেখায় যে পরিবেশগত তথ্য প্রক্রিয়াকরণে, ঝিল্লি পরিবহন (ABC ট্রান্সপোর্টার, ko02010) এবং সংকেত ট্রান্সডাকশন (টু-কম্পোনেন্ট সিস্টেম, ko02020) মাইক্রোবায়োমে অত্যন্ত সমৃদ্ধ। মেমব্রেন ট্রান্সপোর্ট হল একটি বায়োফিল্মের মাধ্যমে দ্রবণ, যেমন আয়ন এবং ছোট অণুগুলির উত্তরণকে নিয়ন্ত্রণ করে এমন প্রক্রিয়াগুলির একটি সংগ্রহ, যা প্রোটিনে এমবেড করা লিপিডগুলির একটি বাইলেয়ার। ক্রসিং মেমব্রেনগুলির নিয়ন্ত্রণ নির্বাচনী ঝিল্লির ব্যাপ্তিযোগ্যতার জন্য দায়ী করা হয়, বায়োফিল্মগুলির একটি বৈশিষ্ট্য যা বিভিন্ন রাসায়নিক বৈশিষ্ট্য সহ পদার্থগুলিকে পৃথক করতে সক্ষম করে। অন্য কথায়, এই ঝিল্লিগুলি কিছু পদার্থের জন্য প্রবেশযোগ্য হতে পারে তবে অন্যদের জন্য নয়। এই ঝিল্লিগুলির মধ্যে, এবিসি ট্রান্সপোর্টার পথটি মাটির মাইক্রোবায়োমে অত্যন্ত সমৃদ্ধ ছিল। ATP-বাইন্ডিং বক্স (ABC) ট্রান্সপোর্টারগুলি সর্বজনীনভাবে ব্যাকটেরিয়ার মতো অণুজীবের মধ্যে বিদ্যমান এবং বর্তমানে পরিচিত সবচেয়ে বড় প্রোটিন পরিবারগুলির মধ্যে একটি। আয়ন, পেপটাইড, লিপিড, ওষুধ, শর্করা, প্রোটিন এবং স্টেরলের মতো বহুবিধ সাবস্ট্রেটের সক্রিয় পরিবহনে অংশগ্রহণের জন্য এই পরিবহনকারীরা এটিপি হাইড্রোলাইসিসকে আবদ্ধ করে। প্রোক্যারিওটে এবিসি পরিবহনের গঠন সাধারণত তিনটি অংশ নিয়ে গঠিত। সাধারণত, দুটি অক্ষত মেমব্রেন প্রোটিনের প্রতিটিতে ছয়টি ট্রান্সমেমব্রেন টুকরা থাকে: দুটি পেরিফেরাল প্রোটিন যা এটিপিকে আবদ্ধ করে এবং হাইড্রোলাইজ করে এবং একটি বাঁধাই প্রোটিনের একটি পেরিফেরাল (বা লাইপোপ্রোটিন) সাবস্ট্রেট। অনেক ব্যাকটেরিয়া এবং আর্কিয়ার জিনোমে দেখা যায়, এই তিনটি উপাদানের অনেক জিন অপারন গঠন করে। খরা, লবণাক্ততা এবং ক্ষারীয় চাপ ঝিল্লি পরিবহন ফাংশন, বিশেষ করে মাটির মাইক্রোবায়োমের সক্রিয় পরিবহন ফাংশনের উন্নতি ঘটায়।

সিগন্যাল ট্রান্সডাকশন এমন একটি প্রক্রিয়া যেখানে একটি রাসায়নিক বা শারীরিক সংকেত একটি কোষের মাধ্যমে আণবিক ঘটনাগুলির একটি সিরিজ হিসাবে প্রেরণ করা হয়। সবচেয়ে সাধারণ হল প্রোটিন কিনেস-অনুঘটক প্রোটিন ফসফোরিলেশন। দ্বি-উপাদান ব্যবস্থা হল একটি সংকেত পথ যা অনেক ব্যাকটেরিয়া বৈশিষ্ট্য নিয়ন্ত্রণ করে, যেমন বিষাক্ততা, প্যাথোজেনিসিটি, সিম্বিওসিস, গতিশীলতা, পুষ্টি শোষণ, গৌণ বিপাক উৎপাদন, বিপাকীয় নিয়ন্ত্রণ এবং কোষ বিভাজন। এই সিস্টেমগুলি পরিবেশগত বা সেলুলার প্যারামিটারের উপর ভিত্তি করে শারীরবৃত্তীয় প্রক্রিয়াগুলিকে নিয়ন্ত্রণ করে, তাদের পরিবর্তিত অবস্থার সাথে খাপ খাইয়ে নিতে সক্ষম করে। মাটির মাইক্রোবায়োমের সংকেত স্থানান্তর খরা বা লবণাক্ত-ক্ষারীয় চাপ দ্বারা প্রচারিত হয়েছিল।

সিস্তানচেএক্সট্রাক্ট ক্যানঅ্যান্টিঅক্সিডেন্ট

উপসংহার

এই গবেষণাটিই প্রথম সি. ডেজার্টিকোলার তিনটি ইকোটাইপের মাটির মাইক্রোবায়োম উপস্থাপন করে। নিম্নলিখিত উপসংহারগুলি প্রাপ্ত করা হয়েছে: (1) তৃণভূমিতে মাটির জীবাণু সম্প্রদায় তিনটি আবাসস্থলের মধ্যে সর্বাধিক প্রচুর। (2) তিনটি ইকোটাইপের বায়োমার্কারগুলিও নির্ধারণ করা হয়েছিল: Oceanospirillales (লবণাক্ত-ক্ষারীয় জমি), স্ফিঙ্গোমোনাডেলস (তৃণভূমি), এবং Propionibacteriales (বালুকাময় জমি)। (3) মূল মাইক্রোবায়োম বিশ্লেষণে প্রমাণিত হয়েছে যে C. deserticola-এর মৃত্তিকা জীবাণু সম্প্রদায়ের বেশিরভাগই ছিল খরা, লবণ সহনশীলতা, ক্ষার প্রতিরোধের, এবং চাপ প্রতিরোধের, যেমন Micrococcales এবং Bacillales। (4) পারস্পরিক সম্পর্ক বিশ্লেষণে দেখা গেছে যে 2′-অ্যাসিটিল্যাকটিওসাইড ইতিবাচকভাবে ওশেনোস্পিরিলেলের সাথে সম্পর্কযুক্ত এবং ইচিনাকোসাইড উল্লেখযোগ্যভাবে স্ফিঙ্গোমোনাডালেসের সাথে ইতিবাচকভাবে সম্পর্কযুক্ত। (5) Tax4Fun ভবিষ্যদ্বাণী করেছে যে মাটির মাইক্রোবায়োমের তিনটি ইকোটাইপের বিপাকীয় ফাংশন প্রোফাইলগুলি বিপাক এবং পরিবেশগত তথ্য প্রক্রিয়াকরণে সমৃদ্ধ হয়।

তথ্যসূত্র

1. Zheng, S., Jiang, X., Wu, L., Wang, Z. & Huang, L. UPLC-QTOF/ MS এবং DNA বারকোডিং এর উপর ভিত্তি করে cistanches herba এর রাসায়নিক এবং জেনেটিক বৈষম্য। প্লাস ওয়ান 9, e98061 (2014)।

2. লি, জেড এবং অন্যান্য। চীনের আলক্সায় Cistanche deserticola YC Ma এর পরিবেশগত মডেলিং। বৈজ্ঞানিক রিপোর্ট 9, 13134, https://doi.org/10.1038/ s41598-019-48397-6 (2019)৷

3. জোসেফ, ই. এবং অন্যান্য। ধানের মূল-সম্পর্কিত মাইক্রোবায়োমের গঠন, প্রকরণ এবং সমাবেশ। মার্কিন যুক্তরাষ্ট্রের ন্যাশনাল একাডেমি অফ সায়েন্সেসের কার্যধারা 112, E911 (2015)।

4. Jansson, JK & Hofmockel, KS Soil microbiome, এবং জলবায়ু পরিবর্তন। প্রকৃতি পর্যালোচনা. মাইক্রোবায়োলজি, https://doi.org/10.1038/ s41579-019-0265-7 (2019)।

5. ওয়াং, এক্স এবং অন্যান্য। আল্ট্রা পারফরম্যান্স লিকুইড ক্রোমাটোগ্রাফি-কোয়াড্রপোল টাইম-অফ-ফ্লাইট ম্যাস স্পেকট্রোমেট্রি এবং একটি 1,1-ডিফেনাইল-2- পিক্রিলহাইড্রাজিল-বা ব্যবহার করে চাষকৃত সিস্তানচে মরুভূমির বিভিন্ন অংশের রাসায়নিক প্রোফাইল এবং অ্যান্টিঅক্সিডেন্ট কার্যকলাপের তুলনা। অণু 22, 2011 (2017)।

6. ইয়াং, এল. এট আল। Ovariectomized ইঁদুরের হাড়ের মাইক্রোস্ট্রাকচারে Cistanche deserticola থেকে বিচ্ছিন্ন মোট Phenylethanoid Glycoside ভগ্নাংশের উপকারী প্রভাব। অক্সিডেটিভ মেডিসিন এবং সেলুলার দীর্ঘায়ু 2019, 2370862, https://doi. org/10.1155/2019/2370862 (2019)।

7. Liu, W. et al. (1) H NMR-ভিত্তিক নন-টার্গেটেড থেকে LC-MS-ভিত্তিক টার্গেটেড মেটাবোলোমিক্স কৌশল থেকে চারটি সিস্টানচে প্রজাতির মধ্যে গভীরভাবে ক্যামোমাইল তুলনা করার জন্য। জার্নাল অফ ফার্মাসিউটিক্যাল এবং বায়োমেডিকাল বিশ্লেষণ 162, 16–27, https://doi.org/10.1016/j. jpba.2018.09.013 (2019)।

8. চেন, এইচ. এট আল। ঔষধি উদ্ভিদের মূল মাইক্রোবায়োম সালভিয়া মিলটিওরিজা বীজ: সেকেন্ডারি মেটাবলিজমের জন্য উপকারী জীবাণুর একটি সমৃদ্ধ আধার? আণবিক বিজ্ঞানের আন্তর্জাতিক জার্নাল 19, 672 (2018)।

9. সোনেনবার্গ, জেএল এবং ব্যাকহেড, এফ. ডায়েট-মাইক্রোবায়োটা মিথস্ক্রিয়া মানব বিপাকের মডারেটর হিসাবে। প্রকৃতি 535, 56–64, https://doi. org/10.1038/nature18846 (2016)।

10. জু, এফ. এবং ঝাং, টি. 16S rRNA জিন উচ্চ-থ্রুপুট সিকোয়েন্সিং ডেটা মাইনিং এর মাইক্রোবিয়াল বৈচিত্র্য এবং মিথস্ক্রিয়া। ফলিত মাইক্রোবায়োলজি এবং জৈবপ্রযুক্তি 99, 4119–4129 (2015)।

11. কুই, জে.-এল., বিজয়কুমার, ভি. ও ঝাং, জি. মূল-পরজীবী উদ্ভিদ সাইনোমোরিয়াম সোনগারিকাম এবং এর হোস্ট নাইট্রারিয়া ট্যাঙ্গুটোরামে ছত্রাকের এন্ডোফাইট সমাবেশের বিভাজন। মাইক্রোবায়োলজিতে ফ্রন্টিয়ার্স 9, 666 (2018)।

12. ফ্যান, পি., লিউ, পি., গান, পি., চেন, এক্স এবং মা, এক্স। পরিমিত খাদ্য প্রোটিন সীমাবদ্ধতা অন্ত্রের মাইক্রোবায়োটার গঠনকে পরিবর্তন করে এবং একটি প্রাপ্তবয়স্ক শূকরের মডেলে ইলিয়াল বাধা ফাংশনকে উন্নত করে। বৈজ্ঞানিক রিপোর্ট 7, 43412 (2017)।

13. মুনিয়াকা, পিএম এবং অন্যান্য। Mo1774 প্রসবপূর্ব অ্যান্টিবায়োটিক চিকিত্সা পরীক্ষামূলক কোলাইটিসের প্রতি সন্তানের সংবেদনশীলতা বাড়ায়: অন্ত্রের মাইক্রোবায়োটার ভূমিকা। প্লাস ওয়ান 10, e0142536 (2015)।

14. ঝাও, ওয়াই এবং অন্যান্য। লিগনোসেলুলোসিক বায়োমাস হজমের মধ্যে অ্যাসিডোজেনিক এবং মেথানোজেনিক পর্যায়গুলিকে একীভূত করে একটি একক উল্লম্ব চুল্লির কর্মক্ষমতা এবং মাইক্রোবিয়াল গতিবিদ্যার উপর তীব্রতার মিশ্রণের প্রভাব। বায়োরিসোর্স প্রযুক্তি 238, 542–551 (2017)।

15. কোল, জেআর এবং অন্যান্য। রিবোসোমাল ডাটাবেস প্রকল্প: আরআরএনএ বিশ্লেষণের জন্য উন্নত প্রান্তিককরণ এবং নতুন সরঞ্জাম। (2009)।

16. এডগার, আরসি UPARSE: মাইক্রোবিয়াল অ্যামপ্লিকন রিড থেকে অত্যন্ত সঠিক ওটিইউ সিকোয়েন্স। প্রকৃতি পদ্ধতি 10, 996 (2013)।

17. Yu, W. et al. লক্ষ লক্ষ ইলুমিনা ট্যাগ ব্যবহার করে স্বাদুপানি, আন্তঃজলোয়ার জলাভূমি এবং সামুদ্রিক পলিতে ব্যাকটেরিয়া বৈচিত্র্যের মাত্রার তুলনা। ফলিত এবং পরিবেশগত মাইক্রোবায়োলজি 78, 8264 (2012)।

18. জিয়াং, এক্সটি এট আল। 16S rRNA ট্যাগের ইলুমিনা সিকোয়েন্সিং একটি ম্যানগ্রোভ জলাভূমিতে ব্যাকটেরিয়াল সম্প্রদায়ের স্থানিক বৈচিত্র প্রকাশ করেছে। মাইক্রোবিয়াল ইকোলজি 66, 96–104 (2013)।

19. স্যানার, এমএফ পাইথন: সফ্টওয়্যার একীকরণ এবং বিকাশের জন্য একটি প্রোগ্রামিং ভাষা। জার্নাল অফ মলিকুলার গ্রাফিক্স অ্যান্ড মডেলিং

17, 57–61 (1999).

20. Caporaso, JG et al. QIIME উচ্চ-থ্রুপুট কমিউনিটি সিকোয়েন্সিং ডেটা বিশ্লেষণের অনুমতি দেয়। Nat পদ্ধতি 7, 335–336, https://doi. org/10.1038/nmeth.f.303 (2010)।

21. Chong, J., Liu, P., Zhou, G. & Xia, J. মাইক্রোবায়োম ডেটার ব্যাপক পরিসংখ্যানগত, কার্যকরী এবং মেটা-বিশ্লেষণের জন্য মাইক্রোবায়োম অ্যানালিস্ট ব্যবহার করে৷ প্রকৃতি প্রটোকল, 1-23 (2020)।

22. ধরিওয়াল, এ. এবং অন্যান্য। মাইক্রোবায়োম অ্যানালিস্ট: মাইক্রোবায়োম ডেটার ব্যাপক পরিসংখ্যান, ভিজ্যুয়াল এবং মেটা-বিশ্লেষণের জন্য একটি ওয়েব-ভিত্তিক টুল। নিউক্লিক অ্যাসিড গবেষণা 45, W180–W188 (2017)।

23. Šmilauer, P. & Lepš, J. CANOCO 5 ব্যবহার করে পরিবেশগত তথ্যের মাল্টিভারিয়েট বিশ্লেষণ। (কেমব্রিজ বিশ্ববিদ্যালয় প্রেস (2014)।

24. শ্যানন, পি. এট আল। সাইটোস্কেপ: বায়োমোলিকুলার মিথস্ক্রিয়া নেটওয়ার্কগুলির সমন্বিত মডেলগুলির জন্য একটি সফ্টওয়্যার পরিবেশ। জিনোম গবেষণা 13, 2498-2504 (2003)।

25. অ্যাশাউয়ার, কেপি, ওয়েমহেউয়ার, বি., ড্যানিয়েল, আর. এবং মেইনিক, পি. ট্যাক্স4ফান: মেটাজেনমিক 16এস আরআরএনএ ডেটা থেকে কার্যকরী প্রোফাইলের পূর্বাভাস। বায়োইনফরমেটিক্স (অক্সফোর্ড, ইংল্যান্ড) 31, 2882–2884, https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btv287 (2015)।

26. কু, এইচ. এট আল। অ্যান্টার্কটিকার লেক ওবার্সি থেকে মাইক্রোবিয়াল ম্যাটগুলির অণুজীব বৈচিত্র্য এবং ভবিষ্যদ্বাণীমূলক কার্যকরী বৈশিষ্ট্যগুলি চিহ্নিত করতে ব্যবহৃত দুটি জৈব তথ্যবিজ্ঞান সরঞ্জামের তুলনা। মাইক্রোবায়োলজিক্যাল পদ্ধতির জার্নাল 140, 15–22 (2017)।

27. Huang, L., Zheng, S., Wu, L., Jiang, X. & Chen, S. Cistanche deserticola এর ইকোটাইপস রাসায়নিক গঠন এবং আণবিক বৈশিষ্ট্যের উপর ভিত্তি করে। Scientia Sinica Vitae 44, 318–328 (2014)।

28. গ্যাব্রিয়েল, বি. এবং কর্নেলিয়া, এস. উদ্ভিদের প্রজাতি এবং মাটির ধরন সমবায়ভাবে রাইজোস্ফিয়ারে অণুজীব সম্প্রদায়ের গঠন এবং কার্যকারিতা গঠন করে। ফেমস মাইক্রোবায়োলজি ইকোলজি 68, 1–13 (2010)।

29. পার্টে, এসি এলপিএসএন – নামকরণে দাঁড়িয়ে থাকা প্রোকারিয়োটিক নামের তালিকা। নিউক্লিক অ্যাসিড গবেষণা 42, 613–616 (2014)।

30. Pirog, T., Grinberg, T. & Malashenko, YR এক্সোপোলিস্যাকারাইডের প্রতিরক্ষামূলক ফাংশন একটি Acinetobacter sp দ্বারা উত্পাদিত। মাইক্রোবায়োলজি (নিউ ইয়র্ক, এনওয়াই) 66, 279–283 (1997)।

31. লিউ, ওয়াই.-এইচ। ইত্যাদি হ্যালোফাইট Lycium ruthenicum Murr এর সাথে যুক্ত এন্ডোফাইটের বৈচিত্র্য, সম্প্রদায়ের বন্টন এবং বৃদ্ধির প্রচার কার্যক্রম। 3 বায়োটেক 9, 144 (2019)।

32. Staley, Bryant, Pfennig, Holt & JG Bergey's manual of systematic bacteriology - ভলিউম 4. Bergeys Manual of Systematic Bacteriology 38, 89–100 (1989)।

33. Pasqua, RD et al. এন্ডো-1,4- -গ্লুকানেজ জিন এক্সপ্রেশন এবং ব্যাসিলাস অ্যামাইলোলিকফেসিয়েন্স B31C এর এনজাইমেটিক কার্যকলাপের উপর বিভিন্ন লিগনোসেলুলোজ উত্সের প্রভাব। জৈব সম্পদ 9 (2014)।

34. পট, B. এবং Gillis, M. Oceanospirillum. (2015)।

35. ইউজেবি, জেপি নামকরণে স্ট্যান্ডিং সহ ব্যাকটেরিয়ার নামের তালিকা: ইন্টারনেটে উপলব্ধ একটি ফোল্ডার। ইন্টারন্যাশনাল জার্নাল অফ সিস্টেম্যাটিক ব্যাকটিরিওলজি 47, 590–592, https://doi.org/10.1099/00207713-47-2-590 (1997)।

36. Balkwill, DL, Fredrickson, JK & Romine, MF Sphingomonas এবং Related Genera. Prokaryotes 7, 605–629 (2003)।

37. তাকেউচি, এম., হামানা, কে. এবং হিরাইশি, এ. ফিলোজেনেটিক এবং কেমোট্যাক্সোনমিক বিশ্লেষণের ভিত্তিতে স্ফিঙ্গোমোনাস সেনসু স্ট্রিক্টো এবং তিনটি নতুন জেনার, স্ফিঙ্গোবিয়াম, নোভোসফিঙ্গোবিয়াম এবং স্ফিঙ্গোপিক্সিস গণের প্রস্তাব। ইন্টারন্যাশনাল জার্নাল অফ সিস্টেম্যাটিক অ্যান্ড ইভোল্যুশনারি মাইক্রোবায়োলজি 51, 1405-1417 (2001)।

38. সাওরি, এস. ও আকিরা, এইচ. নভোসফিঙ্গোবিয়াম ন্যাফথালেনিভোরান্স এসপি। nov., পলিক্লোরিনযুক্ত-ডাইঅক্সিন-দূষিত পরিবেশ থেকে বিচ্ছিন্ন একটি ন্যাপথালিন-অবক্ষয়কারী ব্যাকটেরিয়া। জেনারেল অ্যান্ড অ্যাপ্লায়েড মাইক্রোবায়োলজি জার্নাল 53, 221–228 (2007)।

39. Alánt, O., Pulay, I., Esztergályos, J. & Bodnár, A. কার্বোহাইড্রেট বিপাকের উপর অস্ত্রোপচারের প্রভাব। Acta Chirurgica Academiae Scientiarum Hungaricae 16, 307 (1975)।

40. গ্রে, জিএম কার্বোহাইড্রেট হজম এবং শোষণ। গ্যাস্ট্রোএন্টারোলজির এনসাইক্লোপিডিয়া 58, 275–278 (2004)।

41. কুন, এমজে এবং রবিনসন, ডব্লিউজি অ্যামিনো অ্যাসিড মেটাবলিজম। (2003)।

42. Purves, WK, Orians, G., Heller, C. & Sadava, D. Vida, LaCiencia de la Biología. 8ª উপদেশ। প্যানামেরিকানা (2009)।

43. স্নাইডার, ই. এবং হুঙ্ক, এস. এটিপি-বাইন্ডিং-ক্যাসেট (এবিসি) পরিবহন ব্যবস্থা: এটিপি-হাইড্রোলাইজিং সাবইউনিট/ডোমেনের কার্যকরী এবং কাঠামোগত দিক। ফেমস মাইক্রোবায়োলজি রিভিউ 22, 1–20 (1998)।

44. Kleerebezem, M., Quadri, LE, Kuipers, OP & Vos, WM De. গ্রাম-পজিটিভ ব্যাকটেরিয়াতে পেপটাইড ফেরোমোন এবং দুই-উপাদান সংকেত-ট্রান্সডাকশন সিস্টেম দ্বারা কোরাম সেন্সিং। আণবিক মাইক্রোবায়োলজি 24, 895–904 (2010)।