নেটওয়ার্ক ফার্মাকোলজি অ্যান্ড মলিকুলার ডকিং স্টাডি টু ইনকভার মেকানিজমCistanche tubulosaদীর্ঘস্থায়ী ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিসের বিরুদ্ধে নির্যাস (CP/CPPS)

 

বিমূর্ত

উদ্দেশ্য: এই গবেষণা পদ্ধতিগতভাবে সম্ভাব্য জৈব সক্রিয় যৌগ, মূল লক্ষ্য প্রোটিন এবং আণবিক প্রক্রিয়ার পূর্বাভাস দেয়Cistanche tubulosaনেটওয়ার্ক ফার্মাকোলজি এবং আণবিক ডকিং সিমুলেশনের মাধ্যমে দীর্ঘস্থায়ী ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিসের বিরুদ্ধে।পদ্ধতি: সক্রিয় উপাদান এবং সংশ্লিষ্ট লক্ষ্যমাত্রাCistanche tubulosaTCMSP, PubChem, SwissTargetPrediction এবং অন্যান্য পাবলিক ডাটাবেস ব্যবহার করে স্ক্রীন করা হয়েছিল। দীর্ঘস্থায়ী ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিসের জন্য রোগ-সম্পর্কিত লক্ষ্যগুলি জিনকার্ড এবং ওএমআইএম ডাটাবেস থেকে পুনরুদ্ধার করা হয়েছিল। প্রোটিন-প্রোটিন ইন্টারঅ্যাকশন (PPI) নেটওয়ার্ক নির্মাণের জন্য ভেষজ এবং রোগের ছেদ লক্ষ্যগুলি STRING প্ল্যাটফর্মে আমদানি করা হয়েছিল। DAVID ডাটাবেসটি জিন অন্টোলজি (GO) কার্যকরী সমৃদ্ধকরণ এবং জিন এবং জিনোমের কিয়োটো এনসাইক্লোপিডিয়া (KEGG) পথ সমৃদ্ধকরণ বিশ্লেষণের জন্য গৃহীত হয়েছিল। সাইটোস্কেপ সফ্টওয়্যারটি একটি "হার্ব-যৌগ-টার্গেট-পাথওয়ে-ডিজিজ" নেটওয়ার্ক তৈরি করতে ব্যবহার করা হয়েছিল মূল লক্ষ্য এবং মূল সংকেত পথের স্ক্রীনিং করার জন্য। অটোডক ভিনা এবং পাইএমওএল প্রতিনিধি বায়োঅ্যাকটিভ যৌগ এবং হাব লক্ষ্যগুলির মধ্যে আণবিক ডকিং বৈধতা সম্পাদন করতে ব্যবহার করা হয়েছিল।ফলাফল: থেকে মোট 24 সম্ভাব্য বায়োঅ্যাকটিভ যৌগCistanche tubulosaচিহ্নিত করা হয়েছিল, এবং দীর্ঘস্থায়ী ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিসের বিরুদ্ধে এর হস্তক্ষেপের সাথে যুক্ত 45টি ওভারল্যাপিং লক্ষ্যগুলি প্রাপ্ত হয়েছিল। PPI নেটওয়ার্ক বিশ্লেষণে দেখা গেছে যে TNF, Akt1, EGFR, STAT3 এবং MAPK1 মূল হাব লক্ষ্য হিসাবে কাজ করে। GO এবং KEGG সমৃদ্ধকরণের ফলাফল নির্দেশ করে যে এর থেরাপিউটিক প্রভাবCistanche tubulosaPI3K সিগন্যালিং এর ইতিবাচক নিয়ন্ত্রণ, অ্যাপোপটোসিসের নেতিবাচক নিয়ন্ত্রণ এবং লিপোপলিস্যাকারাইডের সেলুলার প্রতিক্রিয়া সহ জৈবিক প্রক্রিয়াগুলির সাথে প্রধানত যুক্ত। মূল সমৃদ্ধ সিগন্যালিং পাথওয়েগুলি HIF-1 পথ, ডায়াবেটিক জটিলতায় AGE-RAGE সিগন্যালিং পাথওয়ে এবং প্রোস্টেট ক্যান্সার-সম্পর্কিত পথগুলিকে কভার করে৷ আণবিক ডকিং ফলাফলগুলি দেখিয়েছে যে ইচিনাকোসাইড, অ্যাক্টিওসাইড এবং সিস্টানোসাইড A অ্যাক্ট1, ইজিএফআর এবং টিএনএফ-এর সাথে ইন্টারঅ্যাক্ট করার সময় −6.0 kcal/mol-এর চেয়ে কম বাঁধাই শক্তি প্রদর্শন করে, যা দৃঢ় বাইন্ডিং সম্বন্ধ নিশ্চিত করে।উপসংহার: Cistanche tubulosaইচিনাকোসাইড, অ্যাক্টিওসাইড এবং সিস্টানোসাইড এ সহ বায়োঅ্যাকটিভ উপাদানগুলির মাধ্যমে প্রধানত দীর্ঘস্থায়ী ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিসের বিরুদ্ধে প্রতিরক্ষামূলক প্রভাব প্রয়োগ করে। এই যৌগগুলি হাব প্রোটিন যেমন TNF, Akt1, EGFR এবং STAT3 মডিউল করে এবং HIF-1, AGE-RAGE এবং অন্যান্য সংকেতগুলিকে সমন্বিতভাবে নিয়ন্ত্রণ করে। অ্যান্টি-ইনফ্ল্যামেটরি, ইমিউনোমোডুলেটরি এবং অ্যান্টি-অ্যাপোপ্টোটিক প্রভাব প্রদান করে, এই যৌগগুলি যৌথভাবে দীর্ঘস্থায়ী ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিসের প্যাথলজিকাল অগ্রগতিকে দমন করে।

কীওয়ার্ড: Cistanche tubulosa; দীর্ঘস্থায়ী ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিস; নেটওয়ার্ক ফার্মাকোলজি; আণবিক ডকিং; কর্মের প্রক্রিয়া; echinacoside; অ্যাক্টিওসাইড; phenylethanoid glycosides

ভূমিকা

দীর্ঘস্থায়ী ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিস, যাকে ক্লিনিকভাবে ক্রনিক প্রোস্টাটাইটিস/ক্রনিক পেলভিক পেইন সিনড্রোম (CP/CPPS) হিসাবে শ্রেণীবদ্ধ করা হয়, এটি পুরুষদের প্রভাবিত করে সবচেয়ে প্রচলিত প্রস্রাবের ব্যাধিগুলির মধ্যে একটি, যা সমস্ত প্রোস্টাটাইটিসের প্রায় 90% ক্ষেত্রেই দায়ী। সাধারণ লক্ষণগুলির মধ্যে রয়েছে ক্রমাগত পেরিনিয়াল অস্বস্তি, পেলভিক ব্যথা এবং প্রস্রাবের কর্মহীনতা, যা রোগীদের জীবনযাত্রার মান এবং মানসিক সুস্থতাকে মারাত্মকভাবে ক্ষতিগ্রস্ত করে। ট্র্যাডিশনাল চাইনিজ মেডিসিনে (TCM), এই অবস্থাটি "Essence Turbidity" এবং "Sperm Leakage" এর ডায়াগনস্টিক বিভাগের অধীনে পড়ে। এর প্যাথোজেনেসিস সাধারণত কিডনি এসেন্সের ঘাটতি, স্যাঁতসেঁতে-তাপ জমা এবং রক্তের স্থবিরতার জন্য দায়ী করা হয়।

প্রচলিত পশ্চিমা চিকিত্সা প্রধানত আলফা-ব্লকার এবং ননস্টেরয়েডাল অ্যান্টি-ইনফ্লেমেটরি ওষুধের উপর নির্ভর করে উপসর্গগুলি উপশম করতে। যাইহোক, এই পন্থাগুলি ড্রাগ প্রতিরোধ, লক্ষণীয় পার্শ্ব প্রতিক্রিয়া এবং উচ্চ পুনরাবৃত্তি হার, লক্ষ্যযুক্ত এবং স্থিতিশীল থেরাপিউটিক পদ্ধতির অভাব দ্বারা সীমাবদ্ধ। গুরুত্বপূর্ণভাবে, ক্লিনিকাল এবং মহামারী সংক্রান্ত প্রমাণগুলি নিশ্চিত করে যে প্রোস্টেট টিস্যুর মধ্যে দীর্ঘস্থায়ী প্রদাহ প্রোস্টেট ক্যান্সারের অগ্রগতির মূল চালক হিসাবে কাজ করে। প্রদাহজনক মাইক্রোএনভায়রনমেন্ট অক্সিডেটিভ স্ট্রেসকে ট্রিগার করে, কোষের বিস্তারকে ত্বরান্বিত করে এবং স্বাভাবিক অ্যাপোপটোসিসকে বাধা দেয়, প্রোস্টেট এপিথেলিয়াল কোষের ম্যালিগন্যান্ট রূপান্তর প্রচার করে। অতএব, দীর্ঘস্থায়ী ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিসের জন্য কার্যকর প্রাথমিক হস্তক্ষেপ শুধুমাত্র অস্বস্তিকর উপসর্গগুলিকে উপশম করে না বরং প্রোস্টেট ক্যান্সারের বিকাশের ঝুঁকি কমাতেও সাহায্য করে।

Cistanche tubulosa, সাধারণত মরুভূমি জিনসেং নামে পরিচিত, এর শুকনো মাংসল কান্ডCistanche tubulosa, Orobanchaceae পরিবারের একটি holoparasitic উদ্ভিদ। টিসিএম তত্ত্ব অনুসারে, এটি উষ্ণ বৈশিষ্ট্য সহ মিষ্টি এবং নোনতা স্বাদ বহন করে, যা প্রাথমিকভাবে কিডনি এবং বৃহৎ অন্ত্রের মেরিডিয়ানগুলিতে কাজ করে। এটি কিডনি ইয়াংকে টোনিফাই করে, সারাংশ এবং রক্তকে পুনরায় পূরণ করে এবং পুরুষ প্রজনন ও মূত্রের স্বাস্থ্যকে সমর্থন করার জন্য সহস্রাব্দ ধরে মূল্যবান হয়ে আসছে।

মূল সুবিধা: বাণিজ্যিকভাবে উপলব্ধ মধ্যেসিস্তানচেজাত, নির্যাস থেকে প্রাপ্তCistanche tubulosaস্বাভাবিকভাবেই এর তুলনায় ফেনাইলেথানয়েড গ্লাইকোসাইডের (ইচিনাকোসাইড, অ্যাক্টিওসাইড) উল্লেখযোগ্যভাবে বেশি ঘনত্ব থাকেCistanche deserticola, শক্তিশালী ফার্মাকোলজিকাল কার্যকলাপ প্রদান. আমাদের কারখানা প্রমিত বিশেষCistanche tubulosaকাঁচামালের নির্যাস।

 

আরো বিস্তারিত পেতে ছবিতে ক্লিক করুন

 

Wecistanche-এর সহায়ক পরিষেবা- সহযোগিতার বিষয়ে আরও বিশদ বিবরণের জন্য
ইমেল:wallence.suen@wecistanche.com

 

আধুনিক ফার্মাকোলজিক্যাল গবেষণা তা যাচাই করেছেCistanche tubulosaফেনাইলেথানয়েড গ্লাইকোসাইডস, পলিস্যাকারাইডস, ইরিডয়েডস এবং লিগনানে প্রচুর পরিমাণে রয়েছে। এই যৌগগুলি অ্যান্টি-ইনফ্ল্যামেটরি, অ্যান্টিঅক্সিডেন্ট, ইমিউনোরেগুলেটরি এবং অ্যান্টি-অ্যাপোপ্টোটিক বায়োঅ্যাক্টিভিটিগুলি প্রয়োগ করে। কিডনির সারাংশকে টোনিফাই করার মূল TCM কার্যটি কিডনির ঘাটতি এবং CP/CPPS রোগীদের মধ্যে পরিলক্ষিত দীর্ঘস্থায়ী পেলভিক প্রদাহের মূল প্যাথোজেনেসিসের সাথে পুরোপুরি মেলে, প্রোস্টেট স্বাস্থ্য সহায়তার জন্য এর দুর্দান্ত থেরাপিউটিক সম্ভাবনাকে তুলে ধরে।

ঐতিহ্যবাহী চীনা ভেষজ ওষুধ একটি বৈশিষ্ট্যযুক্ত মাল্টি-কম্পাউন্ড, মাল্টি-টার্গেট এবং মাল্টি-পাথওয়ে মোডের মাধ্যমে কাজ করে। এই অধ্যয়নটি নেটওয়ার্ক ফার্মাকোলজি এবং আণবিক ডকিংকে একীভূত করে পদ্ধতিগতভাবে বায়োঅ্যাকটিভ যৌগ এবং মূল আণবিক লক্ষ্যগুলিকে স্ক্রীন করতেCistanche tubulosa. আমরা ইন্টারেক্টিভ জৈবিক নেটওয়ার্ক তৈরি করি এবং পথ সমৃদ্ধকরণ বিশ্লেষণ পরিচালনা করি। আণবিক ডকিং স্বাক্ষর যৌগ এবং মূল প্রোটিন লক্ষ্যগুলির মধ্যে সরাসরি বাঁধাই ক্ষমতা যাচাই করে। এই গবেষণার লক্ষ্য আণবিক প্রক্রিয়া যা দ্বারা স্পষ্ট করাCistanche tubulosaদীর্ঘস্থায়ী ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিস থেকে মুক্তি দেয়। এটি ক্লিনিকাল অ্যাপ্লিকেশন গাইড করার জন্য বৈজ্ঞানিক প্রমাণ সরবরাহ করে এবং প্রোস্টেট সুস্থতা লক্ষ্য করে নতুন খাদ্যতালিকাগত সম্পূরক এবং ভেষজ ওষুধের বিকাশকে সমর্থন করে।

1 উপাদান এবং পদ্ধতি

1.1 বায়োঅ্যাকটিভ যৌগগুলির স্ক্রীনিং এবং এর সংশ্লিষ্ট লক্ষ্যগুলিCistanche tubulosa

আমরা প্রার্থী বায়োঅ্যাকটিভ যৌগগুলি সনাক্ত করতে কীওয়ার্ড হিসাবে "Cistanche tubulosa" ব্যবহার করে TCMSP ডাটাবেস অনুসন্ধান করেছি। স্ক্রীনিং থ্রেশহোল্ডগুলিকে মৌখিক জৈব উপলভ্যতা (OB) 30% এর চেয়ে বেশি বা সমান এবং ড্রাগ-লাইকনেস (DL) 0.18 এর চেয়ে বেশি বা সমান হিসাবে অনুকূল শোষণ এবং ওষুধ গ্রহণযোগ্যতার সাথে যৌগ ধরে রাখার জন্য সেট করা হয়েছিল। প্রতিটি প্রার্থী যৌগের রাসায়নিক গঠন এবং ক্যানোনিকাল স্মাইলস স্ট্রিংগুলি PubChem থেকে পুনরুদ্ধার করা হয়েছিল।

সমস্ত SMILE ডেটা SwissADME প্ল্যাটফর্মে আমদানি করা হয়েছিল৷ শুধুমাত্র গ্যাস্ট্রোইনটেস্টাইনাল শোষণের জন্য "উচ্চ" গ্রেড করা যৌগগুলি এবং কমপক্ষে দুটি ওষুধ-সদৃশ মানদণ্ডকে CP/CPPS হস্তক্ষেপের জন্য মূল জৈব সক্রিয় উপাদান হিসাবে ধরে রাখা হয়েছিল। যোগ্য যৌগগুলির সম্ভাব্য প্রোটিন লক্ষ্যগুলি ক্যানোনিকাল স্মাইলস তথ্যের উপর ভিত্তি করে সুইস টার্গেট প্রেডিকশন ডাটাবেস ব্যবহার করে পূর্বাভাস দেওয়া হয়েছিল।

1.2 ক্রনিক ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিসের জন্য রোগের লক্ষ্যমাত্রার সংগ্রহ

আমরা GeneCards এবং OMIM ডাটাবেস থেকে রোগ-সম্পর্কিত লক্ষ্যগুলি পুনরুদ্ধার করতে "ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিস" শব্দটি ব্যবহার করেছি। দীর্ঘস্থায়ী ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিসের জন্য একটি ইউনিফাইড টার্গেট ডেটাসেট স্থাপন করতে ডুপ্লিকেট এন্ট্রিগুলি সরানো হয়েছিল।

1.3 ওভারল্যাপিং হার্ব-রোগের লক্ষ্যমাত্রা সনাক্তকরণ

এর টার্গেট ডেটাসেটCistanche tubulosaবায়োঅ্যাকটিভ যৌগ এবং দীর্ঘস্থায়ী ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিস ম্যাপ করা হয়েছিল এবং তুলনা করা হয়েছিল। Venny 2.1.0 অনলাইন টুল ভেন ডায়াগ্রাম এবং স্ক্রিন ওভারল্যাপিং লক্ষ্যগুলি তৈরি করতে ব্যবহৃত হয়েছিল, যা সম্ভাব্য থেরাপিউটিক লক্ষ্যগুলিকে প্রতিনিধিত্ব করেCistanche tubulosaCP/CPPS এর বিরুদ্ধে।

1.4 প্রোটিন-প্রোটিন ইন্টারঅ্যাকশন (PPI) নেটওয়ার্ক নির্মাণ

ওভারল্যাপিং লক্ষ্যগুলি STRING ডাটাবেসে আপলোড করা হয়েছে৷ জীব হিসাবে সেট করা হয়েছিলহোমো সেপিয়েন্স, কনফিডেন্স থ্রেশহোল্ড=0.400, অন্যান্য সমস্ত প্যারামিটার ডিফল্ট রাখা হয়েছে। ফলস্বরূপ পিপিআই নেটওয়ার্ক পরবর্তী ভিজ্যুয়ালাইজেশন এবং টপোলজিকাল বিশ্লেষণের জন্য রপ্তানি করা হয়েছিল।

1.5 GO ফাংশন এবং KEGG পাথওয়ে সমৃদ্ধকরণ বিশ্লেষণ

DAVID ডাটাবেস জৈবিক ফাংশন এবং ওভারল্যাপিং লক্ষ্যগুলি দ্বারা সমৃদ্ধ সিগন্যালিং পাথওয়ে ব্যাখ্যা করতে প্রয়োগ করা হয়েছিল। প্রজাতি হিসাবে সেট করা হয়েছিলহোমো সেপিয়েন্স, তাৎপর্য থ্রেশহোল্ড P <0.05 সহ। সেরা 10টি সমৃদ্ধ GO শর্তাবলী এবং শীর্ষ 20টি KEGG পথ বেছে নেওয়া হয়েছে৷ বায়োইনফরমেটিক্স অনলাইন প্ল্যাটফর্মটি বার চার্ট এবং বুদবুদ প্লটের মাধ্যমে ফলাফলগুলি কল্পনা করতে ব্যবহৃত হয়েছিল।

1.6 "হার্ব-যৌগ-লক্ষ্য-পথ-রোগ" নেটওয়ার্কের নির্মাণ

একটি মাল্টি-লেয়ার নেটওয়ার্ক তৈরি করতে সাইটোস্কেপ 3.10.0-এ সমস্ত প্রমিত লক্ষ্য ডেটা আমদানি করা হয়েছিল। নোড শ্রেণীতে ভেষজ অন্তর্ভুক্ত রয়েছে (Cistanche tubulosa), বায়োঅ্যাকটিভ যৌগ, টার্গেট প্রোটিন, সিগন্যালিং পাথওয়ে এবং রোগ (ক্রনিক ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিস)। হাব যৌগ এবং মূল লক্ষ্যগুলি সনাক্ত করতে টপোলজিকাল পরামিতিগুলি গণনা করা হয়েছিল। নোডগুলি বিভাগ দ্বারা রঙ্গিন ছিল, এবং নেটওয়ার্ক বিন্যাস স্বজ্ঞাতভাবে ইন্টারেক্টিভ সম্পর্কগুলি প্রদর্শন করার জন্য অপ্টিমাইজ করা হয়েছিল।

1.7 আণবিক ডকিং বৈধতা

নেটওয়ার্ক ফার্মাকোলজি থেকে ভবিষ্যদ্বাণী যাচাই করার জন্য, আমরা পিপিআই নেটওয়ার্ক থেকে শীর্ষ 5টি হাব লক্ষ্য নির্বাচন করেছি (ডিগ্রি মান অনুসারে) এবং শীর্ষ 3টি বায়োঅ্যাকটিভ যৌগCistanche tubulosaআণবিক ডকিংয়ের জন্য। লক্ষ্য প্রোটিনের ত্রি-মাত্রিক স্ফটিক কাঠামো RCSB PDB ডাটাবেস থেকে ডাউনলোড করা হয়েছিল। PyMOL সফ্টওয়্যারটি প্রিপ্রসেসিংয়ের জন্য ব্যবহার করা হয়েছিল: জলের অণু এবং সহ-ক্রিস্টালাইজড নেটিভ লিগ্যান্ডগুলি অপসারণ করা। বায়োঅ্যাকটিভ যৌগগুলির আণবিক কাঠামো PubChem থেকে ডাউনলোড করা হয়েছিল এবং SDF ফর্ম্যাটে রূপান্তরিত হয়েছিল।

অটোডক ভিনা ডিফল্ট প্যারামিটার সহ আণবিক ডকিংয়ের জন্য গৃহীত হয়েছিল। লিগ্যান্ড-রিসেপ্টর মিথস্ক্রিয়া শক্তি মূল্যায়ন করতে বাইন্ডিং অ্যাফিনিটি ব্যবহার করা হয়েছিল; বাইন্ডিং এনার্জি −5.0 kcal/mol এর কম বা সমানকে কার্যকর বাইন্ডিং হিসাবে সংজ্ঞায়িত করা হয়েছিল। PyMOL ডকিং ভঙ্গি এবং আন্তঃআণবিক মিথস্ক্রিয়া কল্পনা করতে ব্যবহৃত হয়েছিল।

2 ফলাফল

2.1 বায়োঅ্যাকটিভ যৌগ এবং এর লক্ষ্যগুলির স্ক্রীনিংCistanche tubulosa

TCMSP থেকে মোট 24টি বায়োঅ্যাকটিভ যৌগ স্ক্রীন করা হয়েছিল, প্রধানত ফেনিলেথানয়েড গ্লাইকোসাইডস, পলিস্যাকারাইডস, ইরিডয়েডস এবং লিগনান। SwissTargetPrediction এবং ডিডপ্লিকেশনের মাধ্যমে লক্ষ্য ভবিষ্যদ্বাণী করার পরে, এই যৌগগুলির সাথে যুক্ত 604 সম্ভাব্য প্রোটিন লক্ষ্য সংগ্রহ করা হয়েছিল।

2.2 দীর্ঘস্থায়ী ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিসের জন্য রোগের লক্ষ্যমাত্রার স্ক্রীনিং

GeneCards এবং OMIM থেকে ডেটা মার্জ এবং ডিডুপ্লিকেট করার পরে, দীর্ঘস্থায়ী ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিসের জন্য 553 টি রোগ-সম্পর্কিত লক্ষ্যগুলি প্রাপ্ত হয়েছিল। টার্গেট ম্যাপিং 45টি ওভারল্যাপিং ভেষজ-রোগের লক্ষ্য তৈরি করেছে, একটি ভেন ডায়াগ্রামে কল্পনা করা হয়েছে।

2.3 PPI নেটওয়ার্কের নির্মাণ এবং বিশ্লেষণ

45টি ওভারল্যাপিং লক্ষ্যগুলিকে STRING-এ আমদানি করা হয়েছে, একটি PPI নেটওয়ার্ক গঠন করেছে যার মধ্যে 42টি নোড এবং 658টি প্রান্ত রয়েছে, যা সাইটোস্কেপে ভিজ্যুয়ালাইজ করা হয়েছে। সর্বোচ্চ ডিগ্রী মান সহ হাবের লক্ষ্যগুলির মধ্যে রয়েছে TNF, Akt1, Bcl-2, EGFR এবং PTGS2। উচ্চ সংযোগ সহ অন্যান্য মূল নোডগুলি হল STAT3, mTOR, MAPK3, PPARG এবং GSK3B। এই প্রোটিনগুলির প্রতিরক্ষামূলক প্রভাবগুলির জন্য মূল নিয়ন্ত্রক নোড হিসাবে কাজ করার জন্য অনুমান করা হয়Cistanche tubulosaCP/CPPS এর বিরুদ্ধে।

2.4 মূল লক্ষ্যগুলির GO এবং KEGG সমৃদ্ধকরণ বিশ্লেষণ

GO সমৃদ্ধকরণ বিশ্লেষণে 350টি জৈবিক প্রক্রিয়া (BP) এন্ট্রি, 56টি সেলুলার কম্পোনেন্ট (CC) এন্ট্রি এবং 59টি মলিকুলার ফাংশন (MF) এন্ট্রি চিহ্নিত করা হয়েছে। শীর্ষ জৈবিক প্রক্রিয়াগুলির মধ্যে রয়েছে PI3K সংকেতের ইতিবাচক নিয়ন্ত্রণ, অ্যাপোপটোটিক প্রক্রিয়ার নেতিবাচক নিয়ন্ত্রণ এবং লিপোপলিস্যাকারাইডের সেলুলার প্রতিক্রিয়া। প্রধান সেলুলার উপাদানগুলি সাইটোসল, সাইটোপ্লাজম, অ্যাক্সন এবং প্রারম্ভিক এন্ডোসোমগুলিকে আচ্ছাদিত করে; প্রভাবশালী আণবিক ফাংশন প্রোটিন kinase কার্যকলাপ এবং serine/threonine kinase কার্যকলাপ রয়েছে.

কেইজিজি পাথওয়ে সমৃদ্ধকরণ 142টি উল্লেখযোগ্যভাবে সমৃদ্ধ পথ (P <0.05) দিয়েছে। বুদ্বুদ প্লট ভিজ্যুয়ালাইজেশনের জন্য শীর্ষ 20টি পথ বেছে নেওয়া হয়েছিল, যার মধ্যে রয়েছে HIF-1 সিগন্যালিং পাথওয়ে, AGE-RAGE সিগন্যালিং পাথওয়ে, প্রোস্টেট ক্যান্সার পাথওয়ে, PD-L1 এক্সপ্রেশন এবং PD-1 ক্যান্সারে চেকপয়েন্ট পাথওয়ে, এবং সি-টাইপ লেকটিন রিসেপ্টর সিগন্যালিং পাথওয়ে। এই পথগুলি প্রদাহ, ইমিউন ভারসাম্য, কোষের বিস্তার এবং অ্যাপোপটোসিসে ব্যাপকভাবে অংশগ্রহণ করে, যা নিশ্চিত করেCistanche tubulosaমাল্টি-পাথওয়ে সমন্বয়ের মাধ্যমে CP/CPPS প্যাথলজি নিয়ন্ত্রণ করে।

2.5 "ভেষজ-যৌগ-লক্ষ্য-পথ-রোগ" নেটওয়ার্ক বিশ্লেষণ

শীর্ষ 10 সমৃদ্ধ কেইজিজি পথ, সংশ্লিষ্ট লক্ষ্য এবং সংশ্লিষ্ট বায়োঅ্যাকটিভ যৌগগুলি সাইটোস্কেপে আমদানি করা হয়েছিল। সর্বোচ্চ ডিগ্রী মান সহ যৌগগুলি ছিল ইচিনাকোসাইড, অ্যাক্টিওসাইড এবং সিস্টানোসাইড এ, প্রাথমিক সক্রিয় উপাদান হিসাবে স্বীকৃতCistanche tubulosa. মূল লক্ষ্যগুলির মধ্যে রয়েছে mTOR, MAPK1, MAPK3, EGFR, Akt1 এবং STAT3। প্রস্টেট ক্যান্সার পাথওয়ে, HIF-1 সিগন্যালিং পাথওয়ে, AGE-RAGE সিগন্যালিং পাথওয়ে এবং PI3K/Akt সম্পর্কিত সিগন্যালিং ছিল উচ্চভাবে সংযুক্ত পথ।

নেটওয়ার্ক প্রদর্শিত যে একটি একক যৌগCistanche tubulosaঅ্যান্টি-ইনফ্ল্যামেটরি, ইমিউনোমডুলেটরি এবং অ্যান্টি-অ্যাপোপ্টোটিক সুবিধা প্রদানের জন্য HIF-1, AGE-RAGE এবং PI3K/Akt ক্যাসকেডগুলি মডিউল করতে একাধিক লক্ষ্যকে আবদ্ধ করতে পারে। এদিকে, বিভিন্ন যৌগ একই সাথে একাধিক নোডের উপর কাজ করতে পারে সিনারজিস্টিক কার্যকারিতা অর্জনের জন্য। এটি দৃঢ়ভাবে মাল্টি-কম্পোনেন্ট, মাল্টি-টার্গেট, মাল্টি-পাথওয়ে রেগুলেটরি বৈশিষ্ট্যকে সমর্থন করেCistanche tubulosa.

2.6 আণবিক ডকিং ফলাফল

মূল যৌগ এবং হাব লক্ষ্যগুলির মধ্যে ডকিং সিমুলেশন নির্ভরযোগ্য বাঁধাই কার্যকলাপ নিশ্চিত করেছে: ইচিনাকোসাইড −9.4 kcal/mol (Akt1) এবং −8.8 kcal/mol (EGFR) এর বাঁধাই শক্তি দেখিয়েছে; অ্যাক্টিওসাইড −9.6 kcal/mol (Akt1) এবং −8.8 kcal/mol (EGFR) এর বাঁধন শক্তি অর্জন করেছে; Cistanoside A −9.2 kcal/mol (Akt1) এবং −8.3 kcal/mol (EGFR) পৌঁছেছে। সমস্ত বাঁধাই শক্তি −6.0 kcal/mol এর নিচে ছিল, যা জৈব সক্রিয় যৌগ এবং লক্ষ্য প্রোটিনের মধ্যে স্থিতিশীল বাঁধাই মিথস্ক্রিয়া নির্দেশ করে।

3 আলোচনা

ক্রনিক ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিস (CP/CPPS) হল একটি অবাধ্য পুরুষ মূত্রনালীর ব্যাধি। ক্রমাগত দীর্ঘস্থায়ী প্রদাহজনক মাইক্রোএনভায়রনমেন্ট শুধুমাত্র রোগীদের জীবনযাত্রার মান কমায় না, বরং প্রোস্টেট ক্যান্সারের অগ্রগতির দীর্ঘমেয়াদী ঝুঁকিও বাড়ায়। TCM দৃষ্টিকোণ থেকে, এর প্যাথলজি কিডনি এসেন্সের ঘাটতির সাথে মিলিত স্যাঁতসেঁতে-তাপ স্থবিরতা থেকে উদ্ভূত হয়, যা ঐতিহ্যগত প্রয়োগের সাথে পুরোপুরি সারিবদ্ধ।Cistanche tubulosaএকটি কিডনি-টোনিফাইং নির্যাস ভেষজ হিসাবে. সমসাময়িক ফার্মাকোলজিকাল প্রমাণ এটি নিশ্চিত করেCistanche tubulosaমাল্টি-কম্পাউন্ড সিনারজিজমের মাধ্যমে প্রদাহজনক সংকেত নেটওয়ার্কগুলিকে সংশোধন করে, প্রদাহজনক মাইক্রোএনভায়রনমেন্টের ভারসাম্য বজায় রাখে এবং CP/CPPS অগ্রগতি ধীর করে।

এই গবেষণায় জৈব সক্রিয় যৌগ, মূল লক্ষ্য এবং সিগন্যালিং পাথওয়ের প্রতিরক্ষামূলক প্রভাবগুলির জন্য দায়ী পদ্ধতিগতভাবে বিচ্ছিন্ন করার জন্য আণবিক ডকিংয়ের সাথে মিলিত নেটওয়ার্ক ফার্মাকোলজি গ্রহণ করা হয়েছে।Cistanche tubulosaদীর্ঘস্থায়ী ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিসের বিরুদ্ধে।

24টি চিহ্নিত বায়োঅ্যাকটিভ যৌগগুলির মধ্যে, ইচিনাকোসাইড এবং অ্যাক্টিওসাইড (প্রাথমিক ফেনিলেথানয়েড গ্লাইকোসাইড) নেটওয়ার্কের মধ্যে সর্বাধিক সংযোগ প্রদর্শন করে। একাধিক গবেষণায় ফেনাইলেথানয়েড গ্লাইকোসাইডের অ্যান্টি-ইনফ্ল্যামেটরি ক্ষমতা যাচাই করা হয়েছে, প্রো-ইনফ্ল্যামেটরি ফ্যাক্টর রিলিজকে দমন করতে এবং প্রোস্টেট টিস্যুর মধ্যে প্রদাহজনক অনুপ্রবেশ দূর করতে সক্ষম। ইচিনাকোসাইড টিএনএফ- , IL-6 এবং অন্যান্য প্রো-ইনফ্ল্যামেটরি সাইটোকাইনগুলিকে হ্রাস করতে NF-κB ক্যাসকেডগুলিকে বাধা দেয়। অ্যাক্টিওসাইড প্রদাহজনক প্রতিক্রিয়া দমন করতে এবং সেলুলার অ্যাপোপটোসিসকে সংশোধন করতে PI3K/Akt পথকে নিয়ন্ত্রণ করে। স্বাক্ষর যৌগ হিসাবেCistanche tubulosa, ফেনাইলেথানয়েড গ্লাইকোসাইডগুলি সিপি/সিপিপিএস রোগীদের মধ্যে বিশৃঙ্খল প্রদাহজনক মাইক্রোএনভায়রনমেন্টকে পুনর্নির্মাণের জন্য পলিস্যাকারাইড এবং ইরিডয়েডের সাথে সমন্বয়মূলকভাবে কাজ করে।

বাণিজ্যিক নোট: Cistanche tubulosaঅন্যান্য সিস্টানচে প্রজাতির তুলনায় অনেক বেশি ফেনাইলেথানয়েড গ্লাইকোসাইড ঘনত্ব রয়েছে, যা এই জাতের নির্যাসগুলিকে প্রোস্টেট-সাপোর্ট সাপ্লিমেন্ট ফর্মুলেশনের জন্য উচ্চতর কাঁচামাল তৈরি করে।

PPI নেটওয়ার্ক বিশ্লেষণ TNF, Akt1, EGFR, STAT3 এবং MAPK1 কে মূল থেরাপিউটিক লক্ষ্য হিসাবে চিহ্নিত করেছে। TNF CP/CPPS-এ প্রদাহজনক ক্যাসকেডের কেন্দ্রীয় চালক হিসাবে কাজ করে, NF-κB এবং MAPK পথগুলিকে সক্রিয় করে IL-1 , IL-6 এবং অন্যান্য প্রদাহজনক মধ্যস্থতাকারীর ব্যাপক নিঃসরণকে ট্রিগার করতে। Akt1 এবং EGFR হল কোষের বিস্তার, পার্থক্য এবং অ্যাপোপটোসিস নিয়ন্ত্রণকারী গুরুত্বপূর্ণ কাইনেস। অত্যধিক EGFR সক্রিয়করণের দমন প্রোস্টেট প্রদাহ এবং টিস্যু ফাইব্রোসিস থেকে মুক্তি দেয়। ক্রনিক প্রোস্টাটাইটিস প্রোস্টেট এপিথেলিয়াল হাইপারপ্লাসিয়া এবং টিস্যু রিমডেলিংকে ট্রিগার করে; ওভারঅ্যাক্টিভেটেড EGFR এবং STAT3 প্রদাহজনক সংকেতকে প্রশস্ত করে এবং দীর্ঘস্থায়ী প্রদাহকে প্রোস্টেট টিউমারিজেনেসিসের সাথে যুক্ত করা সমালোচনামূলক বায়োমার্কারের প্রতিনিধিত্ব করে। এই প্রোটিনগুলিকে লক্ষ্য করে,Cistanche tubulosaবায়োঅ্যাক্টিভগুলি প্রদাহজনক ঝড়কে ব্লক করে এবং কোষের বিস্তার এবং অ্যাপোপটোসিসের মধ্যে ভারসাম্য পুনরুদ্ধার করে।

GO সমৃদ্ধকরণের ফলাফলগুলি প্রকাশ করেছে যে মূল লক্ষ্যগুলি PI3K সংকেত নিয়ন্ত্রণ, অ্যাপোপটোটিক মডুলেশন এবং ব্যাকটেরিয়া লাইপোপলিস্যাকারাইডের প্রতিক্রিয়াগুলিতে অংশগ্রহণ করে, প্রদাহ নিয়ন্ত্রণ এবং কোষের বেঁচে থাকার ভারসাম্যের উপর ফোকাস তুলে ধরে। কেইজিজি সমৃদ্ধকরণ আরও চিহ্নিত মূল পথগুলি: HIF-1 পথটি প্রদাহজনক হাইপোক্সিয়ার অধীনে সক্রিয় হয়, টিস্যু আঘাতকে উন্নীত করার জন্য ভিইজিএফ এবং আইএনওএস এক্সপ্রেশন চালায়; AGE-RAGE পথের সক্রিয়করণ অক্সিডেটিভ স্ট্রেস এবং প্রদাহকে প্ররোচিত করে, দীর্ঘস্থায়ী রোগের অগ্রগতি ত্বরান্বিত করে; সি-টাইপ লেকটিন রিসেপ্টর সিগন্যালিং জীবাণুমুক্ত প্রদাহজনক অবস্থার অধীনে সহজাত ইমিউন প্রতিক্রিয়াগুলিকে সংশোধন করে।

উল্লেখযোগ্যভাবে, প্রোস্টেট ক্যান্সারের পথটি সমৃদ্ধকরণের ফলাফলগুলিতে স্পষ্টভাবে প্রদর্শিত হয়, এটি পরামর্শ দেয়Cistanche tubulosaটিস্যু হাইপারপ্লাসিয়া এবং ফাইব্রোসিস দীর্ঘায়িত CP/CPPS দ্বারা সীমিত হতে পারে। PD-L1/PD-1 ইমিউন চেকপয়েন্ট পাথওয়ের সমৃদ্ধকরণ এছাড়াও টি-সেল ইমিউন প্রতিক্রিয়ার উপর নিয়ন্ত্রক প্রভাব বোঝায়, যা CP/CPPS-এর ক্রমাগত নিম্ন-গ্রেডের প্রদাহ বৈশিষ্ট্যের সাথে মিলে যায়।

আণবিক ডকিং ফলাফল প্রমাণ করেছে যে ইচিনাকোসাইড, অ্যাক্টিওসাইড এবং সিস্টানোসাইড এ Akt1, EGFR, TNF এবং অন্যান্য হাব প্রোটিনের সাথে স্থিতিশীল কমপ্লেক্স গঠন করে। অ্যাক্টিওসাইড Akt1 এর সাথে সবচেয়ে শক্তিশালী আবদ্ধতা প্রদর্শন করেছে, যা PI3K/Akt সিগন্যালিং ক্যাসকেড নিয়ন্ত্রণ করার সম্ভাব্যতা নির্দেশ করে। যদিও TNF-এর প্রতি আবদ্ধ সম্পর্ক তুলনামূলকভাবে মাঝারি ছিল, সমস্ত মান কার্যকর বাঁধাই থ্রেশহোল্ডকে সন্তুষ্ট করেছিল। এই স্ট্রাকচারাল সিমুলেশন ডেটা নেটওয়ার্ক ফার্মাকোলজি দ্বারা উত্পন্ন ভবিষ্যদ্বাণীগুলিকে বৈধ করে এবং এর মধ্যে সরাসরি মিথস্ক্রিয়াগুলির জন্য প্রাথমিক কাঠামোগত প্রমাণ প্রদান করেCistanche tubulosaবায়োঅ্যাকটিভ যৌগ এবং মূল লক্ষ্য প্রোটিন।

সারাংশ

নেটওয়ার্ক ফার্মাকোলজি এবং আণবিক ডকিং ব্যবহার করে, এই গবেষণাটি পদ্ধতিগতভাবে বায়োঅ্যাকটিভ যৌগ, মূল প্রোটিন লক্ষ্য এবং সংকেত পথের ভবিষ্যদ্বাণী করেছে যার মাধ্যমেCistanche tubulosaদীর্ঘস্থায়ী ননব্যাকটেরিয়াল প্রোস্টাটাইটিস উপশম করে। ফলাফলগুলি এর মাল্টি-কম্পোনেন্ট, মাল্টি-টার্গেট এবং মাল্টি-পাথওয়ে ওয়ার্কিং মেকানিজমকে চিত্রিত করে।Cistanche tubulosaTNF, Akt1, EGFR, STAT3 এবং অন্যান্য হাব প্রোটিনের সাথে মিথস্ক্রিয়া করার জন্য প্রাথমিকভাবে ফেনাইলেথানয়েড গ্লাইকোসাইডের (ইচিনাকোসাইড, অ্যাক্টিওসাইড এবং সম্পর্কিত গ্লাইকোসাইড) উপর নির্ভর করে। এটি HIF-1, AGE-RAGE এবং C-টাইপ লেকটিন রিসেপ্টর সিগন্যালিং পাথওয়েগুলিকে প্রদাহ বিরোধী, ইমিউনোমোডুলেটরি এবং অ্যান্টি-অ্যাপোপ্টোটিক প্রভাবগুলি প্রদান করে। এই গবেষণার আণবিক ভিত্তি স্পষ্ট করেCistanche tubulosaপ্রোস্টেট স্বাস্থ্য সহায়তার জন্য, মানসম্মত ভেষজ প্রয়োগের জন্য বৈজ্ঞানিক রেফারেন্স এবং পুরুষদের সুস্থতার জন্য অভিনব প্রাকৃতিক পণ্যের বিকাশ।