দক্ষিণ আফ্রিকায় SARS-CoV-2 Omicron ভেরিয়েন্টের ক্লিনিকাল তীব্রতার প্রাথমিক মূল্যায়ন: একটি ডেটা লিঙ্কেজ স্টাডি

joanna.jia@wecistanche.com/ WhatsApp: 008618081934791

সারসংক্ষেপ

পটভূমি

SARS-CoV-2 উদ্বেগের omicron রূপটি দক্ষিণ আফ্রিকায় 2021 সালের নভেম্বরে চিহ্নিত করা হয়েছিল এবং এটি বৃদ্ধির সাথে যুক্ত ছিলকোভিড-19মামলা আমরা প্রক্সি হিসাবে থার্মো ফিশার সায়েন্টিফিক ট্যাকপাথ কোভিড-19 পিসিআর পরীক্ষায় এস জিন টার্গেট ব্যর্থতা (SGTF) ব্যবহার করে ওমিক্রন ভেরিয়েন্টের সাথে সংক্রমণের ক্লিনিকাল তীব্রতা মূল্যায়ন করার লক্ষ্য রেখেছিলাম।

পদ্ধতি

আমরা জাতীয়, দক্ষিণ আফ্রিকার জন্য ডেটা লিঙ্কেজ করেছিকোভিড-19কেস ডেটা, SARS-CoV-2 ল্যাবরেটরি পরীক্ষার ডেটা, SARS-CoV-2 জিনোম ডেটা, এবংকোভিড-19হাসপাতালে ভর্তির তথ্য। নির্ণয় করা ব্যক্তিদের জন্যকোভিড-19TaqPath পিসিআর পরীক্ষার মাধ্যমে, সংক্রমণগুলিকে SGTF বা নন-SGTF হিসাবে মনোনীত করা হয়েছিল। ডেল্টা বৈকল্পিক জিনোম সিকোয়েন্সিং দ্বারা চিহ্নিত করা হয়েছিল। মাল্টিভেরিয়েবল লজিস্টিক রিগ্রেশন মডেলগুলি ব্যবহার করে, আমরা 1 অক্টোবর থেকে 30 নভেম্বর, 2021 এর মধ্যে নির্ণয় করা SGTF বনাম নন-SGTF সংক্রমণের সাথে তুলনা করে রোগের তীব্রতা এবং হাসপাতালে ভর্তির মূল্যায়ন করেছি এবং আমরা আরও SGTF-সংক্রমিত ব্যক্তি এবং O Novoctos-এর মধ্যে তুলনা করে রোগের তীব্রতা মূল্যায়ন করেছি। 30, 2021, 1 এপ্রিল থেকে 9 নভেম্বর, 2021-এর মধ্যে নির্ণয় করা ডেল্টা ভেরিয়েন্ট-সংক্রমিত ব্যক্তিদের সাথে।

ফাইন্ডিংস

1 অক্টোবর (সপ্তাহ 39), 2021, থেকে 6 ডিসেম্বর (সপ্তাহ 49), 2021, 161 328টি মামলাকোভিড-19দক্ষিণ আফ্রিকায় রিপোর্ট করা হয়েছে। TaqPath পিসিআর পরীক্ষার মাধ্যমে {{0}} লোকদের নির্ণয় করা হয়েছিল এবং 29 721 SGTF সংক্রমণ এবং 1412 নন-SGTF সংক্রমণ সনাক্ত করা হয়েছিল৷ SGTF সংক্রমণের অনুপাত 39 তম সপ্তাহে 63 টির মধ্যে দুটি (3·2 শতাংশ) থেকে 48 তম সপ্তাহে 21 978 (97·9 শতাংশ) 22 455-এ বেড়েছে৷ হাসপাতালে ভর্তির সাথে সম্পর্কিত কারণগুলির জন্য নিয়ন্ত্রণ করার পরে, ব্যক্তিরা SGTF সংক্রমণের ক্ষেত্রে নন-SGTF সংক্রমণের তুলনায় ভর্তির সম্ভাবনা উল্লেখযোগ্যভাবে কম ছিল (256 [2·4 শতাংশ] 10 547 বনাম 121 [12·8 শতাংশ ] 948; সামঞ্জস্যপূর্ণ প্রতিকূল অনুপাত [aOR] {{ 25}·2, 95 শতাংশ CI 0·1–{{36}·3)। রোগের তীব্রতার সাথে সম্পর্কিত কারণগুলির জন্য নিয়ন্ত্রণ করার পরে, SGTF বনাম নন-SGTF সংক্রমণ (42 [21 শতাংশ] 204 বনাম 45 [40 শতাংশের মধ্যে SGTF আক্রান্ত ব্যক্তিদের মধ্যে গুরুতর রোগের সম্ভাবনা একই ছিল ] এর 113; aOR 0·7, 95 শতাংশ CI 0·3–1·4)। পূর্ববর্তী ডেল্টা বৈকল্পিক সংক্রমণে আক্রান্ত ব্যক্তিদের সাথে তুলনা করে, SGTF-সংক্রমিত ব্যক্তিদের গুরুতর রোগের সম্ভাবনা উল্লেখযোগ্যভাবে কম ছিল (496 [62·5 শতাংশ] 793 বনাম 57 [23·4 শতাংশ] 244; aOR 0·3, 95 শতাংশ CI 0·2-0·5), রোগের তীব্রতার সাথে সম্পর্কিত কারণগুলির জন্য নিয়ন্ত্রণ করার পরে।

ব্যাখ্যা

আমাদের প্রাথমিক বিশ্লেষণগুলি একই সময়ের মধ্যে নির্ণয় করা SGTF বনাম নন-SGTF সংক্রমণে আক্রান্ত ব্যক্তিদের মধ্যে হাসপাতালে ভর্তি হওয়ার সম্ভাবনা উল্লেখযোগ্যভাবে হ্রাস করার পরামর্শ দেয়। SGTF-সংক্রমিত ব্যক্তিদের ডেল্টা বৈকল্পিকের সাথে আগে সংক্রামিত ব্যক্তিদের তুলনায় গুরুতর রোগের সম্ভাবনা উল্লেখযোগ্যভাবে কম ছিল। এই হ্রাসকৃত তীব্রতার কিছু সম্ভবত পূর্বের অনাক্রম্যতার ফল।

অর্থায়ন

সাউথ আফ্রিকান মেডিকেল রিসার্চ কাউন্সিল, সাউথ আফ্রিকান ন্যাশনাল ডিপার্টমেন্ট অফ হেলথ, ইউএস সেন্টার ফর ডিজিজ কন্ট্রোল অ্যান্ড প্রিভেনশন, আফ্রিকান সোসাইটি অফ ল্যাবরেটরি মেডিসিন, আফ্রিকা সেন্টার ফর ডিজিজ কন্ট্রোল অ্যান্ড প্রিভেনশন, বিল অ্যান্ড মেলিন্ডা গেটস ফাউন্ডেশন, ওয়েলকাম ট্রাস্ট এবং ফ্লেমিং তহবিল।

রোগ প্রতিরোধ ক্ষমতার জন্য বিশেষ ফার্মা

ভূমিকা

2020 সালের মার্চ মাসে SARS-CoV-এর প্রথম কেস-2 থেকে, দক্ষিণ আফ্রিকায় তিনটি মহামারী তরঙ্গ দেখা দিয়েছে, যার মধ্যে বিটা (B.1.351) এবং ডেল্টা (B.1.617.2) উদ্বেগের রূপগুলি দ্বিতীয় এবং তৃতীয়টিতে প্রাধান্য পেয়েছে তরঙ্গ, যথাক্রমে। 24 নভেম্বর, 2021-এ, নেটওয়ার্ক ফর জিনোমিক্স সার্ভিল্যান্স ইন সাউথ আফ্রিকা (এনজিএস-এসএ) SARS-CoV-2-এর একটি নতুন রূপের রিপোর্ট করেছে, যা 14 নভেম্বর, 2021-এ সংগৃহীত নমুনাগুলি থেকে সনাক্ত করা হয়েছিল, দক্ষিণ আফ্রিকার মূলত B.1.1.529 বংশে, WHO.2 কে 26 নভেম্বর, 2021-এ, SARS-CoV-2 ভাইরাস বিবর্তনের প্রযুক্তিগত পরামর্শদাতার সুপারিশের ভিত্তিতে, WHO B.1.1.529 কে omicron হিসাবে মনোনীত করেছে ,3 উদ্বেগের পঞ্চম রূপ। একই সঙ্গে, একটি দ্রুত বৃদ্ধি ছিলকোভিড-19SARS-CoV-2 টেস্টিং ল্যাবরেটরিগুলি TaqPath-এ পরীক্ষা করার সময় S জিন টার্গেট ফেইলিওর (SGTF) সহ নমুনার সংখ্যা বৃদ্ধির রিপোর্ট করে, 15 নভেম্বর, 2021 থেকে শুরু হওয়া সপ্তাহ থেকে দক্ষিণ আফ্রিকার গৌতেং প্রদেশের 2-তে কেসকোভিড-19পিসিআর পরীক্ষা (থার্মো ফিশার সায়েন্টিফিক; ওয়ালথাম, এমএ, ইউএসএ)। পরবর্তীকালে, SARS-CoV-2 সংক্রমণের চতুর্থ তরঙ্গের প্রবণতা, দক্ষিণ আফ্রিকার অন্যান্য প্রদেশে কোভিড-19 মামলার বৃদ্ধি এবং SGTF সহ নমুনাগুলি পরিলক্ষিত হয়েছিল৷ 16 ডিসেম্বর, 2021 নাগাদ, 87টি দেশে ওমিক্রন শনাক্ত করা হয়েছে, অনেক দেশ কমিউনিটি ট্রান্সমিশন রিপোর্ট করছে।

উদ্বেগের ওমিক্রন রূপটিতে প্রচুর পরিমাণে মিউটেশন রয়েছে, যার মধ্যে কিছু পূর্বাভাসিত প্রতিরোধ ক্ষমতা ফাঁকি এবং বর্ধিত সংক্রামকতার কারণে উদ্বেগজনক। যদিও ওমিক্রন বৈকল্পিকটি C.1.2 (একটি অত্যন্ত পরিবর্তিত বংশের সাথে পূর্বে দক্ষিণ আফ্রিকায় চিহ্নিত), 4 বিটা এবং ডেল্টা ভেরিয়েন্টের সাথে কয়েকটি সাধারণ মিউটেশন শেয়ার করে, এটিতে 22টি অতিরিক্ত প্রতিস্থাপন রয়েছে (সন্নিবেশ এবং মুছে ফেলা সহ) অন্য কোনটিতে দেখা যায় না। উদ্বেগের বৈকল্পিক বা তারিখের আগ্রহের বৈকল্পিক। এই প্রতিস্থাপনগুলির মধ্যে, স্পাইক প্রোটিনে তার69_Val70del, পূর্বে আলফা ভেরিয়েন্টে (B.1.1.7) পর্যবেক্ষণ করা হয়েছিল, TaqPath-এ SGTF ঘটাতে পরিচিত।কোভিড-19পিসিআর পরীক্ষা।

জনস্বাস্থ্য পরিকল্পনা এবং প্রতিক্রিয়া নির্দেশ করার জন্য পূর্ববর্তী SARS-CoV-2 ভেরিয়েন্টের তুলনায় omicron ভেরিয়েন্টের ক্লিনিকাল তীব্রতার ডেটা প্রয়োজন। DATCOV-Gen5 হল একটি সম্ভাব্য নজরদারি নেটওয়ার্ক যা রিয়েল-টাইম SARS-CoV-2 জিনোম ডেটাকে হাসপাতালে ভর্তির ক্ষেত্রে বিশদ মহামারী সংক্রান্ত এবং ক্লিনিকাল ডেটার সাথে লিঙ্ক করে যাতে উদীয়মান SARS-CoV-এর তীব্রতা এবং ক্লিনিকাল উপস্থাপনার দ্রুত মূল্যায়ন করা যায়{{8 }} উদ্বেগের রূপ। আমরা ওমিক্রন ভেরিয়েন্টের জন্য প্রক্সি হিসেবে SGTF ব্যবহার করে দক্ষিণ আফ্রিকায় omicron ভেরিয়েন্টের সাথে SARS-CoV{10}} সংক্রমণের তীব্রতা মূল্যায়ন করার লক্ষ্য রেখেছিলাম।6

cistanche সালসা সুবিধাঅনাক্রম্যতা

পদ্ধতি

তথ্য উত্স এবং সংযোগ

এই ডেটা লিঙ্কেজ স্টাডিতে, আমরা চারটি উত্স থেকে জাতীয়, দক্ষিণ আফ্রিকান, ব্যক্তিগত-স্তরের ডেটা লিঙ্ক করেছি: (1) 1 জানুয়ারি থেকে 6 ডিসেম্বর, 2021 সময়ের জন্য জাতীয় COVID-19 কেস ডেটা, রিয়েল টাইমে রিপোর্ট করা হয়েছে ন্যাশনাল ইনস্টিটিউট ফর কমিউনিকেবল ডিজিজ (এনআইসিডি) নোটিফায়েবল মেডিকেল কন্ডিশন সার্ভিলেন্স সিস্টেম (এনএমসিএসএস); (2) SARS-CoV-2 ল্যাবরেটরি পরীক্ষার ডেটা (পরীক্ষা ব্যবহৃত এবং PCR চক্রের থ্রেশহোল্ড মান) 1 অক্টোবর-6 ডিসেম্বর, 2021 সময়ের জন্য, পাবলিক সেক্টর ল্যাবরেটরিগুলির জন্য (ন্যাশনাল হেলথ ল্যাবরেটরি সার্ভিস সমস্ত পরীক্ষার ডেটা রিপোর্ট করেছে) এবং একটি বড় বেসরকারি খাতের পরীক্ষাগার (শুধুমাত্র TaqPath পিসিআর পরীক্ষা রিপোর্ট করা হয়েছে); (3) 31 মার্চ, 2020-6 ডিসেম্বর, 2021 সময়ের জন্য SARS-CoV-2 জিনোম ডেটা, বেসরকারি এবং পাবলিক ডায়াগনস্টিক ল্যাবরেটরিগুলি থেকে এনআইসিডিতে পাঠানো ক্লিনিকাল নমুনার জন্য (প্রধানত গৌতেং, উত্তর পশ্চিম, এমপুমালাঙ্গা, এবং উত্তর কেপ প্রদেশ) এবং পাঁচটি প্রদেশে (ওয়েস্টার্ন কেপ, কোয়াজুলু-নাটাল, উত্তর পশ্চিম, গৌতেং এবং এমপুমালাঙ্গা) নিউমোনিয়া নজরদারি কর্মসূচির মাধ্যমে সংগ্রহ করা হয়েছে; এবং (4) DATCOV (31 মার্চ, 2020 এবং 21 ডিসেম্বর, 2021-এর মধ্যে), যা দক্ষিণ আফ্রিকার সমস্ত হাসপাতালের ব্যাপক কভারেজ সহ COVID{26}} হাসপাতালে ভর্তির জন্য একটি সক্রিয় নজরদারি ব্যবস্থা।8

আমরা যে কেস এবং হাসপাতালে ভর্তির ডেটা ব্যবহার করেছি তা সমগ্র দক্ষিণ আফ্রিকা সহ পূর্বোক্ত জাতীয়, ব্যাপক, জনসংখ্যা-ভিত্তিক ডেটাসেট থেকে এসেছে। ন্যাশনাল COVID{1}} কেস ডাটাবেস (NICD NMCSS) হল একটি ল্যাবরেটরি-ভিত্তিক নজরদারি প্রোগ্রাম যা দক্ষিণ আফ্রিকার সমস্ত ল্যাবরেটরি-নিশ্চিত SARS-CoV-2 কেসের রিয়েল-টাইম ইলেকট্রনিক ডেটা পায়। মামলার প্রতিবেদন আইন দ্বারা বাধ্যতামূলক এবং নিরীক্ষিত। প্রতিটি ক্ষেত্রে জনস্বাস্থ্য কর্মকর্তাদের দ্বারা তদন্ত করা হয় এবং চিহ্নিত ডেটা ত্রুটিগুলি ডাটাবেসে সংশোধন করা হয়। এই বিশ্লেষণে ব্যবহৃত SARS-CoV-2 পরীক্ষাগার পরীক্ষার ডেটা জাতীয় ডেটা। অন্তর্ভুক্ত ল্যাবরেটরিগুলি (সমস্ত পাবলিক সেক্টর ল্যাবরেটরি এবং একটি বেসরকারী-সেক্টর ল্যাবরেটরি) বেছে নেওয়া হয়েছিল কারণ এই ল্যাবরেটরিগুলি পিসিআর পরীক্ষার পদ্ধতি এবং সাইকেল থ্রেশহোল্ড মানগুলির ডেটা প্রদান করতে সক্ষম হয়েছিল এবং সমস্ত SARS-CoV-এর অর্ধেকেরও বেশি প্রতিনিধিত্ব করেছিল-2 দক্ষিণ আফ্রিকায় 1 অক্টোবর থেকে 6 ডিসেম্বর, 2021-এর মধ্যে পরীক্ষাগুলি করা হয়েছে৷ DATCOV নজরদারি প্রোগ্রামটি আগে বিশদভাবে বর্ণনা করা হয়েছে৷8 DATCOV ব্যবহার করে, আমরা ল্যাবরেটরি-নিশ্চিত SARS-CoV-2 সহ হাসপাতালে ভর্তি সমস্ত রোগীর ডেটা অন্তর্ভুক্ত করেছি দক্ষিন আফ্রিকা. পাবলিক সেক্টরের হাসপাতালগুলিতে, ডেটা রোগীর রেকর্ড থেকে বিমূর্ত করা হয় এবং সরাসরি ডেডিকেটেড ডেটা ক্যাপচারারদের দ্বারা ক্যাপচার করা হয়, এবং, বেসরকারী হাসপাতাল এবং ওয়েস্টার্ন কেপ প্রদেশের পাবলিক সেক্টরে, হাসপাতালের ডেটা সিস্টেম থেকে দৈনিক বাল্ক এক্সট্র্যাক্টে ডেটা ইলেকট্রনিকভাবে স্থানান্তর করা হয়। DATCOV-এর মধ্যে COVID{19}} উপসর্গের জন্য হাসপাতালে ভর্তি হওয়া রোগী, অর্জিত নোসোকোমিয়াল SARS-CoV-2 সংক্রমণের রোগী এবং অন্যান্য কারণে হাসপাতালে ভর্তি হওয়ার সময় ঘটনাক্রমে ইতিবাচক পরীক্ষা করা রোগীদের অন্তর্ভুক্ত করে। মামলা এবং পরীক্ষার ডেটা 6 ডিসেম্বর, 2021-এ প্রাপ্ত হয়েছিল এবং DATCOV ডেটা 21 ডিসেম্বর, 2021-এ প্রাপ্ত হয়েছিল। হাসপাতালে ভর্তি এবং তীব্রতা বিশ্লেষণের জন্য, 1 ডিসেম্বর, 2021-এর আগে সংগৃহীত নমুনা সহ কেসগুলিকে সেন্সর করা হয়েছিল।

আমরা স্বতন্ত্র-স্তরের ডেটা লিঙ্কেজ সঞ্চালিত করেছি যখন তারা বিদ্যমান ছিল তখন অনন্য শনাক্তকারী ব্যবহার করে; অন্যথায়, আমরা নাম, উপাধি (পারিবারিক নাম) এবং জন্ম তারিখের সংমিশ্রণ ব্যবহার করতাম। ডেটা লিঙ্কেজের পরে, সঠিকতা নিশ্চিত করতে স্বয়ংক্রিয় এবং ম্যানুয়াল চেকের সংমিশ্রণ ব্যবহার করা হয়েছিল। অত্যাবশ্যকীয় সংক্রামক রোগ নজরদারি (M210752) এর অংশ হিসাবে COVID-19 কেস এবং পরীক্ষার ডেটা সংগ্রহের জন্য উইটওয়াটারসরান্ড বিশ্ববিদ্যালয়ের হিউম্যান রিসার্চ এথিক্স কমিটি (মেডিকেল) থেকে এবং DATCOV নজরদারি প্রোগ্রামের জন্য নৈতিক অনুমোদন প্রাপ্ত হয়েছিল (M2010108)।

সংজ্ঞা

সংক্রমণগুলিকে SGTF হিসাবে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়েছিল (ওমিক্রন ভেরিয়েন্টের জন্য একটি প্রক্সি হিসাবে) যখন একজন ব্যক্তি TaqPath COVID{0}} PCR পরীক্ষায় একটি অ-শনাক্তযোগ্য S জিন লক্ষ্য এবং ORF1ab-এর জন্য 30 বা তার কম সাইকেল থ্রেশহোল্ড সহ PCR পরীক্ষায় পজিটিভ পরীক্ষা করে বা নিউক্লিওক্যাপসিড জিন টার্গেট।9 আমরা 30 বা তার কম সাইকেল থ্রেশহোল্ডের মধ্যে সীমাবদ্ধ করেছি যাতে ভুলভাবে শ্রেণীবদ্ধ করা সংক্রমণ এড়ানো যায় যার জন্য এস জিনটি SGTF (অর্থাৎ, উচ্চ সাইকেল থ্রেশহোল্ড মান) হিসাবে সনাক্ত করা যায়নি (কম ভাইরাল লোডের কারণে)। ORF1ab বা নিউক্লিওক্যাপসিড জিন লক্ষ্যমাত্রার জন্য 30 বা তার কম সাইকেল থ্রেশহোল্ড সহ TaqPath COVID-19 PCR পরীক্ষায় যখন একজন ব্যক্তি ইতিবাচক পরীক্ষা করেন তখন সংক্রমণগুলিকে নন SGTF হিসাবে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়েছিল এবং সনাক্তযোগ্য S জিন লক্ষ্য ছিল। ডেল্টা বৈকল্পিক জিনোম সিকোয়েন্সিং দ্বারা চিহ্নিত করা হয়েছিল।

একজন ব্যক্তি যদি নমুনা সংগ্রহের তারিখের 7 দিন আগে থেকে 21 দিনের মধ্যে ভর্তির তারিখ সহ DATCOV ডাটাবেসে একটি মামলার সাথে লিঙ্ক করে তবে তাকে হাসপাতালে ভর্তি করা হয়েছে বলে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়েছিল। আমরা ভর্তির আগে পরীক্ষার তারিখ সহ ভর্তি অন্তর্ভুক্ত করেছি কারণ ভর্তির সময় চিকিত্সকরা SARS-CoV-2 সংক্রমণের সন্দেহ নাও করতে পারেন, প্রাথমিক পরীক্ষাগুলি নেতিবাচক হতে পারে, বা সংক্রমণ নসোকোমিয়ালভাবে অর্জিত হতে পারে। গুরুতর রোগকে হাসপাতালে ভর্তি রোগী হিসাবে সংজ্ঞায়িত করা হয়েছিল যেটি নিম্নলিখিত মানদণ্ডগুলির মধ্যে অন্তত একটি পূরণ করেছে: একটি নিবিড় পরিচর্যা ইউনিটে (আইসিইউ) ভর্তি করা হয়েছে; অক্সিজেন চিকিত্সার কোনো স্তর প্রাপ্ত; বায়ুচলাচল ছিল; এক্সট্রাকর্পোরিয়াল মেমব্রেন অক্সিজেনেশন পেয়েছে; তীব্র শ্বাসকষ্টের সিন্ড্রোম ছিল, বা মারা গিয়েছিল। কমরবিডিটি নিম্নলিখিত অবস্থার মধ্যে অন্তত একটির উপস্থিতি হিসাবে সংজ্ঞায়িত করা হয়েছিল: উচ্চ রক্তচাপ, ডায়াবেটিস, দীর্ঘস্থায়ী কার্ডিয়াক ডিজিজ, দীর্ঘস্থায়ী কিডনি রোগ, হাঁপানি, দীর্ঘস্থায়ী বাধা পালমোনারি রোগ, ম্যালিগন্যান্সি, এইচআইভি এবং সক্রিয় বা পূর্ববর্তী যক্ষ্মা। স্থূলতা এবং গর্ভাবস্থা সম্পর্কিত ডেটা অন্তর্ভুক্ত করা হয়নি কারণ এই ডেটাগুলি পদ্ধতিগতভাবে সংগ্রহ করা হয়নি। বর্তমান পজিটিভ COVID-19 পরীক্ষার 90 দিনের বেশি আগে একজন ব্যক্তির অন্তত একটি পজিটিভ COVID-19 পরীক্ষা (হয় পিসিআর-ভিত্তিক বা অ্যান্টিজেন-ভিত্তিক) দ্বারা পুনরায় সংক্রমণ সংজ্ঞায়িত করা হয়েছিল। SARS-CoV{10}} ভ্যাকসিনের অন্তত একটি ডোজ (Ad.26.COV2.S [Johnson & Johnson] বা BNT162b2 [Pfizer-BioNTech]) হিসেবে ভ্যাকসিনেশনকে সংজ্ঞায়িত করা হয়েছে।

পরিসংখ্যান সংক্রান্ত বিশ্লেষণ

ওমিক্রনের প্রারম্ভিক তরঙ্গ (সপ্তাহ 46-48; নভেম্বর 14-ডিসেম্বর 4, 2021) চলাকালীন সমস্ত পাবলিক সেক্টর পজিটিভ COVID-19 পিসিআর পরীক্ষার (যেকোন পিসিআর পরীক্ষা) জন্য গড় চক্র থ্রেশহোল্ড মান (ভাইরাল লোডের জন্য একটি প্রক্সি) স্টুডেন্টস টি-টেস্ট ব্যবহার করে ডেল্টার প্রারম্ভিক তরঙ্গের সাথে তুলনা করা হয়েছিল (সপ্তাহ 18-20; মে 2-22, 2021)। দেশটি প্রতি 100000 জনে 30টি মামলার সাপ্তাহিক ঘটনা অতিক্রম করার আগের সপ্তাহ থেকে 2 সপ্তাহ পরে প্রারম্ভিক তরঙ্গের সময়কাল সংজ্ঞায়িত করা হয়েছিল।10 যখন পিসিআর পরীক্ষায় এক বা একাধিক জিন লক্ষ্য অন্তর্ভুক্ত করা হয়েছিল, তখন সর্বনিম্ন চক্র থ্রেশহোল্ড মান সহ লক্ষ্যমাত্রা ব্যবহার করা হয়েছিল। বিশ্লেষণ

1 অক্টোবর থেকে 30 নভেম্বর, 2021-এর মধ্যে নির্ণয় করা নন-SGTF-সংক্রমিত ব্যক্তিদের সঙ্গে, হাসপাতালে ভর্তি SGTF-সংক্রমিত ব্যক্তিদের সঙ্গে হাসপাতালে ভর্তি নন-SGTF-সংক্রমিত ব্যক্তিদের সঙ্গে SGTF-সংক্রমিত ব্যক্তিদের তুলনা করে আমরা SGTF সংক্রমণের মহামারী সংক্রান্ত বৈশিষ্ট্য বর্ণনা করেছি। 30, 2021, এবং হাসপাতালে ভর্তি SGTF-সংক্রমিত ব্যক্তি 1 অক্টোবর থেকে 30 নভেম্বর, 2021 এর মধ্যে নির্ণয় করা হয়েছে, হাসপাতালে ভর্তি ডেল্টা ভেরিয়েন্ট সংক্রামিত ব্যক্তি 1 এপ্রিল থেকে 9 নভেম্বর, 2021 এর মধ্যে নির্ণয় করা হয়েছে, মাল্টিভেরিয়েবল লজিস্টিক রিগ্রেশন বিশ্লেষণ ব্যবহার করে।

SARS-CoV-2 ওমিক্রন ভেরিয়েন্টের সংক্রমণের তীব্রতা দুটি উপায়ে মূল্যায়ন করা হয়েছিল: (1) 1 অক্টোবর থেকে 30 নভেম্বর, 2021-এর মধ্যে নির্ণয় করা SGTF বনাম নন-SGTF সংক্রমণের ব্যক্তিদের তুলনা করে এবং (2) দ্বারা 1 এপ্রিল থেকে 9 নভেম্বর, 2021-এর মধ্যে নির্ণয় করা ডেল্টা ভেরিয়েন্ট সংক্রমণে আক্রান্ত ব্যক্তিদের তুলনা করা হচ্ছে, SGTF- আক্রান্ত ব্যক্তিদের সঙ্গে যাদের 1 অক্টোবর থেকে 30 নভেম্বর, 2021-এর মধ্যে নির্ণয় করা হয়েছিল। হাসপাতালে ভর্তি এবং হাসপাতালের ফলাফলের জন্য কমপক্ষে 3 সপ্তাহ ফলোআপ। 5 মার্চ, 2020 এবং 18 ডিসেম্বর, 2021-এর মধ্যে DATCOV ডাটাবেসের মধ্যে COVID-19 আক্রান্ত ব্যক্তিদের মধ্যে, হাসপাতালে ভর্তি হওয়ার মধ্যবর্তী সময় ছিল 6 দিন (IQR 3-11 দিন; n{{ 29}}) সামগ্রিকভাবে, মৃত ব্যক্তিদের জন্য 5 দিন (2–11; n=94938), এবং 6 দিন (3–10; n=304845) ব্যক্তিদের জন্য যারা জীবিত অবস্থায় ছাড়া পেয়েছিলেন। অতএব, আমরা ন্যূনতম 3 সপ্তাহের ফলো-আপ সহ অনেক ফলাফল মিস করার সম্ভাবনা ছিলাম না। তীব্রতা বিশ্লেষণগুলি ভর্তির মধ্যেই সীমাবদ্ধ ছিল যেগুলির ফলাফল ইতিমধ্যেই জমা হয়েছে এবং এখনও হাসপাতালে থাকা সমস্ত রোগীদের বাদ দেওয়া হয়েছিল কারণ, DATCOV প্রোগ্রামে, সরকারী সেক্টরের হাসপাতালে হাসপাতালে ভর্তির বিস্তারিত তথ্য (যেমন, অক্সিজেন চিকিত্সা বা আইসিইউ ভর্তি) ছাড়ার সময় জনবহুল। অথবা মৃত্যু।

ফলাফল পরিবর্তনশীল হিসাবে হাসপাতালে ভর্তি ব্যক্তিদের মধ্যে হাসপাতালে ভর্তি এবং গুরুতর রোগ মূল্যায়ন করার জন্য দুটি মডেল তৈরি করা হয়েছিল। 1 অক্টোবর থেকে 30 নভেম্বর, 2021-এর মধ্যে নির্ণয় করা COVID-19 আক্রান্ত ব্যক্তিদের মধ্যে হাসপাতালে ভর্তির সাথে SGTF সংক্রমণ বনাম নন-SGTF সংক্রমণের সম্পর্ক মূল্যায়ন করার জন্য মাল্টিভেরিয়েবল লজিস্টিক রিগ্রেশন করা হয়েছিল। আমরা হাসপাতালে ভর্তির সাথে সম্পর্কিত কারণগুলির জন্য নিয়ন্ত্রণ করেছি (যেমন , বয়স, লিঙ্গ, প্রদেশ, এবং স্বাস্থ্য-যত্ন সেক্টর [প্রাইভেট বনাম পাবলিক]) এবং পরিচিত পূর্ববর্তী SARS-CoV-2 সংক্রমণের জন্য সামঞ্জস্য করা হয়েছে। ভ্যাকসিনেশন স্ট্যাটাস এবং কমোর্বিডিটিস সম্পর্কিত ডেটা শুধুমাত্র হাসপাতালে ভর্তি ব্যক্তিদের জন্য উপলব্ধ ছিল; অতএব, আমরা এই বিশ্লেষণে এই ভেরিয়েবলগুলির জন্য নিয়ন্ত্রণ করতে পারিনি। 1 অক্টোবর থেকে 30 নভেম্বর, 2021-এর মধ্যে হাসপাতালে ভর্তি হওয়া ব্যক্তিদের মধ্যে রোগের তীব্রতার সাথে SGTF সংক্রমণ বনাম নন-SGTF সংক্রমণের সম্পর্ক মূল্যায়ন করার জন্য মাল্টিভেরিয়েবল লজিস্টিক রিগ্রেশন করা হয়েছিল 21 ডিসেম্বর, 2021-এ (যারা এখনও হাসপাতালে আছেন তাদের বাদ দিয়ে)। আমরা রোগের তীব্রতার (অর্থাৎ, বয়স, সহবাসের উপস্থিতি, লিঙ্গ, প্রদেশ এবং স্বাস্থ্যসেবা সেক্টর) এর সাথে সম্পর্কিত কারণগুলির জন্য নিয়ন্ত্রণ করেছি এবং নমুনা সংগ্রহের তারিখ এবং হাসপাতালে ভর্তির তারিখের মধ্যে দিনের সংখ্যার জন্য সামঞ্জস্য করেছি, পরিচিত পূর্ববর্তী SARS-CoV-2 সংক্রমণ, এবং SARS-CoV-2 টিকা দেওয়ার অবস্থা।

আমরা 1 এপ্রিল থেকে 9 নভেম্বর, 2021-এর মধ্যে নির্ণয় করা ডেল্টা ভেরিয়েন্ট সংক্রমণের তুলনা করেছি, 1 অক্টোবর থেকে 30 নভেম্বর, 2021-এর মধ্যে নির্ণয় করা SGTF সংক্রমণের সঙ্গে। মাল্টিভেরিয়েবল লজিস্টিক রিগ্রেশনের সঙ্গে SGTF সংক্রমণ বনাম ডেল্টা ভ্যারিয়েন্ট হাসপাতালের পৃথক রোগের সংক্রমণের মধ্যে সম্পর্ক মূল্যায়ন করা হয়েছিল। , 21 ডিসেম্বর, 2021-এ পরিচিত হাসপাতালের ফলাফল সহ ব্যক্তিদের মধ্যে সীমাবদ্ধ (যারা এখনও হাসপাতালে আছে তাদের বাদ দিয়ে)। আমরা রোগের তীব্রতার (যেমন, বয়স, সহবাসের উপস্থিতি, লিঙ্গ, প্রদেশ এবং স্বাস্থ্যসেবা খাত) সম্পর্কিত কারণগুলির জন্য নিয়ন্ত্রণ করেছি এবং নমুনা সংগ্রহ এবং হাসপাতালে ভর্তির মধ্যে দিনের সংখ্যার জন্য সামঞ্জস্য করেছি, যা পূর্ববর্তী SARS-CoV পরিচিত ছিল-2 সংক্রমণ, এবং SARS-CoV-2 টিকা দেওয়ার অবস্থা। আমরা ডেল্টা বৈকল্পিক সংক্রমণে আক্রান্ত ব্যক্তিদের এবং SGTF সংক্রমণে আক্রান্ত ব্যক্তিদের মধ্যে হাসপাতালে ভর্তির ঝুঁকির তুলনা করিনি কারণ ডেল্টা ভেরিয়েন্টের জন্য ক্রমানুসারে নমুনাগুলি জনসংখ্যা-ভিত্তিক ছিল না এবং কেবলমাত্র ডেল্টা বৈকল্পিক সংক্রমণের একটি ছোট উপসেট প্রতিনিধিত্ব করে যা সিকোয়েন্সিংয়ের জন্য NICD-তে পাঠানো হয়েছিল। .

শ্রেণীগত ভেরিয়েবলগুলি ফ্রিকোয়েন্সি ডিস্ট্রিবিউশন ব্যবহার করে সংক্ষিপ্ত করা হয়েছিল এবং পিয়ারসনের χ² পরীক্ষা ব্যবহার করে তুলনা করা হয়েছিল। পেয়ারওয়াইজ মিথস্ক্রিয়াগুলি চূড়ান্ত মাল্টিভেরিয়েবল অ্যাডেটিভ মডেলগুলিতে অবশিষ্ট সমস্ত ভেরিয়েবলের জন্য পণ্য শর্তাবলী অন্তর্ভুক্তির দ্বারা মূল্যায়ন করা হয়েছিল। স্ট্যাটা, সংস্করণ 14.1 ব্যবহার করে বিশ্লেষণ করা হয়েছিল। p মান 0·০৫ এর চেয়ে কম পরিসংখ্যানগতভাবে তাৎপর্যপূর্ণ বলে বিবেচিত হয়।

তহবিল উৎসের ভূমিকা

গবেষণার তহবিলকারীদের অধ্যয়নের নকশা, ডেটা সংগ্রহ, ডেটা বিশ্লেষণ, ডেটা ব্যাখ্যা বা প্রতিবেদন লেখার ক্ষেত্রে কোনও ভূমিকা ছিল না।

ফলাফল

1 অক্টোবর (সপ্তাহ 39), 2021, থেকে 6 ডিসেম্বর (সপ্তাহ 49), 2021, জাতীয়ভাবে 161328 টি কোভিড-19 কেস রিপোর্ট করা হয়েছিল, যার মধ্যে 104529 (64·8 শতাংশ) আমাদের বিশ্লেষণে অন্তর্ভুক্ত পরীক্ষাগারগুলি থেকে ছিল ( পরিশিষ্ট pp 6-7)। এর মধ্যে 104 529, 38282 (36·6 শতাংশ) TaqPath COVID-19 PCR পরীক্ষার মাধ্যমে নির্ণয় করা হয়েছে। TaqPath PCR পরীক্ষা দ্বারা নির্ণয় করা মামলাগুলির মধ্যে, 31 133 (81·3 শতাংশ) একটি সাইকেল থ্রেশহোল্ড মান 30 বা তার কম অন্তত একটি জিন লক্ষ্যের জন্য ছিল, যার মধ্যে 29721 (95·5 শতাংশ) ছিল SGTF সংক্রমণ এবং 1412 (4·5 শতাংশ) ছিল অ-SGTF সংক্রমণ। 14 ডিসেম্বর, 2021 পর্যন্ত জিনোম ডেটা সহ সমস্ত SGTF নমুনাগুলিকে ওমিক্রন (n=30) হিসাবে নিশ্চিত করা হয়েছিল। SGTF সংক্রমণের অনুপাত 2021 সালের 48 সপ্তাহে (চিত্র 1) 39 সপ্তাহে 22455-এর মধ্যে 21978 (97·9 শতাংশ) থেকে বেড়ে 63-এর মধ্যে দুইটি (3·2 শতাংশ) হয়েছে (চিত্র 1)। SGTF সংক্রমণের অনুপাত প্রথম 43 সপ্তাহে (24 অক্টোবর, 2021 থেকে শুরু হওয়া সপ্তাহ; পরিশিষ্ট p 8) গাউতেং ​​প্রদেশে প্রথম বাড়তে শুরু করে। SGTF সংক্রমণের অনুপাতে তীক্ষ্ণ বৃদ্ধি পরবর্তীতে অন্যান্য সমস্ত প্রদেশে শনাক্ত করা হয়েছিল, এবং, 47 সপ্তাহের মধ্যে, সমস্ত প্রদেশে বেশিরভাগ SARS-CoV{49}} সংক্রমণ ছিল SGTF সংক্রমণ (পরিশিষ্ট p 8)। পাবলিক সেক্টরে সমস্ত ইতিবাচক PCR পরীক্ষার গড় চক্র থ্রেশহোল্ড মান ডেল্টা বৈকল্পিক সংক্রমণের প্রাথমিক তরঙ্গের তুলনায় ওমিক্রন (23·95 [SD 6·06]; n=16542) এর প্রাথমিক তরঙ্গের সময় কম ছিল 26·98 [6·52]; n=10022; পৃ<>

আমরা 1 অক্টোবর থেকে 30 নভেম্বর, 2021-এর মধ্যে নির্ণয় করা SGTF সংক্রমণে আক্রান্ত সমস্ত ব্যক্তির বৈশিষ্ট্যের তুলনা করেছি, একই সময়ের মধ্যে নন-SGTF সংক্রমণ নির্ণয় করা ব্যক্তিদের সাথে। বহু পরিবর্তনশীল বিশ্লেষণে, SGTF বনাম নন-SGTF সংক্রমণের অনুপাত ভৌগলিক প্রদেশ অনুসারে উল্লেখযোগ্যভাবে পরিবর্তিত হওয়ার পাশাপাশি, SGTF সংক্রমণে আক্রান্ত ব্যক্তিদের বয়স 5-59 বছর (বনাম 60 বছরের বেশি বা সমান) হওয়ার সম্ভাবনা বেশি ছিল এবং তাদের দ্বারা নির্ণয় করা হয়েছিল বেসরকারী খাত (বনাম পাবলিক সেক্টর) এবং নন-SGTF ইনফেকশনে আক্রান্ত ব্যক্তিদের তুলনায় হাসপাতালে ভর্তি হওয়ার সম্ভাবনা কম ছিল (সারণী 1)। 1 অক্টোবর থেকে 30 নভেম্বর, 2021 (পরিশিষ্ট pp 1-3) মধ্যে নির্ণয় করা হাসপাতালে ভর্তি SGTF-সংক্রমিত ব্যক্তি এবং হাসপাতালে ভর্তি নন-SGTF-সংক্রমিত ব্যক্তিদের মধ্যে বৈশিষ্ট্যের তুলনা করার সময় এবং 11 অক্টোবর এবং 11 নভেম্বরের মধ্যে হাসপাতালে ভর্তি SGTF-সংক্রমিত ব্যক্তিদের তুলনা করার সময় একই ফলাফল পাওয়া গেছে। 30, 2021, 1 এপ্রিল থেকে 9 নভেম্বর, 2021 এর মধ্যে হাসপাতালে ভর্তি ডেল্টা ভেরিয়েন্ট-সংক্রমিত ব্যক্তিদের সাথে (পরিশিষ্ট পিপি 3-5)।

1 অক্টোবর থেকে 30 নভেম্বর, 2021 এর মধ্যে SGTF সংক্রমণে আক্রান্ত 10 547 ব্যক্তির মধ্যে 256 (2·4 শতাংশ) হাসপাতালে ভর্তি হয়েছেন, যেখানে 121 (12·8 শতাংশ) 948 জন নন-SGTF আক্রান্ত ব্যক্তির তুলনায় সংক্রমণ (p<0·001; table="" 2).="" in="" multivariable="" analyses,="" after="" controlling="" for="" factors="" associated="" with="" hospitalization,="" individuals="" with="" sgtf="" infections="" had="" significantly="" lower="" odds="" of="" being="" admitted="" to="" hospital="" than="" did="" individuals="" with="" non-sgtf="" infections="" (adjusted="" odds="" ratio="" [aor]="" 0·2,="" 95%="" ci="" 0·1–0·3;="" table="" 2).="" in="" addition="" to="" variation="" by="" geographical="" province,="" hospital="" admission="" was="" significantly="" associated="" with="" young="" age=""><5 years;="" aor="" 9·3)="" and="" older="" age="" (≥60="" years;="" aor="" 3·1)="" compared="" with="" individuals="" aged="" 19–24="" years,="" and="" female="" sex="" (aor="" 1·3)="" versus="" male="" sex="" (table="" 2).="" individuals="" diagnosed="" by="" the="" private="" versus="" the="" public="" healthcare="" sector="" were="" less="" likely="" to="" be="" admitted="" to="" hospitals="" (aor="" 0·8;="" table="">

1 অক্টোবর থেকে 3 নভেম্বরের মধ্যে 382 জন হাসপাতালে ভর্তি হওয়া ব্যক্তির মধ্যে COVID-19 নির্ণয় করা হয়েছে0, 2021, 317 (83 শতাংশ) 21 ডিসেম্বর, 2021 এর মধ্যে হাসপাতালের ফলাফল জমা করেছিলেন গুরুতর রোগের সাথে সম্পর্কিত কারণগুলির জন্য নিয়ন্ত্রণ করার পরে, SGTF বনাম নন-SGTF সংক্রমণে আক্রান্ত ব্যক্তিদের মধ্যে গুরুতর রোগের সম্ভাবনার জন্য পয়েন্ট অনুমান 1-এর কম ছিল, কিন্তু 95 শতাংশ CI প্রশস্ত ছিল (aOR 0·7, 95 শতাংশ CI 0 ·3–1·4; টেবিল 3)। গুরুতর রোগের সম্ভাবনা ভৌগলিকভাবে পরিবর্তিত হয় এবং 60 বছর বা তার বেশি বয়সী ব্যক্তিদের মধ্যে (aOR 11·5) 19-24 বছর বয়সী ব্যক্তিদের মধ্যে উল্লেখযোগ্যভাবে বেশি ছিল (সারণী 3)।

31 মার্চ, 2020, থেকে 6 ডিসেম্বর, 2021 পর্যন্ত, কোভিড-19 আক্রান্ত 1734 জন হাসপাতালে ভর্তি রোগী ছিল যাদের জন্য জিনোম সিকোয়েন্সিং (নন-ভেরিয়েন্ট, আলফা, বিটা বা ডেল্টা) বা TaqPath PCR দ্বারা বৈকল্পিক তথ্য উপলব্ধ ছিল (1 অক্টোবর থেকে 6 ডিসেম্বর, 2021-এর মধ্যে omicron ভেরিয়েন্টের প্রক্সি হিসেবে SGTF)। এই 1734 জনের মধ্যে 792 (45·7 শতাংশ) 1 এপ্রিল, 2021 (সপ্তাহ 13) থেকে 9 নভেম্বর, 2021 (সপ্তাহ 45), এবং 212 (12·2 শতাংশ) থেকে SGTF সংক্রমণ হয়েছিল 1 অক্টোবর, 2021, (সপ্তাহ 39) থেকে 6 ডিসেম্বর, 2021 (সপ্তাহ 49; চিত্র 2)।

1142 জন হাসপাতালে ভর্তি ব্যক্তিদের মধ্যে, 1037 (90·8 শতাংশ) 21 ডিসেম্বর, 2021 তারিখের মধ্যে একটি হাসপাতালের ফলাফল জমা করেছিল। গুরুতর রোগের সাথে সম্পর্কিত কারণগুলির জন্য নিয়ন্ত্রণ করার পরে, 1 অক্টোবর থেকে 30 নভেম্বর, 2021-এর মধ্যে নির্ণয় করা SGTF সংক্রমণে আক্রান্ত ব্যক্তিদের মধ্যে 1 এপ্রিল থেকে 9 নভেম্বর, 2021-এর মধ্যে নির্ণয় করা ডেল্টা ভেরিয়েন্ট সংক্রমণের তুলনায় গুরুতর রোগের সম্ভাবনা উল্লেখযোগ্যভাবে কম ছিল, (aOR 0·3, 95 শতাংশ CI 0·2–0·5; টেবিল 4)। ভৌগোলিক প্রদেশের পরিবর্তনের পাশাপাশি, বয়স্ক বয়স (40-59 বছর এবং 60 বছরের বেশি বা সমান বনাম 19-24 বছর) এবং একটি কমরবিড অবস্থা গুরুতর রোগের বর্ধিত সম্ভাবনার সাথে যুক্ত ছিল (সারণী 4)। ব্যক্তিদের বয়স 13-18 বছর (বনাম 19-24 বছর) এবং মহিলাদের (বনাম পুরুষদের) গুরুতর রোগের সম্ভাবনা কম ছিল (সারণী 4)।

আলোচনা

2021 সালের নভেম্বরে, দক্ষিণ আফ্রিকায় omicron SARS-CoV-2 বৈকল্পিক আবির্ভূত হয়েছিল, রিপোর্ট করা COVID-19 মামলার সংখ্যা দ্রুত বৃদ্ধির সাথে সাথে, ২ চতুর্থ মহামারী তরঙ্গের দিকে নিয়ে যায়। যদিও ফেনোটাইপিক আচরণ এবং ইমিউন পালানোর দ্রুত মূল্যায়ন করার জন্য অসংখ্য গবেষণা চলছে, ওমিক্রন বৈকল্পিকের সাথে সংক্রমণের ক্লিনিকাল তীব্রতা বোঝাও গুরুত্বপূর্ণ। আমরা SGTF সংক্রমণের তীব্রতা মূল্যায়ন করেছি (ওমিক্রন ভেরিয়েন্টের জন্য একটি প্রক্সি) একই সময়ের মধ্যে নির্ণয় করা নন-SGTF সংক্রমণের সাথে এবং ডেল্টা ভেরিয়েন্টের সংক্রমণের সাথে তুলনা করে, যা দক্ষিণ আফ্রিকায় তৃতীয় তরঙ্গে আধিপত্য বিস্তার করে। এসজিটিএফ বনাম নন-এসজিটিএফ সংক্রমণে আক্রান্ত ব্যক্তিদের হাসপাতালে ভর্তি হওয়ার সম্ভাবনা 80 শতাংশ কম ছিল, তবে আমরা হাসপাতালে ভর্তি হওয়া ব্যক্তিদের মধ্যে গুরুতর রোগের ঝুঁকি সম্পর্কে কোনো দৃঢ় সিদ্ধান্তে পৌঁছাতে পারিনি, সম্ভবত কম সংখ্যক ব্যক্তির অন্তর্ভুক্ত হওয়ার কারণে এই বিশ্লেষণে ডেল্টা বৈকল্পিক সংক্রমণের সাথে তুলনা করলে, SGTF সংক্রমণগুলি গুরুতর রোগের 70 শতাংশ কম সম্ভাবনার সাথে যুক্ত ছিল। উপরন্তু, আমরা দেখতে পেয়েছি যে গড় পিসিআর চক্র থ্রেশহোল্ড ডেল্টার প্রাথমিক তরঙ্গের তুলনায় ওমিক্রনের প্রাথমিক তরঙ্গের সময় কম ছিল, যা ওমিক্রন বৈকল্পিক বনাম ডেল্টা বৈকল্পিক দ্বারা সংক্রামিত ব্যক্তিদের মধ্যে উচ্চ ভাইরাল লোড প্রতিফলিত করতে পারে।

DATCOV নজরদারি প্রোগ্রামের ডেটা তৃতীয় তরঙ্গের তুলনায় চতুর্থ তরঙ্গের প্রথম দিকের তুলনায় 20 বছরের কম বয়সী লোকেদের মধ্যে ভর্তির একটি উচ্চ অনুপাত দেখিয়েছে। 11 আমাদের গবেষণায়, আমরা আরও দেখতে পেয়েছি যে SGTF-সংক্রমিত ব্যক্তিদের তুলনায় যারা কম বয়সী SGTF বা ডেল্টা সংক্রমণ; এই প্রভাবটি শিশুদের মধ্যে সীমাবদ্ধ ছিল না কারণ বয়স্ক প্রাপ্তবয়স্কদের (60 বছরের বেশি বা সমান) তুলনায় অল্প বয়স্ক বয়সের (যেমন, 19-24 বছর) মধ্যে আরও বেশি SGTF সংক্রমণ (বনাম নন-SGTF বা ডেল্টা) ছিল। ) পূর্ববর্তী সংক্রমণের উচ্চ হার বা ভ্যাকসিনেশনের ফলে বয়স্ক প্রাপ্তবয়স্কদের অনাক্রম্যতা বৃদ্ধির সাথে এই অনুসন্ধান সম্পর্কিত হতে পারে।

আমাদের অনুসন্ধানগুলি হাসপাতালে ভর্তির ডেটার সাথে সম্পর্কযুক্ত যে দেখায় যে দক্ষিণ আফ্রিকার 10কোভিড সহ 61 জন রোগীর মধ্যে-19 এবং একটি পরিচিত হাসপাতালের ফলাফল, 324 (30·5 শতাংশ) চতুর্থ তরঙ্গের প্রথম দিকে গুরুতর রোগে আক্রান্ত হয়েছিল, তৃতীয় তরঙ্গের প্রথম দিকের 1408 জন রোগীর মধ্যে 943 (67·0 শতাংশ) এর সাথে তুলনা করা হয়েছে। 11 নভেম্বর 2021 নাগাদ, দক্ষিণ আফ্রিকার জনসংখ্যার একটি উচ্চ অনুপাত পূর্বের প্রাকৃতিক কারণে কিছু মাত্রায় SARS-CoV-2 রোগ প্রতিরোধ ক্ষমতা পেয়েছিল সংক্রমণ, টিকা বা উভয়ই। তৃতীয় SARS-CoV-2 তরঙ্গের পরে, দক্ষিণ আফ্রিকার 60-70 শতাংশ ব্যক্তির পূর্বের SARS-CoV-2 সংক্রমণের প্রমাণ ছিল৷ 60 বছর বা তার বেশি বয়সী, 55 শতাংশ 50-59 বছর বয়সী, 35-49 বছর বয়সী 43 শতাংশ এবং 18-34 বছর বয়সী 24 শতাংশকে SARS-CoV-2 (Ad.26. COV2 এর এক ডোজ) এর বিরুদ্ধে সম্পূর্ণ টিকা দেওয়া হয়েছিল .S [Johnson & Johnson] বা BNT162b2 [Pfizer–BioNTech] এর দুটি ডোজ।13 এটি প্রস্তাব করা হয়েছে যে ওমিক্রন ভেরিয়েন্টটি অন্যান্য ভেরিয়েন্টের তুলনায় ইমিউন পালানোর ক্ষমতা উল্লেখযোগ্যভাবে বৃদ্ধি করেছে। -ওমিক্রন ভ্যারিয়েন্টের আবির্ভাবের সময় দক্ষিণ আফ্রিকায় বিদ্যমান অনাক্রম্যতা, মানে ওমিক্রন সংক্রমণের একটি উচ্চ অনুপাত পুনঃসংক্রমন হতে পারে এবং এই অনুপাত অন্যান্য রূপের সমসাময়িক সংক্রমণের তুলনায় ওমিক্রনের জন্য বেশি হতে পারে। দক্ষিণ আফ্রিকায়, COVID-19-এর প্রথম এবং দ্বিতীয় তরঙ্গের সময়, SARS-CoV-2-এর দশজনের মধ্যে একজনেরও কম নির্ণয় করা হয়েছিল৷ 16 আমরা আমাদের বিশ্লেষণে নির্ণয় করা এবং পূর্বে রিপোর্ট করা সংক্রমণের ব্যক্তিদের জন্য হিসাব করেছি৷ , কিন্তু, অনেক ক্ষেত্রে, এটা সম্ভব যে আগের সংক্রমণটি নির্ণয় করা যায়নি। যদি পুনঃসংক্রমণগুলি প্রাথমিক সংক্রমণের তুলনায় কম গুরুতর হয়, তবে এই সত্যটি, আংশিকভাবে, ওমিক্রন বৈকল্পিক দ্বারা সংক্রামিত ব্যক্তিদের মধ্যে পরিলক্ষিত রোগের তীব্রতা হ্রাসের জন্য দায়ী হতে পারে। 17 এটিও সম্ভব যে ওমিক্রন বৈকল্পিক অন্যান্য রূপের তুলনায় অভ্যন্তরীণ ভাইরুলেন্স হ্রাস করেছে। 18,19 উপলভ্য তথ্যের সাহায্যে, ওমিক্রন বনাম ডেল্টা বৈকল্পিকের পরিলক্ষিত নিম্ন রোগের তীব্রতার সাথে জনসংখ্যার অনাক্রম্যতা বনাম নিম্ন অভ্যন্তরীণ ভাইরুলেন্সের আপেক্ষিক অবদানগুলিকে বিচ্ছিন্ন করা সম্ভব নয়। অসম্পূর্ণ ভ্যাকসিনেশন ডেটা, এবং এই সত্য যে অনেক পূর্ববর্তী সংক্রমণ সম্ভবত সনাক্ত করা যায়নি, আমাদের বিশ্লেষণে পূর্বের অনাক্রম্যতার প্রভাবের জন্য অসম্পূর্ণ সমন্বয়ের ফলে।

cistanche propiedadesজন্যঅনাক্রম্যতা

এই গবেষণায় বিভিন্ন সীমাবদ্ধতা উপস্থিত রয়েছে। প্রথমত, SGTF সংক্রমণ শুধুমাত্র তখনই শনাক্ত করা যায় যখন TaqPath COVID-19 PCR পরীক্ষাটি উচ্চ ভাইরাল লোড (সাইকেল থ্রেশহোল্ড 30 এর কম বা সমান) সহ নমুনার জন্য ব্যবহার করা হয়েছিল; তাই, SGTF সংক্রমণের সংখ্যাকে অবমূল্যায়ন করা হয় এবং ভৌগলিক অঞ্চলের দিকে পক্ষপাতিত্ব করা হয় যেখানে TaqPath অ্যাসে বেশি ব্যবহৃত হয়। দ্বিতীয়ত, ওমিক্রন বৈকল্পিক সনাক্তকরণের জন্য SGTF একটি প্রক্সি হিসাবে ব্যবহৃত হয়েছিল। SGTF এছাড়াও আলফা বৈকল্পিক সনাক্ত করতে পারে এবং অন্যান্য ভেরিয়েন্টে বিক্ষিপ্তভাবে ঘটতে পারে, এবং তাই কিছু সংক্রমণ ওমিক্রন হিসাবে ভুল শ্রেণিবদ্ধ করা হতে পারে।

যাইহোক, আমরা 1 অক্টোবর, 2021-এর পরে শুধুমাত্র ওমিক্রনের জন্য প্রক্সি হিসাবে SGTF ব্যবহার করেছি এবং NGS-SA দ্বারা উত্পন্ন জিনোম ডেটা অগাস্ট 2021 সাল থেকে দক্ষিণ আফ্রিকায় আলফা ভেরিয়েন্টকে চিহ্নিত করেনি এবং, তার শীর্ষে, আলফা ভেরিয়েন্টটি শুধুমাত্র ছিল 2021 সালের মে মাসে 965টি নমুনার মধ্যে 58টি (6 শতাংশ) শনাক্ত করা হয়েছে।20 Omicron কে তিনটি সাবলাইনেজে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়েছে, যার একটিতে (BA.2) His{10}} Val70del নেই এবং তাই SGTF দ্বারা শনাক্ত করা যায় না। দক্ষিণ আফ্রিকায় নভেম্বর 2021 থেকে জিনোম ডেটা দেখায় যে, 881টি ওমিক্রন সিকোয়েন্সের মধ্যে 872টি (99 শতাংশ) ছিল BA.1, একটি (<1%) was="" ba.2,="" and="" eight="" (1%)="" were="" ba.3.20="" although="" genome="" data="" for="" non-sgtf="" infections="" were="" not="" available,="" of="" samples="" sequenced="" in="" south="" africa,="" 617="" (84·2%)="" of="" 733="" were="" delta="" and="" one="" (0·1%)="" of="" 733="" was="" omicron="" in="" october="" 2021,="" and="" 148="" (13·7%)="" of="" 1082="" were="" delta="" and="" 881="" (81·4%)="" of="" 1082="" were="" omicron="" in="" november="" 2021,="" suggesting="" that="" the="" majority="" of="" non-sgtf="" infections="" were="" delta.20="" third,="" our="" analysis="" was="" done="" during="" the="" early="" fourth="" wave,="" in="" which="" numbers="" of="" people="" with="" covid-19="" were="" small,="" patients="" with="" milder="" symptoms="" were="" more="" likely="" to="" be="" admitted="" to="" the="" hospital="" (compared="" with="" peak="" wave="" periods),="" and="" there="" could="" have="" been="" a="" lag="" in="" hospitalizations="" and="" severe="" disease="" outcomes="" caused="" by="" the="" omicron="" variant.="" we="" accounted="" for="" this="" limitation="" by="" only="" including="" hospitalized="" patients="" with="" known="" outcomes,="" censoring="" cases="" to="" ensure="" at="" least="" 3="" weeks="" of="" follow-up,="" and="" adjusting="" for="" the="" time="" interval="" between="" diagnosis="" and="" hospitalization="" in="" the="" severity="" models.="" the="" inclusion="" of="" individuals="" only="" with="" accumulated="" in-hospital="" outcomes="" could="" have="" biased="" individuals="" with="" sgtf="" infections="" towards="" shorter="" hospital="" stays;="" hence,="" this="" result="" should="" be="" interpreted="" with="" caution.="" fourth,="" we="" compared="" individuals="" with="" covid-19="" during="" the="" full="" delta="" wave="" to="" those="" with="" covid-19="" during="" the="" ascending="" phase="" of="" the="" omicron="" wave,="" which="" could="" have="" biased="" comparisons="" if="" case="" characteristics="" differ="" between="" ascending="" and="" descending="" wave="" phases="" or="" if="" the="" threshold="" for="" hospitalization="" changed="" in="" the="" different="" time="" periods.="" data="" from="" the="" datcov="" program="" suggest="" that="" the="" proportion="" of="" patients="" with="" severe="" covid-19="" does="" not="" vary="" substantially="" through="" the="" different="" wave="" phases.11="" finally,="" we="" only="" had="" information="" on="" vaccination="" status="" for="" hospitalized="" individuals="" with="" covid-19,="" which="" was="" also="" based="" on="">

ওমিক্রন বৈকল্পিকটি সম্প্রতি সনাক্ত হওয়া সত্ত্বেও, 2021 সালের নভেম্বরে দক্ষিণ আফ্রিকার সমস্ত প্রদেশে SGTF সংক্রমণের প্রকোপ দ্রুত বৃদ্ধি পেয়েছে, 4 সপ্তাহের মধ্যে ডেল্টা বৈকল্পিকটির প্রায় সম্পূর্ণ প্রতিস্থাপনের সাথে। আমাদের প্রাথমিক বিশ্লেষণগুলি 1 অক্টোবর থেকে 30 নভেম্বর, 2021-এর মধ্যে নির্ণয় করা নন-SGTF-সংক্রমিত ব্যক্তিদের তুলনায় SGTF-সংক্রমিত ব্যক্তিদের মধ্যে হাসপাতালে ভর্তির ঝুঁকি উল্লেখযোগ্যভাবে হ্রাস এবং ডেল্টা বৈকল্পিকের তুলনায় SGTF-সংক্রমিত ব্যক্তিদের মধ্যে গুরুতর রোগের ঝুঁকি হ্রাস নির্দেশ করে। সংক্রামিত ব্যক্তি। অমিক্রন ভেরিয়েন্টে আক্রান্ত ব্যক্তিদের অনাক্রম্যতা (আগের সংক্রমণ, টিকা বা উভয়ের কারণে) এই হ্রাস তীব্রতার জন্য আংশিকভাবে দায়ী হতে পারে। ওমিক্রন ভেরিয়েন্টের ক্ষেত্রে সম্ভাব্য হ্রাসকৃত অভ্যন্তরীণ ভাইরাসও কোভিড-19 এর তীব্রতা পরিলক্ষিত হ্রাসে অবদান রাখতে পারে। ভবিষ্যত অধ্যয়ন যেগুলি ভ্যাকসিন রেজিস্ট্রিগুলি থেকে ভ্যাকসিনেশন স্ট্যাটাস সম্পর্কিত ডেটা লিঙ্ক করে তা টিকা দেওয়ার পরে COVID{10} এর যুগান্তকারী ক্ষেত্রে রোগের তীব্রতার ক্ষয় সম্পর্কে তথ্য প্রদান করতে পারে। এই তথ্যগুলি প্রাথমিক এবং সাম্প্রতিক নির্ণয় করা SGTF- আক্রান্ত ব্যক্তিদের জন্য অতিরিক্ত ফলো-আপ সময়ের সাথে ফলাফলগুলি পরিবর্তিত হতে পারে।

cistanche সালসা সুবিধাজন্যঅনাক্রম্যতা

তথ্যসূত্র

1 Viana R, Moyo S, Amoako DG, et al. দক্ষিণ আফ্রিকায় SARS-CoV-2 ওমিক্রন বৈকল্পিকের দ্রুত মহামারী বিস্তার। প্রকৃতি 2022; 7 জানুয়ারী অনলাইনে প্রকাশিত।

2 জাতীয় সংক্রামক রোগের ইনস্টিটিউট। COVID-19 সাপ্তাহিক এপিডেমিওলজি ব্রিফ। দক্ষিন আফ্রিকা. সপ্তাহ 48 2021। 2021।

3 WHO. ওমিক্রনের শ্রেণীবিভাগ (B.1.1.529): উদ্বেগের SARS-CoV-2 রূপ। নভেম্বর 26, 2021।

4 Scheepers C, Everatt J, Amoako DG, et al. দক্ষিণ আফ্রিকায় SARS-CoV-2-এর ক্রমাগত বিবর্তন: উদ্বেগের মিউটেশনের দ্রুত সঞ্চয় এবং বিশ্বব্যাপী সনাক্তকরণের সাথে একটি নতুন বংশ। medRxiv 2021; 24 আগস্ট অনলাইনে প্রকাশিত।

5 জাতীয় সংক্রামক রোগের ইনস্টিটিউট। দক্ষিণ আফ্রিকায় SARS-CoV-2 ভেরিয়েন্টের (DATCOV-Gen) ক্লিনিকাল প্রভাব মূল্যায়ন করার জন্য একটি নজরদারি প্ল্যাটফর্ম প্রতিষ্ঠা করা। অক্টোবর 2021।

6 Scott L, Hsiao N, Moyo S, et al. আণবিক তথ্য দিয়ে omicron এর বিস্তার ট্র্যাক করুন। বিজ্ঞান 2021; 374: 1454-55।

7 কোহেন সি, ময়েস জে, টেম্পিয়া এস, এট আল। উচ্চ এইচআইভি প্রাদুর্ভাব সেটিং, দক্ষিণ আফ্রিকা, 2009-2011-এ গুরুতর ইনফ্লুয়েঞ্জা-সম্পর্কিত শ্বাসযন্ত্রের সংক্রমণ।

8 Jassat W, Cohen C, Tempia S, et al. দক্ষিণ আফ্রিকায় উচ্চ এইচআইভি এবং যক্ষ্মা প্রাদুর্ভাবের ক্ষেত্রে হাসপাতালের মধ্যে মৃত্যুর হার সম্পর্কিত COVID-19- ঝুঁকির কারণ: একটি সমন্বিত গবেষণা। ল্যানসেট এইচআইভি 2021; 8: e554–67।

9 জনস্বাস্থ্য ইংল্যান্ড। SARS-CoV-2 উপন্যাসের অনুসন্ধান। উদ্বেগের রূপ 202012/01। প্রযুক্তিগত ব্রিফিং 5. 2021।

10 জাতীয় সংক্রামক রোগের ইনস্টিটিউট। দক্ষিণ আফ্রিকায় COVID{1}} তরঙ্গের প্রস্তাবিত সংজ্ঞা। নভেম্বর 2021।

11 জাতীয় সংক্রামক রোগের ইনস্টিটিউট। সাপ্তাহিক হাসপাতাল নজরদারি (DATCOV) আপডেট। সপ্তাহ 48. 2021।

12 মাধী এসএ, কোয়াত্রা জি, মায়ার্স জেই, এবং অন্যান্য। দক্ষিণ আফ্রিকার জনসংখ্যার অনাক্রম্যতা এবং গুরুতর কোভিড-19 ওমিক্রন বৈকল্পিক সহ। medRxiv 2021; 21 ডিসেম্বর অনলাইনে প্রকাশিত।

13 জাতীয় স্বাস্থ্য বিভাগ। সর্বশেষ ভ্যাকসিন পরিসংখ্যান.

14 দক্ষিণ আফ্রিকান COVID-19 মডেলিং কনসোর্টিয়াম। COVID-19 মডেলিং আপডেট: সম্ভাব্য চতুর্থ তরঙ্গের জন্য বিবেচনা। 17 নভেম্বর, 2021।

15 পুলিয়াম জেআরসি, ভ্যান শাল্কউইক সি, গোভেন্ডার এন, এট আল। SARS-CoV-2 পুনঃসংক্রমণের ঝুঁকি বেড়েছে দক্ষিণ আফ্রিকায় ওমিক্রন বৈকল্পিকের উত্থানের সাথে। medRxiv 2021; 2 ডিসেম্বর অনলাইনে প্রকাশিত।

16 Kleynhans J, Tempia S, Wolter N, et al. SARS-CoV-2 সংক্রমণের প্রথম এবং দ্বিতীয় তরঙ্গের সময় একটি গ্রামীণ এবং শহুরে পরিবারের সমষ্টিতে সেরোপ্যাভিলেন্স, দক্ষিণ আফ্রিকা, জুলাই 2020-মার্চ 2021। ইমার্জ ইনফেক্ট ডিস 2021; 27: 3020–29।

17 আবু-রাদ্দাদ এলজে, চেমাইটেলি এইচ, বার্টোলিনি আর। প্রাথমিক সংক্রমণের তুলনায় SARS-CoV-2 পুনরায় সংক্রমণের তীব্রতা। N Engl J Med 2021; 385: 2487–89।

18 মেং বি, ফেরেরা আইএটিএম, আবদুল্লাহি এ, এবং অন্যান্য। SARS-CoV-2 omicron স্পাইক মধ্যস্থতা করে ইমিউন এস্কেপ, ইনফেকটিভিটি, এবং সেল-সেল ফিউশন। bioRxiv 2021; 22 ডিসেম্বর অনলাইনে প্রকাশিত।

19 HKUMed. HKUMed আবিষ্কার করেছে omicron SARS-CoV-2 মানুষের ব্রঙ্কাসে ডেল্টার চেয়ে দ্রুত এবং ভালোভাবে সংক্রমিত করতে পারে কিন্তু ফুসফুসে কম গুরুতর সংক্রমণের সাথে। 15 ডিসেম্বর, 2021।

20 জাতীয় সংক্রামক রোগের ইনস্টিটিউট। দক্ষিণ আফ্রিকায় জিনোমিক্স নজরদারির জন্য নেটওয়ার্ক। SARS-CoV-2 জিনোমিক নজরদারি আপডেট। 17 ডিসেম্বর, 2021।